Protein–RNA interactions for Protein: P0DJR0

GIMD1, GTPase IMAP family member GIMD1, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIMD1P0DJR0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GIMD1P0DJR0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GIMD1P0DJR0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GIMD1P0DJR0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GIMD1P0DJR0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GIMD1P0DJR0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GIMD1P0DJR0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GIMD1P0DJR0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GIMD1P0DJR0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GIMD1P0DJR0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GIMD1P0DJR0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GIMD1P0DJR0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GIMD1P0DJR0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GIMD1P0DJR0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GIMD1P0DJR0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GIMD1P0DJR0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GIMD1P0DJR0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GIMD1P0DJR0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GIMD1P0DJR0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GIMD1P0DJR0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GIMD1P0DJR0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GIMD1P0DJR0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GIMD1P0DJR0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GIMD1P0DJR0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GIMD1P0DJR0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GIMD1P0DJR0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GIMD1P0DJR0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GIMD1P0DJR0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GIMD1P0DJR0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GIMD1P0DJR0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GIMD1P0DJR0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GIMD1P0DJR0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GIMD1P0DJR0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GIMD1P0DJR0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GIMD1P0DJR0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GIMD1P0DJR0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GIMD1P0DJR0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GIMD1P0DJR0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GIMD1P0DJR0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GIMD1P0DJR0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GIMD1P0DJR0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GIMD1P0DJR0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GIMD1P0DJR0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GIMD1P0DJR0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GIMD1P0DJR0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GIMD1P0DJR0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GIMD1P0DJR0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GIMD1P0DJR0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GIMD1P0DJR0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GIMD1P0DJR0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GIMD1P0DJR0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GIMD1P0DJR0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GIMD1P0DJR0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GIMD1P0DJR0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GIMD1P0DJR0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GIMD1P0DJR0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GIMD1P0DJR0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GIMD1P0DJR0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GIMD1P0DJR0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GIMD1P0DJR0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GIMD1P0DJR0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GIMD1P0DJR0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GIMD1P0DJR0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GIMD1P0DJR0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GIMD1P0DJR0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GIMD1P0DJR0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GIMD1P0DJR0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GIMD1P0DJR0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GIMD1P0DJR0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GIMD1P0DJR0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GIMD1P0DJR0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GIMD1P0DJR0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GIMD1P0DJR0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GIMD1P0DJR0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GIMD1P0DJR0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GIMD1P0DJR0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GIMD1P0DJR0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GIMD1P0DJR0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GIMD1P0DJR0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GIMD1P0DJR0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GIMD1P0DJR0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GIMD1P0DJR0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GIMD1P0DJR0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GIMD1P0DJR0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GIMD1P0DJR0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GIMD1P0DJR0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GIMD1P0DJR0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GIMD1P0DJR0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GIMD1P0DJR0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GIMD1P0DJR0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GIMD1P0DJR0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GIMD1P0DJR0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GIMD1P0DJR0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GIMD1P0DJR0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GIMD1P0DJR0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GIMD1P0DJR0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GIMD1P0DJR0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GIMD1P0DJR0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GIMD1P0DJR0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GIMD1P0DJR0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms