Protein–RNA interactions for Protein: P05107

ITGB2, Integrin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2P05107 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGB2P05107 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGB2P05107 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGB2P05107 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGB2P05107 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGB2P05107 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGB2P05107 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGB2P05107 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGB2P05107 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGB2P05107 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGB2P05107 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGB2P05107 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGB2P05107 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGB2P05107 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGB2P05107 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGB2P05107 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGB2P05107 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB2P05107 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB2P05107 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB2P05107 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB2P05107 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGB2P05107 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB2P05107 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB2P05107 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB2P05107 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB2P05107 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB2P05107 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB2P05107 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB2P05107 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB2P05107 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB2P05107 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB2P05107 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGB2P05107 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGB2P05107 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGB2P05107 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGB2P05107 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGB2P05107 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGB2P05107 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGB2P05107 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGB2P05107 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGB2P05107 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGB2P05107 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGB2P05107 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGB2P05107 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGB2P05107 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGB2P05107 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGB2P05107 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGB2P05107 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGB2P05107 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGB2P05107 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB2P05107 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB2P05107 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB2P05107 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB2P05107 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB2P05107 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB2P05107 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGB2P05107 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGB2P05107 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGB2P05107 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGB2P05107 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGB2P05107 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGB2P05107 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGB2P05107 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGB2P05107 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGB2P05107 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGB2P05107 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGB2P05107 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGB2P05107 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGB2P05107 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ITGB2P05107 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGB2P05107 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGB2P05107 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGB2P05107 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGB2P05107 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGB2P05107 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGB2P05107 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGB2P05107 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGB2P05107 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGB2P05107 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGB2P05107 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGB2P05107 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGB2P05107 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGB2P05107 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGB2P05107 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB2P05107 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB2P05107 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB2P05107 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB2P05107 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB2P05107 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGB2P05107 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB2P05107 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB2P05107 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB2P05107 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB2P05107 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB2P05107 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB2P05107 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB2P05107 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB2P05107 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB2P05107 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGB2P05107 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms