Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SEMA4FO95754 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA4FO95754 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA4FO95754 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA4FO95754 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA4FO95754 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA4FO95754 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA4FO95754 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA4FO95754 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA4FO95754 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA4FO95754 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA4FO95754 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA4FO95754 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA4FO95754 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA4FO95754 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA4FO95754 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA4FO95754 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA4FO95754 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA4FO95754 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA4FO95754 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA4FO95754 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA4FO95754 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA4FO95754 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA4FO95754 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA4FO95754 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA4FO95754 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA4FO95754 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA4FO95754 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA4FO95754 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA4FO95754 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA4FO95754 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA4FO95754 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA4FO95754 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA4FO95754 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA4FO95754 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA4FO95754 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA4FO95754 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA4FO95754 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA4FO95754 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA4FO95754 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA4FO95754 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA4FO95754 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA4FO95754 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA4FO95754 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA4FO95754 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA4FO95754 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA4FO95754 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA4FO95754 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA4FO95754 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA4FO95754 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA4FO95754 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA4FO95754 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA4FO95754 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA4FO95754 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA4FO95754 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA4FO95754 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA4FO95754 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA4FO95754 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA4FO95754 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA4FO95754 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA4FO95754 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA4FO95754 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA4FO95754 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA4FO95754 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA4FO95754 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA4FO95754 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA4FO95754 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA4FO95754 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA4FO95754 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SEMA4FO95754 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEMA4FO95754 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA4FO95754 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA4FO95754 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA4FO95754 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA4FO95754 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA4FO95754 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA4FO95754 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA4FO95754 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA4FO95754 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA4FO95754 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA4FO95754 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA4FO95754 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA4FO95754 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA4FO95754 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA4FO95754 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA4FO95754 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA4FO95754 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA4FO95754 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA4FO95754 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA4FO95754 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA4FO95754 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA4FO95754 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA4FO95754 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA4FO95754 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA4FO95754 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA4FO95754 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA4FO95754 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA4FO95754 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SEMA4FO95754 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SEMA4FO95754 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms