Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 TCF7L2-205ENST00000355717 1979 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.561e-6■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 TCF7L2-221ENST00000545257 2160 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.671e-6■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 TCF7L2-216ENST00000534894 3778 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.961e-6■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 TCF7L2-209ENST00000369395 1541 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.961e-6■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 TCF7L2-220ENST00000543371 4037 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.031e-6■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 TCF7L2-218ENST00000538897 4000 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.051e-6■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.251e-6■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.271e-6■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.311e-6■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.341e-6■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.371e-6■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.372e-8■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.17e-7■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 NCDN-203ENST00000373253 3677 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.077e-7■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 NCDN-202ENST00000373243 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.137e-7■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 CTNND1-235ENST00000533189 498 ntTSL 312.38□□□□□ -0.435e-6■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.455e-6■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 AP001931.1-201ENST00000531074 580 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.475e-6■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 CTNND1-210ENST00000524630 6553 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.515e-6■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 CTNND1-213ENST00000526357 5994 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.675e-6■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 CTNND1-205ENST00000399050 6313 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.795e-6■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 CTNND1-201ENST00000358694 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.795e-6■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 CTNND1-208ENST00000428599 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.85e-6■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 CTNND1-237ENST00000534579 6024 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.845e-6■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 CTNND1-202ENST00000361332 6295 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.855e-6■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 CTNND1-232ENST00000532649 6026 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.865e-6■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 CTNND1-219ENST00000528621 5907 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.885e-6■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 CTNND1-221ENST00000529873 5931 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.885e-6■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 CTNND1-227ENST00000530748 5925 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.885e-6■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 CTNND1-215ENST00000526938 3489 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.885e-6■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 CTNND1-231ENST00000532463 5749 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.885e-6■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 CTNND1-206ENST00000415361 5832 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.915e-6■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 CTNND1-225ENST00000530094 5814 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.915e-6■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 CTNND1-234ENST00000532844 6012 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.915e-6■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 CTNND1-203ENST00000361391 6232 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.925e-6■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 CTNND1-204ENST00000361796 6226 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.925e-6■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 CTNND1-220ENST00000529526 6099 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.925e-6■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 CTNND1-222ENST00000529919 4780 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.925e-6■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 CTNND1-223ENST00000529986 5727 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.965e-6■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 CTNND1-207ENST00000426142 5800 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.985e-6■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 CTNND1-233ENST00000532787 5751 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.015e-6■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 CTNND1-216ENST00000527467 5071 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.055e-6■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 CTNND1-229ENST00000531014 5053 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.055e-6■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 CTNND1-230ENST00000532245 5655 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.065e-6■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 CTNND1-218ENST00000528232 5745 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.085e-6■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.135e-6■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.155e-6■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.155e-6■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 CTNND1-209ENST00000524579 505 ntTSL 47.36□□□□□ -1.235e-6■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 ATXN2-217ENST00000548492 556 ntTSL 46.75□□□□□ -1.332e-7■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 BCAR1-214ENST00000563700 576 ntTSL 415.64■□□□□ 0.098e-7■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 BCAR1-219ENST00000567215 581 ntTSL 415.24■□□□□ 0.038e-7■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 AC009078.3-201ENST00000624205 4084 ntBASIC13.32□□□□□ -0.288e-7■■■□□ 17.8
GTF2F1P35269 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.341e-7■■■□□ 17.7
GTF2F1P35269 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.271e-7■■■□□ 17.7
GTF2F1P35269 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.271e-7■■■□□ 17.7
GTF2F1P35269 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.211e-7■■■□□ 17.7
GTF2F1P35269 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.191e-7■■■□□ 17.7
GTF2F1P35269 MLXIPL-202ENST00000345114 3079 ntTSL 1 (best)15.41■□□□□ 0.061e-7■■■□□ 17.7
GTF2F1P35269 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.884e-7■■■□□ 17.7
GTF2F1P35269 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.614e-7■■■□□ 17.7
GTF2F1P35269 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.438e-10■■■□□ 17.7
GTF2F1P35269 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.148e-10■■■□□ 17.7
GTF2F1P35269 MZF1-205ENST00000596039 657 ntTSL 218.93■□□□□ 0.628e-10■■■□□ 17.7
GTF2F1P35269 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.478e-10■■■□□ 17.7
GTF2F1P35269 CUX1-217ENST00000558836 2965 ntTSL 511.99□□□□□ -0.492e-7■■■□□ 17.7
GTF2F1P35269 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.193e-7■■■□□ 17.7
GTF2F1P35269 BCAR1-216ENST00000564170 552 ntTSL 423.11■■□□□ 1.299e-7■■■□□ 17.7
GTF2F1P35269 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.771e-6■■■□□ 17.7
GTF2F1P35269 NAB1-201ENST00000337386 4358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.177e-7■■■□□ 17.7
GTF2F1P35269 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.927e-8■■■□□ 17.7
GTF2F1P35269 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.277e-8■■■□□ 17.7
GTF2F1P35269 GDPD5-209ENST00000529721 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.157e-8■■■□□ 17.7
GTF2F1P35269 GDPD5-204ENST00000526177 4150 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.027e-8■■■□□ 17.7
GTF2F1P35269 GDPD5-206ENST00000527820 3211 ntTSL 1 (best)15.13■□□□□ 0.017e-8■■■□□ 17.7
GTF2F1P35269 GDPD5-202ENST00000443276 3106 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.017e-8■■■□□ 17.7
GTF2F1P35269 GDPD5-205ENST00000527322 1000 ntTSL 1 (best)12.45□□□□□ -0.427e-8■■■□□ 17.7
GTF2F1P35269 C22orf34-206ENST00000444628 453 ntTSL 512.52□□□□□ -0.412e-7■■■□□ 17.7
GTF2F1P35269 YWHAG-201ENST00000307630 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.444e-38■■■□□ 17.7
GTF2F1P35269 ERBB3-219ENST00000551242 2755 ntTSL 1 (best)14.89□□□□□ -0.033e-8■■■□□ 17.7
GTF2F1P35269 ERBB3-217ENST00000551085 4382 ntTSL 213.78□□□□□ -0.23e-8■■■□□ 17.7
GTF2F1P35269 ERBB3-216ENST00000550869 572 ntTSL 413.05□□□□□ -0.323e-8■■■□□ 17.7
GTF2F1P35269 ERBB3-208ENST00000549205 971 ntTSL 512.75□□□□□ -0.373e-8■■■□□ 17.7
GTF2F1P35269 ERBB3-201ENST00000267101 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.413e-8■■■□□ 17.7
GTF2F1P35269 ERBB3-214ENST00000550070 2729 ntTSL 1 (best)12.24□□□□□ -0.453e-8■■■□□ 17.7
GTF2F1P35269 ERBB3-203ENST00000415288 4353 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.563e-8■■■□□ 17.7
GTF2F1P35269 ERBB3-211ENST00000549644 306 ntTSL 39.59□□□□□ -0.873e-8■■■□□ 17.7
GTF2F1P35269 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.861e-6■■■□□ 17.7
GTF2F1P35269 PLOD1-204ENST00000449038 762 ntTSL 518.57■□□□□ 0.562e-6■■■□□ 17.6
GTF2F1P35269 PLOD1-203ENST00000429000 886 ntTSL 517.47■□□□□ 0.392e-6■■■□□ 17.6
GTF2F1P35269 PLOD1-208ENST00000485046 991 ntTSL 515.87■□□□□ 0.132e-6■■■□□ 17.6
GTF2F1P35269 PLOD1-202ENST00000358133 819 ntTSL 315.85■□□□□ 0.132e-6■■■□□ 17.6
GTF2F1P35269 TSC22D4-205ENST00000493217 2060 ntTSL 1 (best)21.75■■□□□ 1.075e-8■■■□□ 17.6
GTF2F1P35269 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.845e-8■■■□□ 17.6
GTF2F1P35269 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.65e-8■■■□□ 17.6
GTF2F1P35269 EP400NL-203ENST00000392352 2172 ntTSL 228.31■■■□□ 2.123e-7■■■□□ 17.6
GTF2F1P35269 EP400NL-205ENST00000443539 1756 ntTSL 224.51■■□□□ 1.513e-7■■■□□ 17.6
GTF2F1P35269 EP400NL-204ENST00000407361 945 ntTSL 323.73■■□□□ 1.393e-7■■■□□ 17.6
GTF2F1P35269 EP400NL-202ENST00000389560 1726 ntTSL 1 (best)23.33■■□□□ 1.333e-7■■■□□ 17.6
GTF2F1P35269 EP400NL-211ENST00000539205 583 ntTSL 322.16■■□□□ 1.143e-7■■■□□ 17.6
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 255.5 ms