Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CAVIN3Q969G5 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms