Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CAVIN3Q969G5 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CAVIN3Q969G5 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CAVIN3Q969G5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CAVIN3Q969G5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CAVIN3Q969G5 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CAVIN3Q969G5 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CAVIN3Q969G5 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
CAVIN3Q969G5 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CAVIN3Q969G5 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CAVIN3Q969G5 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
CAVIN3Q969G5 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CAVIN3Q969G5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CAVIN3Q969G5 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CAVIN3Q969G5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CAVIN3Q969G5 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CAVIN3Q969G5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CAVIN3Q969G5 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
CAVIN3Q969G5 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CAVIN3Q969G5 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CAVIN3Q969G5 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CAVIN3Q969G5 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CAVIN3Q969G5 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CAVIN3Q969G5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CAVIN3Q969G5 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CAVIN3Q969G5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CAVIN3Q969G5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CAVIN3Q969G5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CAVIN3Q969G5 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
CAVIN3Q969G5 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
CAVIN3Q969G5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
CAVIN3Q969G5 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CAVIN3Q969G5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CAVIN3Q969G5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CAVIN3Q969G5 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
CAVIN3Q969G5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CAVIN3Q969G5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CAVIN3Q969G5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CAVIN3Q969G5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CAVIN3Q969G5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CAVIN3Q969G5 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CAVIN3Q969G5 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CAVIN3Q969G5 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CAVIN3Q969G5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CAVIN3Q969G5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
CAVIN3Q969G5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CAVIN3Q969G5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CAVIN3Q969G5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CAVIN3Q969G5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CAVIN3Q969G5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CAVIN3Q969G5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CAVIN3Q969G5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CAVIN3Q969G5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CAVIN3Q969G5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CAVIN3Q969G5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CAVIN3Q969G5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CAVIN3Q969G5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CAVIN3Q969G5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CAVIN3Q969G5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CAVIN3Q969G5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CAVIN3Q969G5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CAVIN3Q969G5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CAVIN3Q969G5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CAVIN3Q969G5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CAVIN3Q969G5 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CAVIN3Q969G5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CAVIN3Q969G5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CAVIN3Q969G5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CAVIN3Q969G5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CAVIN3Q969G5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CAVIN3Q969G5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CAVIN3Q969G5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CAVIN3Q969G5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CAVIN3Q969G5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CAVIN3Q969G5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CAVIN3Q969G5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CAVIN3Q969G5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CAVIN3Q969G5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CAVIN3Q969G5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CAVIN3Q969G5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CAVIN3Q969G5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CAVIN3Q969G5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CAVIN3Q969G5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CAVIN3Q969G5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CAVIN3Q969G5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CAVIN3Q969G5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CAVIN3Q969G5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CAVIN3Q969G5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CAVIN3Q969G5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CAVIN3Q969G5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CAVIN3Q969G5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CAVIN3Q969G5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CAVIN3Q969G5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CAVIN3Q969G5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CAVIN3Q969G5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CAVIN3Q969G5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CAVIN3Q969G5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CAVIN3Q969G5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
CAVIN3Q969G5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CAVIN3Q969G5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms