Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.112e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 TRAPPC2L-202ENST00000561840 558 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.132e-7■■■□□ 16
PABPC4Q13310 TRAPPC2L-211ENST00000565504 3102 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.172e-7■■■□□ 16
PABPC4Q13310 TRAPPC2L-214ENST00000568583 801 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.172e-7■■■□□ 16
PABPC4Q13310 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.12e-7■■■□□ 16
PABPC4Q13310 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.143e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 GMPPA-211ENST00000481170 4942 ntTSL 214.17□□□□□ -0.143e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 COX7A2L-204ENST00000463055 540 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.883e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.232e-9■■■□□ 16
PABPC4Q13310 ZFAND1-201ENST00000220669 1798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.042e-7■■■□□ 16
PABPC4Q13310 ZFAND1-221ENST00000523096 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.042e-7■■■□□ 16
PABPC4Q13310 ZFAND1-219ENST00000522520 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.292e-7■■■□□ 16
PABPC4Q13310 ZFAND1-224ENST00000524305 2719 ntTSL 23.06□□□□□ -1.922e-7■■■□□ 16
PABPC4Q13310 HDGF-205ENST00000469145 844 ntTSL 223.12■■□□□ 1.299e-8■■■□□ 16
PABPC4Q13310 HDGF-206ENST00000471377 592 ntTSL 310.88□□□□□ -0.679e-8■■■□□ 16
PABPC4Q13310 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.21e-7■■■□□ 16
PABPC4Q13310 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81e-7■■■□□ 16
PABPC4Q13310 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.661e-7■■■□□ 16
PABPC4Q13310 PTRH1-207ENST00000456267 645 ntTSL 322.81■■□□□ 1.241e-7■■■□□ 16
PABPC4Q13310 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.981e-7■■■□□ 16
PABPC4Q13310 NDUFS8-208ENST00000526446 814 ntTSL 521.22■□□□□ 0.995e-7■■■□□ 16
PABPC4Q13310 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.256e-9■■■□□ 16
PABPC4Q13310 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.132e-7■■■□□ 16
PABPC4Q13310 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.463e-6■■■□□ 16
PABPC4Q13310 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.591e-18■■■□□ 16
PABPC4Q13310 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.325e-7■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.295e-7■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.295e-7■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 C20orf24-206ENST00000492721 1044 ntTSL 226.61■■□□□ 1.855e-7■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 C20orf24-204ENST00000483815 1170 ntTSL 1 (best)22.15■■□□□ 1.145e-7■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 TSC2-226ENST00000569930 2621 ntTSL 220.06■□□□□ 0.82e-6■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 TSC2-225ENST00000569110 1687 ntTSL 518.76■□□□□ 0.592e-6■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.532e-6■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.512e-6■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.462e-6■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.432e-6■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.392e-6■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.252e-6■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 TSC2-206ENST00000439117 5073 ntTSL 1 (best)16.27■□□□□ 0.192e-6■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 TSC2-216ENST00000497886 3248 ntTSL 215□□□□□ -0.012e-6■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.327e-7■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.447e-7■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 FAM83A-208ENST00000536633 3701 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.497e-7■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.662e-8■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.562e-8■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.512e-8■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.979e-15■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.049e-15■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.459e-15■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.234e-10■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 DDAH2-218ENST00000480913 937 ntTSL 522.84■■□□□ 1.254e-10■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 DDAH2-217ENST00000469963 1682 ntTSL 522.77■■□□□ 1.244e-10■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.224e-10■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 DDAH2-216ENST00000437288 724 ntTSL 514.89□□□□□ -0.034e-10■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 DDAH2-219ENST00000483792 898 ntTSL 514.84□□□□□ -0.034e-10■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 NAA10-210ENST00000467451 743 ntTSL 222.62■■□□□ 1.215e-14■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.79e-8■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.79e-8■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.49e-8■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.399e-8■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.399e-8■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 SUMO1-206ENST00000409368 1187 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.089e-8■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 SUMO1-202ENST00000392245 1071 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.049e-8■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.419e-8■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 GCN1-201ENST00000300648 8675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.459e-7■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 PPOX-218ENST00000541818 1193 ntTSL 213.57□□□□□ -0.242e-6■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 PPOX-216ENST00000537829 728 ntTSL 212.99□□□□□ -0.332e-6■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.83e-8■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.423e-8■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.583e-8■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.161e-6■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.471e-6■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.441e-6■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 RNASET2-204ENST00000421787 1924 ntTSL 223.05■■□□□ 1.281e-6■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 RNASET2-201ENST00000028008 1220 ntTSL 521.64■■□□□ 1.051e-6■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 RNASET2-207ENST00000478180 963 ntTSL 521.5■■□□□ 1.031e-6■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.771e-6■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.581e-6■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 RNASET2-212ENST00000510083 2280 ntTSL 217.58■□□□□ 0.41e-6■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.331e-6■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.081e-6■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 TJP2-201ENST00000348208 4058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.21e-6■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.521e-6■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 RHOC-210ENST00000425265 866 ntTSL 323.07■■□□□ 1.281e-11■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.515e-8■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.255e-8■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.215e-8■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.075e-8■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 SEPT9-203ENST00000427177 3821 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.125e-8■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 SEPT9-207ENST00000449803 3996 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.165e-8■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 SEPT9-201ENST00000329047 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.275e-8■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 SEPT9-206ENST00000431235 4004 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.35e-8■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 SEPT9-204ENST00000427180 3635 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.35e-8■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 SEPT9-205ENST00000427674 3937 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.325e-8■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.228e-9■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 HGS-210ENST00000573320 547 ntTSL 318.2■□□□□ 0.52e-6■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 HGS-211ENST00000573949 461 ntTSL 515.8■□□□□ 0.122e-6■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.524e-10■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 14e-10■■■□□ 15.9
PABPC4Q13310 COX6C-211ENST00000606245 646 nt11.25□□□□□ -0.614e-10■■■□□ 15.9
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