RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335223.5

PTRH1-201, Transcript of peptidyl-tRNA hydrolase 1 homolog, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTRH1, Length 759 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTRH1-201ENST00000335223 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.07■■■■■ 5.93
PTRH1-201ENST00000335223 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.53■■■■■ 5.04
PTRH1-201ENST00000335223 ABCC9O60706 1549 aa45.52■■■■■ 4.88
PTRH1-201ENST00000335223 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.81■■■■■ 4.6
PTRH1-201ENST00000335223 NACADO15069 1562 aa43.72■■■■■ 4.59
PTRH1-201ENST00000335223 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.45■■■■■ 4.55
PTRH1-201ENST00000335223 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.37■■■■■ 4.53
PTRH1-201ENST00000335223 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.32■■■■■ 4.53
PTRH1-201ENST00000335223 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.17■■■■■ 4.5
PTRH1-201ENST00000335223 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.9■■■■■ 4.46
PTRH1-201ENST00000335223 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.49■■■■■ 4.39
PTRH1-201ENST00000335223 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.4■■■■■ 4.38
PTRH1-201ENST00000335223 SCRIBQ14160 1630 aa42.29■■■■■ 4.36
PTRH1-201ENST00000335223 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.13■■■■■ 4.34
PTRH1-201ENST00000335223 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.9■■■■■ 4.3
PTRH1-201ENST00000335223 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.38■■■■■ 4.22
PTRH1-201ENST00000335223 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.25■■■■■ 4.19
PTRH1-201ENST00000335223 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.96■■■■■ 4.15
PTRH1-201ENST00000335223 SMARCA4P51532 1647 aa40.49■■■■■ 4.07
PTRH1-201ENST00000335223 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.4■■■■■ 4.06
PTRH1-201ENST00000335223 NCAPD3P42695 1498 aa40.3■■■■■ 4.04
PTRH1-201ENST00000335223 SMARCA2P51531 1590 aa40.27■■■■■ 4.04
PTRH1-201ENST00000335223 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.26■■■■■ 4.04
PTRH1-201ENST00000335223 HMGXB3Q12766 1538 aa40.16■■■■■ 4.02
PTRH1-201ENST00000335223 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.15■■■■■ 4.02
PTRH1-201ENST00000335223 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.1■■■■■ 4.01
PTRH1-201ENST00000335223 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.93■■■■□ 3.98
PTRH1-201ENST00000335223 WIZO95785 1651 aa39.67■■■■□ 3.94
PTRH1-201ENST00000335223 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.54■■■■□ 3.92
PTRH1-201ENST00000335223 NESP48681 1621 aa39.34■■■■□ 3.89
PTRH1-201ENST00000335223 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.33■■■■□ 3.89
PTRH1-201ENST00000335223 ERCC6Q03468 1493 aa39.28■■■■□ 3.88
PTRH1-201ENST00000335223 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.28■■■■□ 3.88
PTRH1-201ENST00000335223 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.07■■■■□ 3.84
PTRH1-201ENST00000335223 CUX2O14529 1486 aa39.03■■■■□ 3.84
PTRH1-201ENST00000335223 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.98■■■■□ 3.83
PTRH1-201ENST00000335223 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.98■■■■□ 3.83
PTRH1-201ENST00000335223 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.92■■■■□ 3.82
PTRH1-201ENST00000335223 CFTRP13569 1480 aa38.84■■■■□ 3.81
PTRH1-201ENST00000335223 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.73■■■■□ 3.79
PTRH1-201ENST00000335223 PRDM2Q13029 1718 aa38.69■■■■□ 3.78
PTRH1-201ENST00000335223 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.64■■■■□ 3.78
PTRH1-201ENST00000335223 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.64■■■■□ 3.78
PTRH1-201ENST00000335223 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.63■■■■□ 3.77
PTRH1-201ENST00000335223 WDR62O43379 1518 aa38.56■■■■□ 3.76
PTRH1-201ENST00000335223 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.28■■■■□ 3.72
PTRH1-201ENST00000335223 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.19■■■■□ 3.7
PTRH1-201ENST00000335223 ABCC8Q09428 1581 aa38.03■■■■□ 3.68
PTRH1-201ENST00000335223 TOPBP1Q92547 1522 aa38.02■■■■□ 3.68
PTRH1-201ENST00000335223 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38■■■■□ 3.67
PTRH1-201ENST00000335223 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa37.96■■■■□ 3.67
PTRH1-201ENST00000335223 IFT140Q96RY7 1462 aa37.84■■■■□ 3.65
PTRH1-201ENST00000335223 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.67■■■■□ 3.62
PTRH1-201ENST00000335223 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.67■■■■□ 3.62
PTRH1-201ENST00000335223 CUX1P39880 1505 aa37.64■■■■□ 3.62
PTRH1-201ENST00000335223 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.63■■■■□ 3.61
PTRH1-201ENST00000335223 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.57■■■■□ 3.6
PTRH1-201ENST00000335223 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.54■■■■□ 3.6
PTRH1-201ENST00000335223 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.45■■■■□ 3.59
PTRH1-201ENST00000335223 SOGA1O94964 1423 aa37.44■■■■□ 3.58
PTRH1-201ENST00000335223 WDR97A6NE52 1622 aa37.44■■■■□ 3.58
PTRH1-201ENST00000335223 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.35■■■■□ 3.57
PTRH1-201ENST00000335223 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.35■■■■□ 3.57
PTRH1-201ENST00000335223 TOP2BQ02880 1626 aa37.32■■■■□ 3.56
PTRH1-201ENST00000335223 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.29■■■■□ 3.56
PTRH1-201ENST00000335223 SYNJ1O43426 1573 aa37.25■■■■□ 3.55
PTRH1-201ENST00000335223 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.24■■■■□ 3.55
PTRH1-201ENST00000335223 OSCARQ8IYS5 282 aa37.23■■■■□ 3.55
PTRH1-201ENST00000335223 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.2■■■■□ 3.55
PTRH1-201ENST00000335223 CHD1O14646 1710 aa37.16■■■■□ 3.54
PTRH1-201ENST00000335223 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.12■■■■□ 3.53
PTRH1-201ENST00000335223 PBRM1Q86U86 1689 aa37.11■■■■□ 3.53
PTRH1-201ENST00000335223 GRIN2BQ13224 1484 aa37.1■■■■□ 3.53
PTRH1-201ENST00000335223 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.07■■■■□ 3.52
PTRH1-201ENST00000335223 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.07■■■■□ 3.52
PTRH1-201ENST00000335223 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.06■■■■□ 3.52
PTRH1-201ENST00000335223 SYNJ2O15056 1496 aa36.9■■■■□ 3.5
PTRH1-201ENST00000335223 FBLN2P98095 1184 aa36.85■■■■□ 3.49
PTRH1-201ENST00000335223 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.78■■■■□ 3.48
PTRH1-201ENST00000335223 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.78■■■■□ 3.48
PTRH1-201ENST00000335223 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.78■■■■□ 3.48
PTRH1-201ENST00000335223 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.78■■■■□ 3.48
PTRH1-201ENST00000335223 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.77■■■■□ 3.48
PTRH1-201ENST00000335223 ADAMTS12P58397 1594 aa36.77■■■■□ 3.48
PTRH1-201ENST00000335223 ARHGEF11O15085 1522 aa36.74■■■■□ 3.47
PTRH1-201ENST00000335223 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.74■■■■□ 3.47
PTRH1-201ENST00000335223 GRIN2AQ12879 1464 aa36.63■■■■□ 3.45
PTRH1-201ENST00000335223 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.63■■■■□ 3.45
PTRH1-201ENST00000335223 KIF27Q86VH2 1401 aa36.53■■■■□ 3.44
PTRH1-201ENST00000335223 TRIM41Q8WV44 630 aa36.52■■■■□ 3.44
PTRH1-201ENST00000335223 NUP160Q12769 1436 aa36.5■■■■□ 3.43
PTRH1-201ENST00000335223 CEP170Q5SW79 1584 aa36.48■■■■□ 3.43
PTRH1-201ENST00000335223 CUL7Q14999 1698 aa36.44■■■■□ 3.42
PTRH1-201ENST00000335223 ARAP1Q96P48 1450 aa36.42■■■■□ 3.42
PTRH1-201ENST00000335223 IGF1RP08069 1367 aa36.37■■■■□ 3.41
PTRH1-201ENST00000335223 SHROOM2Q13796 1616 aa36.31■■■■□ 3.4
PTRH1-201ENST00000335223 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.25■■■■□ 3.39
PTRH1-201ENST00000335223 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.24■■■■□ 3.39
PTRH1-201ENST00000335223 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.15■■■■□ 3.38
PTRH1-201ENST00000335223 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.14■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms