Protein–RNA interactions for Protein: Q5SR53

PIK3CD-AS1, Putative uncharacterized protein PIK3CD-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PIK3CD-AS1Q5SR53 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms