Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 SH3RF2-206ENST00000511217 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.892e-7■■■■■ 31.7
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PRPF8Q6P2Q9 MIB1-204ENST00000578646 3306 ntTSL 28.98□□□□□ -0.978e-7■■■■■ 31.7
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PRPF8Q6P2Q9 SLC5A6-217ENST00000488743 3174 ntTSL 28.65□□□□□ -1.033e-8■■■■■ 31.7
PRPF8Q6P2Q9 SLC5A6-201ENST00000310574 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.053e-8■■■■■ 31.7
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PRPF8Q6P2Q9 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.122e-6■■■■■ 31.7
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PRPF8Q6P2Q9 IPO7-204ENST00000530037 347 ntTSL 2-0.4□□□□□ -2.472e-8■■■■■ 31.6
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PRPF8Q6P2Q9 DPAGT1-216ENST00000638850 1152 ntTSL 55.56□□□□□ -1.526e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 DPAGT1-215ENST00000636404 700 ntTSL 53.38□□□□□ -1.876e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.852e-6■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.362e-6■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.647e-10■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.367e-10■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.18e-16■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 C16orf59-203ENST00000562253 930 ntTSL 221.5■■□□□ 1.035e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 PRKD2-207ENST00000597088 855 ntTSL 220.39■□□□□ 0.862e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 ADARB1-207ENST00000460734 2523 ntTSL 1 (best)19.59■□□□□ 0.738e-16■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 ZNF706-215ENST00000523922 493 ntTSL 319.56■□□□□ 0.726e-19■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 PCSK7-203ENST00000525027 1312 ntTSL 418.49■□□□□ 0.552e-8■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 SARAF-210ENST00000522055 582 ntTSL 318.12■□□□□ 0.492e-8■■■■■ 31.6
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PRPF8Q6P2Q9 ADARB1-212ENST00000496664 5033 ntTSL 1 (best)17.92■□□□□ 0.468e-16■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.468e-16■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 ADARB1-211ENST00000492414 4913 ntTSL 1 (best)17.41■□□□□ 0.388e-16■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 KMT5B-207ENST00000427752 2475 ntTSL 217.14■□□□□ 0.331e-7■■■■■ 31.6
PRPF8Q6P2Q9 C15orf41-213ENST00000567573 665 ntTSL 516.93■□□□□ 0.32e-8■■■■■ 31.6
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