RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454825.1

REXO4-204, Transcript of REX4 homolog, 3'-5' exonuclease, humanhuman

TSL 3

Gene REXO4, Length 833 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO4-204ENST00000454825 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.73■■■■■ 7.31
REXO4-204ENST00000454825 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa54.23■■■■■ 6.27
REXO4-204ENST00000454825 ABCC9O60706 1549 aa53.6■■■■■ 6.17
REXO4-204ENST00000454825 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.28■■■■■ 5.8
REXO4-204ENST00000454825 NACADO15069 1562 aa51.09■■■■■ 5.77
REXO4-204ENST00000454825 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.92■■■■■ 5.74
REXO4-204ENST00000454825 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.58■■■■■ 5.69
REXO4-204ENST00000454825 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.47■■■■■ 5.67
REXO4-204ENST00000454825 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.27■■■■■ 5.64
REXO4-204ENST00000454825 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.18■■■■■ 5.62
REXO4-204ENST00000454825 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.99■■■■■ 5.59
REXO4-204ENST00000454825 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.83■■■■■ 5.57
REXO4-204ENST00000454825 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.74■■■■■ 5.55
REXO4-204ENST00000454825 SCRIBQ14160 1630 aa49.47■■■■■ 5.51
REXO4-204ENST00000454825 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.12■■■■■ 5.45
REXO4-204ENST00000454825 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.51■■■■■ 5.36
REXO4-204ENST00000454825 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.47■■■■■ 5.35
REXO4-204ENST00000454825 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.19■■■■■ 5.31
REXO4-204ENST00000454825 SMARCA4P51532 1647 aa47.26■■■■■ 5.16
REXO4-204ENST00000454825 NCAPD3P42695 1498 aa47.15■■■■■ 5.14
REXO4-204ENST00000454825 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.11■■■■■ 5.13
REXO4-204ENST00000454825 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.07■■■■■ 5.13
REXO4-204ENST00000454825 SMARCA2P51531 1590 aa46.99■■■■■ 5.11
REXO4-204ENST00000454825 HMGXB3Q12766 1538 aa46.87■■■■■ 5.09
REXO4-204ENST00000454825 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.83■■■■■ 5.09
REXO4-204ENST00000454825 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.78■■■■■ 5.08
REXO4-204ENST00000454825 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.68■■■■■ 5.06
REXO4-204ENST00000454825 WIZO95785 1651 aa46.33■■■■■ 5.01
REXO4-204ENST00000454825 NESP48681 1621 aa46.26■■■■■ 5
REXO4-204ENST00000454825 ERCC6Q03468 1493 aa46.18■■■■■ 4.98
REXO4-204ENST00000454825 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.07■■■■■ 4.97
REXO4-204ENST00000454825 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46■■■■■ 4.95
REXO4-204ENST00000454825 CUX2O14529 1486 aa45.88■■■■■ 4.94
REXO4-204ENST00000454825 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.73■■■■■ 4.91
REXO4-204ENST00000454825 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.73■■■■■ 4.91
REXO4-204ENST00000454825 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.72■■■■■ 4.91
REXO4-204ENST00000454825 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.67■■■■■ 4.9
REXO4-204ENST00000454825 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.66■■■■■ 4.9
REXO4-204ENST00000454825 CFTRP13569 1480 aa45.37■■■■■ 4.85
REXO4-204ENST00000454825 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.26■■■■■ 4.84
REXO4-204ENST00000454825 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.23■■■■■ 4.83
REXO4-204ENST00000454825 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.22■■■■■ 4.83
REXO4-204ENST00000454825 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.21■■■■■ 4.83
REXO4-204ENST00000454825 WDR62O43379 1518 aa45.16■■■■■ 4.82
REXO4-204ENST00000454825 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.13■■■■■ 4.82
REXO4-204ENST00000454825 PRDM2Q13029 1718 aa45.06■■■■■ 4.8
REXO4-204ENST00000454825 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.85■■■■■ 4.77
REXO4-204ENST00000454825 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP44.48■■■■■ 4.71
REXO4-204ENST00000454825 TOPBP1Q92547 1522 aa44.47■■■■■ 4.71
REXO4-204ENST00000454825 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.36■■■■■ 4.69
REXO4-204ENST00000454825 ABCC8Q09428 1581 aa44.35■■■■■ 4.69
REXO4-204ENST00000454825 IFT140Q96RY7 1462 aa44.27■■■■■ 4.68
REXO4-204ENST00000454825 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.2■■■■■ 4.67
REXO4-204ENST00000454825 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.06■■■■■ 4.64
REXO4-204ENST00000454825 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.05■■■■■ 4.64
REXO4-204ENST00000454825 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.99■■■■■ 4.63
REXO4-204ENST00000454825 CUX1P39880 1505 aa43.96■■■■■ 4.63
REXO4-204ENST00000454825 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.89■■■■■ 4.62
REXO4-204ENST00000454825 OSCARQ8IYS5 282 aa43.88■■■■■ 4.62
REXO4-204ENST00000454825 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.87■■■■■ 4.61
REXO4-204ENST00000454825 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.86■■■■■ 4.613e-6■■■■□ 22.7
REXO4-204ENST00000454825 SOGA1O94964 1423 aa43.83■■■■■ 4.61
REXO4-204ENST00000454825 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.68■■■■■ 4.58
REXO4-204ENST00000454825 WDR97A6NE52 1622 aa43.59■■■■■ 4.57
REXO4-204ENST00000454825 CHD1O14646 1710 aa43.59■■■■■ 4.57
REXO4-204ENST00000454825 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.44■■■■■ 4.54
REXO4-204ENST00000454825 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.43■■■■■ 4.54
REXO4-204ENST00000454825 SYNJ1O43426 1573 aa43.42■■■■■ 4.54
REXO4-204ENST00000454825 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.42■■■■■ 4.54
REXO4-204ENST00000454825 TOP2BQ02880 1626 aa43.42■■■■■ 4.54
REXO4-204ENST00000454825 TRIM41Q8WV44 630 aa43.42■■■■■ 4.54
REXO4-204ENST00000454825 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.4■■■■■ 4.54
REXO4-204ENST00000454825 FBLN2P98095 1184 aa43.38■■■■■ 4.53
REXO4-204ENST00000454825 GRIN2BQ13224 1484 aa43.38■■■■■ 4.53
REXO4-204ENST00000454825 PBRM1Q86U86 1689 aa43.33■■■■■ 4.53
REXO4-204ENST00000454825 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.33■■■■■ 4.53
REXO4-204ENST00000454825 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.33■■■■■ 4.53
REXO4-204ENST00000454825 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.33■■■■■ 4.53
REXO4-204ENST00000454825 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.32■■■■■ 4.53
REXO4-204ENST00000454825 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.32■■■■■ 4.53
REXO4-204ENST00000454825 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.32■■■■■ 4.52
REXO4-204ENST00000454825 ARHGEF11O15085 1522 aa43.22■■■■■ 4.51
REXO4-204ENST00000454825 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.17■■■■■ 4.5
REXO4-204ENST00000454825 SYNJ2O15056 1496 aa43.17■■■■■ 4.5
REXO4-204ENST00000454825 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.06■■■■■ 4.48
REXO4-204ENST00000454825 ADAMTS12P58397 1594 aa42.93■■■■■ 4.46
REXO4-204ENST00000454825 ARAP1Q96P48 1450 aa42.86■■■■■ 4.45
REXO4-204ENST00000454825 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.86■■■■■ 4.45
REXO4-204ENST00000454825 GRIN2AQ12879 1464 aa42.84■■■■■ 4.45
REXO4-204ENST00000454825 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.83■■■■■ 4.45
REXO4-204ENST00000454825 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.79■■■■■ 4.44
REXO4-204ENST00000454825 CEP170Q5SW79 1584 aa42.7■■■■■ 4.43
REXO4-204ENST00000454825 NUP160Q12769 1436 aa42.68■■■■■ 4.42
REXO4-204ENST00000454825 KIF27Q86VH2 1401 aa42.53■■■■■ 4.4
REXO4-204ENST00000454825 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.48■■■■■ 4.39
REXO4-204ENST00000454825 IGF1RP08069 1367 aa42.47■■■■■ 4.39
REXO4-204ENST00000454825 SHROOM2Q13796 1616 aa42.46■■■■■ 4.39
REXO4-204ENST00000454825 CUL7Q14999 1698 aa42.38■■■■■ 4.38
REXO4-204ENST00000454825 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.31■■■■■ 4.36
REXO4-204ENST00000454825 JPH4Q96JJ6 628 aa42.21■■■■■ 4.35
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