RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562253.1

C16orf59-203, Transcript of Uncharacterized protein C16orf59, humanhuman

TSL 2

Gene C16orf59, Length 930 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf59-203ENST00000562253 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.99■■■■■ 7.51
C16orf59-203ENST00000562253 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa55.07■■■■■ 6.41
C16orf59-203ENST00000562253 ABCC9O60706 1549 aa54.01■■■■■ 6.24
C16orf59-203ENST00000562253 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.03■■■■■ 5.92
C16orf59-203ENST00000562253 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.92■■■■■ 5.9
C16orf59-203ENST00000562253 NACADO15069 1562 aa51.83■■■■■ 5.89
C16orf59-203ENST00000562253 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.61■■■■■ 5.85
C16orf59-203ENST00000562253 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.48■■■■■ 5.83
C16orf59-203ENST00000562253 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.25■■■■■ 5.79
C16orf59-203ENST00000562253 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.6■■■■■ 5.69
C16orf59-203ENST00000562253 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP50.52■■■■■ 5.68
C16orf59-203ENST00000562253 SCRIBQ14160 1630 aa50.31■■■■■ 5.64
C16orf59-203ENST00000562253 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.26■■■■■ 5.64
C16orf59-203ENST00000562253 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.78■■■■■ 5.56
C16orf59-203ENST00000562253 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.56■■■■■ 5.52
C16orf59-203ENST00000562253 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.99■■■■■ 5.43
C16orf59-203ENST00000562253 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.8■■■■■ 5.4
C16orf59-203ENST00000562253 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.54■■■■■ 5.36
C16orf59-203ENST00000562253 SMARCA4P51532 1647 aa48.09■■■■■ 5.29
C16orf59-203ENST00000562253 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48.06■■■■■ 5.28
C16orf59-203ENST00000562253 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.86■■■■■ 5.25
C16orf59-203ENST00000562253 NCAPD3P42695 1498 aa47.84■■■■■ 5.25
C16orf59-203ENST00000562253 SMARCA2P51531 1590 aa47.82■■■■■ 5.25
C16orf59-203ENST00000562253 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.77■■■■■ 5.24
C16orf59-203ENST00000562253 HMGXB3Q12766 1538 aa47.57■■■■■ 5.21
C16orf59-203ENST00000562253 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.57■■■■■ 5.21
C16orf59-203ENST00000562253 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.51■■■■■ 5.2
C16orf59-203ENST00000562253 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.24■■■■■ 5.15
C16orf59-203ENST00000562253 WIZO95785 1651 aa47.24■■■■■ 5.15
C16orf59-203ENST00000562253 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.76■■■■■ 5.08
C16orf59-203ENST00000562253 NESP48681 1621 aa46.69■■■■■ 5.07
C16orf59-203ENST00000562253 ERCC6Q03468 1493 aa46.62■■■■■ 5.05
C16orf59-203ENST00000562253 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.57■■■■■ 5.05
C16orf59-203ENST00000562253 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.49■■■■■ 5.03
C16orf59-203ENST00000562253 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.34■■■■■ 5.01
C16orf59-203ENST00000562253 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.23■■■■■ 4.99
C16orf59-203ENST00000562253 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.19■■■■■ 4.98
C16orf59-203ENST00000562253 CFTRP13569 1480 aa46.16■■■■■ 4.98
C16orf59-203ENST00000562253 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.09■■■■■ 4.97
C16orf59-203ENST00000562253 CUX2O14529 1486 aa46.06■■■■■ 4.96
C16orf59-203ENST00000562253 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.94■■■■■ 4.95
C16orf59-203ENST00000562253 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.93■■■■■ 4.94
C16orf59-203ENST00000562253 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.89■■■■■ 4.94
C16orf59-203ENST00000562253 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.82■■■■■ 4.93
C16orf59-203ENST00000562253 PRDM2Q13029 1718 aa45.72■■■■■ 4.91
C16orf59-203ENST00000562253 WDR62O43379 1518 aa45.62■■■■■ 4.89
C16orf59-203ENST00000562253 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.44■■■■■ 4.86
C16orf59-203ENST00000562253 ABCC8Q09428 1581 aa45.23■■■■■ 4.83
C16orf59-203ENST00000562253 TOPBP1Q92547 1522 aa45.18■■■■■ 4.82
C16orf59-203ENST00000562253 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.12■■■■■ 4.81
C16orf59-203ENST00000562253 IFT140Q96RY7 1462 aa44.94■■■■■ 4.78
C16orf59-203ENST00000562253 CUX1P39880 1505 aa44.81■■■■■ 4.76
C16orf59-203ENST00000562253 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.79■■■■■ 4.76
C16orf59-203ENST00000562253 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.71■■■■■ 4.75
C16orf59-203ENST00000562253 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.7■■■■■ 4.75
C16orf59-203ENST00000562253 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.7■■■■■ 4.75
C16orf59-203ENST00000562253 SOGA1O94964 1423 aa44.67■■■■■ 4.74
C16orf59-203ENST00000562253 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.63■■■■■ 4.73
C16orf59-203ENST00000562253 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.63■■■■■ 4.73
C16orf59-203ENST00000562253 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.58■■■■■ 4.73
C16orf59-203ENST00000562253 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.49■■■■■ 4.71
C16orf59-203ENST00000562253 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.49■■■■■ 4.712e-8■■■■■ 50.2
C16orf59-203ENST00000562253 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.43■■■■■ 4.7
C16orf59-203ENST00000562253 TOP2BQ02880 1626 aa44.42■■■■■ 4.7
C16orf59-203ENST00000562253 SYNJ1O43426 1573 aa44.39■■■■■ 4.7
C16orf59-203ENST00000562253 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.39■■■■■ 4.7
C16orf59-203ENST00000562253 WDR97A6NE52 1622 aa44.31■■■■■ 4.68
C16orf59-203ENST00000562253 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.25■■■■■ 4.67
C16orf59-203ENST00000562253 OSCARQ8IYS5 282 aa44.25■■■■■ 4.67
C16orf59-203ENST00000562253 GRIN2BQ13224 1484 aa44.14■■■■■ 4.66
C16orf59-203ENST00000562253 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.14■■■■■ 4.66
C16orf59-203ENST00000562253 FBLN2P98095 1184 aa44.09■■■■■ 4.65
C16orf59-203ENST00000562253 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.07■■■■■ 4.65
C16orf59-203ENST00000562253 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.02■■■■■ 4.64
C16orf59-203ENST00000562253 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44■■■■■ 4.63
C16orf59-203ENST00000562253 PBRM1Q86U86 1689 aa43.96■■■■■ 4.63
C16orf59-203ENST00000562253 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.94■■■■■ 4.62
C16orf59-203ENST00000562253 CHD1O14646 1710 aa43.92■■■■■ 4.62
C16orf59-203ENST00000562253 SYNJ2O15056 1496 aa43.83■■■■■ 4.61
C16orf59-203ENST00000562253 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.72■■■■■ 4.59
C16orf59-203ENST00000562253 KIF27Q86VH2 1401 aa43.68■■■■■ 4.58
C16orf59-203ENST00000562253 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.64■■■■■ 4.58
C16orf59-203ENST00000562253 ADAMTS12P58397 1594 aa43.63■■■■■ 4.58
C16orf59-203ENST00000562253 TRIM41Q8WV44 630 aa43.63■■■■■ 4.57
C16orf59-203ENST00000562253 GRIN2AQ12879 1464 aa43.54■■■■■ 4.56
C16orf59-203ENST00000562253 IGF1RP08069 1367 aa43.47■■■■■ 4.55
C16orf59-203ENST00000562253 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.44■■■■■ 4.54
C16orf59-203ENST00000562253 ARHGEF11O15085 1522 aa43.42■■■■■ 4.54
C16orf59-203ENST00000562253 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.4■■■■■ 4.54
C16orf59-203ENST00000562253 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.4■■■■■ 4.54
C16orf59-203ENST00000562253 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.4■■■■■ 4.54
C16orf59-203ENST00000562253 NUP160Q12769 1436 aa43.33■■■■■ 4.53
C16orf59-203ENST00000562253 CUL7Q14999 1698 aa43.31■■■■■ 4.52
C16orf59-203ENST00000562253 CEP170Q5SW79 1584 aa43.28■■■■■ 4.52
C16orf59-203ENST00000562253 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa43.26■■■■■ 4.52
C16orf59-203ENST00000562253 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.21■■■■■ 4.51
C16orf59-203ENST00000562253 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.14■■■■■ 4.5
C16orf59-203ENST00000562253 ARAP1Q96P48 1450 aa43.06■■■■■ 4.48
C16orf59-203ENST00000562253 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.02■■■■■ 4.48
C16orf59-203ENST00000562253 JPH4Q96JJ6 628 aa42.99■■■■■ 4.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms