RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568086.1

NOL3-210, Transcript of nucleolar protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene NOL3, Length 578 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOL3-210ENST00000568086 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.39■■■■□ 3.74
NOL3-210ENST00000568086 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.41■■■■□ 3.1
NOL3-210ENST00000568086 ABCC9O60706 1549 aa34.14■■■■□ 3.06
NOL3-210ENST00000568086 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.63■■■□□ 2.81
NOL3-210ENST00000568086 NACADO15069 1562 aa32.46■■■□□ 2.79
NOL3-210ENST00000568086 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.2■■■□□ 2.75
NOL3-210ENST00000568086 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.11■■■□□ 2.73
NOL3-210ENST00000568086 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.93■■■□□ 2.7
NOL3-210ENST00000568086 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.88■■■□□ 2.69
NOL3-210ENST00000568086 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.87■■■□□ 2.69
NOL3-210ENST00000568086 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.8■■■□□ 2.68
NOL3-210ENST00000568086 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.77■■■□□ 2.68
NOL3-210ENST00000568086 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.69■■■□□ 2.66
NOL3-210ENST00000568086 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.31■■■□□ 2.6
NOL3-210ENST00000568086 SCRIBQ14160 1630 aa31.31■■■□□ 2.6
NOL3-210ENST00000568086 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.9■■■□□ 2.54
NOL3-210ENST00000568086 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.88■■■□□ 2.53
NOL3-210ENST00000568086 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.76■■■□□ 2.51
NOL3-210ENST00000568086 NCAPD3P42695 1498 aa29.96■■■□□ 2.39
NOL3-210ENST00000568086 SMARCA4P51532 1647 aa29.92■■■□□ 2.38
NOL3-210ENST00000568086 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.89■■■□□ 2.38
NOL3-210ENST00000568086 SMARCA2P51531 1590 aa29.82■■■□□ 2.36
NOL3-210ENST00000568086 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
NOL3-210ENST00000568086 HMGXB3Q12766 1538 aa29.77■■■□□ 2.36
NOL3-210ENST00000568086 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.66■■■□□ 2.34
NOL3-210ENST00000568086 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
NOL3-210ENST00000568086 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.57■■■□□ 2.32
NOL3-210ENST00000568086 ERCC6Q03468 1493 aa29.47■■■□□ 2.31
NOL3-210ENST00000568086 NESP48681 1621 aa29.4■■■□□ 2.3
NOL3-210ENST00000568086 CUX2O14529 1486 aa29.4■■■□□ 2.3
NOL3-210ENST00000568086 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.26■■■□□ 2.28
NOL3-210ENST00000568086 WIZO95785 1651 aa29.23■■■□□ 2.27
NOL3-210ENST00000568086 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.13■■■□□ 2.25
NOL3-210ENST00000568086 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
NOL3-210ENST00000568086 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.06■■■□□ 2.24
NOL3-210ENST00000568086 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.06■■■□□ 2.24
NOL3-210ENST00000568086 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.04■■■□□ 2.24
NOL3-210ENST00000568086 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
NOL3-210ENST00000568086 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
NOL3-210ENST00000568086 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.81■■■□□ 2.2
NOL3-210ENST00000568086 CFTRP13569 1480 aa28.77■■■□□ 2.2
NOL3-210ENST00000568086 WDR62O43379 1518 aa28.76■■■□□ 2.19
NOL3-210ENST00000568086 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.72■■■□□ 2.19
NOL3-210ENST00000568086 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.72■■■□□ 2.19
NOL3-210ENST00000568086 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.54■■■□□ 2.16
NOL3-210ENST00000568086 PRDM2Q13029 1718 aa28.54■■■□□ 2.16
NOL3-210ENST00000568086 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
NOL3-210ENST00000568086 TOPBP1Q92547 1522 aa28.2■■■□□ 2.1
NOL3-210ENST00000568086 ABCC8Q09428 1581 aa28.16■■■□□ 2.1
NOL3-210ENST00000568086 IFT140Q96RY7 1462 aa28.15■■■□□ 2.1
NOL3-210ENST00000568086 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.12■■■□□ 2.09
NOL3-210ENST00000568086 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.08
NOL3-210ENST00000568086 OSCARQ8IYS5 282 aa28.03■■■□□ 2.08
NOL3-210ENST00000568086 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.96■■■□□ 2.07
NOL3-210ENST00000568086 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.07
NOL3-210ENST00000568086 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
NOL3-210ENST00000568086 TRIM41Q8WV44 630 aa27.88■■■□□ 2.05
NOL3-210ENST00000568086 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.83■■■□□ 2.05
NOL3-210ENST00000568086 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.79■■■□□ 2.04
NOL3-210ENST00000568086 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.79■■■□□ 2.04
NOL3-210ENST00000568086 CUX1P39880 1505 aa27.78■■■□□ 2.04
NOL3-210ENST00000568086 SOGA1O94964 1423 aa27.77■■■□□ 2.04
NOL3-210ENST00000568086 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.76■■■□□ 2.04
NOL3-210ENST00000568086 WDR97A6NE52 1622 aa27.71■■■□□ 2.03
NOL3-210ENST00000568086 CHD1O14646 1710 aa27.71■■■□□ 2.03
NOL3-210ENST00000568086 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.7■■■□□ 2.02
NOL3-210ENST00000568086 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.7■■■□□ 2.02
NOL3-210ENST00000568086 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.7■■■□□ 2.02
NOL3-210ENST00000568086 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
NOL3-210ENST00000568086 ARHGEF11O15085 1522 aa27.62■■■□□ 2.01
NOL3-210ENST00000568086 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.57■■■□□ 2
NOL3-210ENST00000568086 FBLN2P98095 1184 aa27.55■■■□□ 2
NOL3-210ENST00000568086 GRIN2BQ13224 1484 aa27.53■■■□□ 2
NOL3-210ENST00000568086 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
NOL3-210ENST00000568086 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.48■■□□□ 1.99
NOL3-210ENST00000568086 PBRM1Q86U86 1689 aa27.46■■□□□ 1.99
NOL3-210ENST00000568086 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.45■■□□□ 1.99
NOL3-210ENST00000568086 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.44■■□□□ 1.98
NOL3-210ENST00000568086 SYNJ2O15056 1496 aa27.42■■□□□ 1.98
NOL3-210ENST00000568086 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.41■■□□□ 1.98
NOL3-210ENST00000568086 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.41■■□□□ 1.98
NOL3-210ENST00000568086 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
NOL3-210ENST00000568086 TOP2BQ02880 1626 aa27.41■■□□□ 1.98
NOL3-210ENST00000568086 SYNJ1O43426 1573 aa27.39■■□□□ 1.98
NOL3-210ENST00000568086 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.38■■□□□ 1.97
NOL3-210ENST00000568086 ARAP1Q96P48 1450 aa27.37■■□□□ 1.97
NOL3-210ENST00000568086 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.35■■□□□ 1.97
NOL3-210ENST00000568086 ADAMTS12P58397 1594 aa27.21■■□□□ 1.95
NOL3-210ENST00000568086 GRIN2AQ12879 1464 aa27.19■■□□□ 1.94
NOL3-210ENST00000568086 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.15■■□□□ 1.94
NOL3-210ENST00000568086 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.12■■□□□ 1.93
NOL3-210ENST00000568086 NUP160Q12769 1436 aa27.1■■□□□ 1.93
NOL3-210ENST00000568086 CEP170Q5SW79 1584 aa27.09■■□□□ 1.93
NOL3-210ENST00000568086 SHROOM2Q13796 1616 aa26.98■■□□□ 1.91
NOL3-210ENST00000568086 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.97■■□□□ 1.91
NOL3-210ENST00000568086 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
NOL3-210ENST00000568086 KIF27Q86VH2 1401 aa26.84■■□□□ 1.89
NOL3-210ENST00000568086 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.82■■□□□ 1.88
NOL3-210ENST00000568086 IGF1RP08069 1367 aa26.82■■□□□ 1.88
NOL3-210ENST00000568086 CUL7Q14999 1698 aa26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms