Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

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Length 3,996 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HECTD4Q9Y4D8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HECTD4Q9Y4D8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HECTD4Q9Y4D8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HECTD4Q9Y4D8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HECTD4Q9Y4D8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HECTD4Q9Y4D8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HECTD4Q9Y4D8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HECTD4Q9Y4D8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HECTD4Q9Y4D8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HECTD4Q9Y4D8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HECTD4Q9Y4D8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HECTD4Q9Y4D8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HECTD4Q9Y4D8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HECTD4Q9Y4D8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HECTD4Q9Y4D8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HECTD4Q9Y4D8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HECTD4Q9Y4D8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HECTD4Q9Y4D8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HECTD4Q9Y4D8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HECTD4Q9Y4D8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HECTD4Q9Y4D8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HECTD4Q9Y4D8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HECTD4Q9Y4D8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HECTD4Q9Y4D8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HECTD4Q9Y4D8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HECTD4Q9Y4D8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HECTD4Q9Y4D8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HECTD4Q9Y4D8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HECTD4Q9Y4D8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HECTD4Q9Y4D8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HECTD4Q9Y4D8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HECTD4Q9Y4D8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HECTD4Q9Y4D8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HECTD4Q9Y4D8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HECTD4Q9Y4D8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HECTD4Q9Y4D8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HECTD4Q9Y4D8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HECTD4Q9Y4D8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HECTD4Q9Y4D8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HECTD4Q9Y4D8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HECTD4Q9Y4D8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HECTD4Q9Y4D8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HECTD4Q9Y4D8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HECTD4Q9Y4D8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HECTD4Q9Y4D8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HECTD4Q9Y4D8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HECTD4Q9Y4D8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HECTD4Q9Y4D8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HECTD4Q9Y4D8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HECTD4Q9Y4D8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HECTD4Q9Y4D8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HECTD4Q9Y4D8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HECTD4Q9Y4D8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HECTD4Q9Y4D8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HECTD4Q9Y4D8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HECTD4Q9Y4D8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HECTD4Q9Y4D8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HECTD4Q9Y4D8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HECTD4Q9Y4D8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HECTD4Q9Y4D8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HECTD4Q9Y4D8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HECTD4Q9Y4D8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HECTD4Q9Y4D8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HECTD4Q9Y4D8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HECTD4Q9Y4D8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HECTD4Q9Y4D8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HECTD4Q9Y4D8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HECTD4Q9Y4D8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HECTD4Q9Y4D8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HECTD4Q9Y4D8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HECTD4Q9Y4D8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HECTD4Q9Y4D8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HECTD4Q9Y4D8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HECTD4Q9Y4D8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HECTD4Q9Y4D8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HECTD4Q9Y4D8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HECTD4Q9Y4D8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HECTD4Q9Y4D8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HECTD4Q9Y4D8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HECTD4Q9Y4D8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HECTD4Q9Y4D8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HECTD4Q9Y4D8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HECTD4Q9Y4D8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HECTD4Q9Y4D8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HECTD4Q9Y4D8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HECTD4Q9Y4D8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HECTD4Q9Y4D8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HECTD4Q9Y4D8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HECTD4Q9Y4D8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HECTD4Q9Y4D8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HECTD4Q9Y4D8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HECTD4Q9Y4D8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HECTD4Q9Y4D8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HECTD4Q9Y4D8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HECTD4Q9Y4D8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HECTD4Q9Y4D8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HECTD4Q9Y4D8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HECTD4Q9Y4D8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HECTD4Q9Y4D8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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