Protein–RNA interactions for Protein: Q7KZF4

SND1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SND1Q7KZF4 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.63e-7■■■■■ 30.3
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SND1Q7KZF4 ITIH2-204ENST00000473227 654 ntTSL 26.21□□□□□ -1.424e-75■■■■■ 30.3
SND1Q7KZF4 MPZ-202ENST00000476410 878 ntTSL 317.99■□□□□ 0.471e-7■■■■■ 30.3
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SND1Q7KZF4 POR-202ENST00000412064 1044 ntTSL 514.06□□□□□ -0.161e-11■■■■■ 30.2
SND1Q7KZF4 TSPAN9-202ENST00000407263 956 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.72e-8■■■■■ 30.2
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SND1Q7KZF4 MANF-201ENST00000446668 846 ntTSL 321.56■■□□□ 1.041e-6■■■■■ 30.2
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SND1Q7KZF4 CRTAP-201ENST00000320954 6630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.334e-7■■■■■ 30.2
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SND1Q7KZF4 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.392e-9■■■■■ 29.9
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SND1Q7KZF4 RDH11-201ENST00000381346 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.793e-7■■■■■ 29.8
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SND1Q7KZF4 ALG8-201ENST00000299626 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.313e-7■■■■■ 29.8
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SND1Q7KZF4 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.714e-10■■■■■ 29.8
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SND1Q7KZF4 GOLT1B-202ENST00000535593 813 ntTSL 1 (best)8.45□□□□□ -1.062e-7■■■■■ 29.5
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SND1Q7KZF4 SORT1-202ENST00000466471 521 ntTSL 25□□□□□ -1.614e-7■■■■■ 29.4
SND1Q7KZF4 PSAP-204ENST00000495196 344 ntTSL 212.47□□□□□ -0.412e-54■■■■■ 29.3
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SND1Q7KZF4 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.119e-7■■■■■ 29.3
SND1Q7KZF4 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.069e-7■■■■■ 29.3
SND1Q7KZF4 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.19e-7■■■■■ 29.3
SND1Q7KZF4 FAM213A-201ENST00000372181 2058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.269e-7■■■■■ 29.3
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SND1Q7KZF4 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.271e-7■■■■■ 29.3
SND1Q7KZF4 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.131e-7■■■■■ 29.3
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SND1Q7KZF4 HACD3-210ENST00000568793 1824 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.161e-7■■■■■ 29.3
SND1Q7KZF4 HACD3-207ENST00000566074 1658 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.211e-7■■■■■ 29.3
SND1Q7KZF4 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.871e-7■■■■■ 29.3
SND1Q7KZF4 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.41e-7■■■■■ 29.3
SND1Q7KZF4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.611e-7■■■■■ 29.2
SND1Q7KZF4 LGALS3BP-219ENST00000592255 556 ntTSL 212.86□□□□□ -0.351e-42■■■■■ 29.2
SND1Q7KZF4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.461e-7■■■■■ 29.2
SND1Q7KZF4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.11e-7■■■■■ 29.2
SND1Q7KZF4 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.091e-7■■■■■ 29.2
SND1Q7KZF4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.577e-8■■■■■ 29.2
SND1Q7KZF4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.37e-8■■■■■ 29.2
SND1Q7KZF4 NAT14-203ENST00000588985 730 ntTSL 521.96■■□□□ 1.117e-8■■■■■ 29.2
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SND1Q7KZF4 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.737e-8■■■■■ 29.2
SND1Q7KZF4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.687e-8■■■■■ 29.2
SND1Q7KZF4 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.457e-8■■■■■ 29.2
SND1Q7KZF4 SLC43A2-210ENST00000576537 574 ntTSL 417.15■□□□□ 0.347e-8■■■■■ 29.2
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SND1Q7KZF4 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.27e-7■■■■■ 29.2
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