Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP34Q70CQ2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP34Q70CQ2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP34Q70CQ2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP34Q70CQ2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP34Q70CQ2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP34Q70CQ2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP34Q70CQ2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP34Q70CQ2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP34Q70CQ2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP34Q70CQ2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP34Q70CQ2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP34Q70CQ2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USP34Q70CQ2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
USP34Q70CQ2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP34Q70CQ2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP34Q70CQ2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP34Q70CQ2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP34Q70CQ2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
USP34Q70CQ2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
USP34Q70CQ2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP34Q70CQ2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP34Q70CQ2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP34Q70CQ2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USP34Q70CQ2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP34Q70CQ2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
USP34Q70CQ2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
USP34Q70CQ2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP34Q70CQ2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP34Q70CQ2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
USP34Q70CQ2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP34Q70CQ2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
USP34Q70CQ2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP34Q70CQ2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP34Q70CQ2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP34Q70CQ2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP34Q70CQ2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
USP34Q70CQ2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
USP34Q70CQ2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USP34Q70CQ2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
USP34Q70CQ2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP34Q70CQ2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP34Q70CQ2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP34Q70CQ2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP34Q70CQ2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP34Q70CQ2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP34Q70CQ2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP34Q70CQ2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP34Q70CQ2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP34Q70CQ2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP34Q70CQ2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP34Q70CQ2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP34Q70CQ2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP34Q70CQ2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP34Q70CQ2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP34Q70CQ2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP34Q70CQ2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP34Q70CQ2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP34Q70CQ2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP34Q70CQ2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP34Q70CQ2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP34Q70CQ2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP34Q70CQ2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP34Q70CQ2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP34Q70CQ2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP34Q70CQ2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP34Q70CQ2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP34Q70CQ2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP34Q70CQ2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP34Q70CQ2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP34Q70CQ2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP34Q70CQ2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP34Q70CQ2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP34Q70CQ2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP34Q70CQ2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP34Q70CQ2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP34Q70CQ2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP34Q70CQ2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP34Q70CQ2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP34Q70CQ2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP34Q70CQ2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP34Q70CQ2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP34Q70CQ2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP34Q70CQ2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP34Q70CQ2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP34Q70CQ2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP34Q70CQ2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP34Q70CQ2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP34Q70CQ2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
USP34Q70CQ2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
USP34Q70CQ2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USP34Q70CQ2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
USP34Q70CQ2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
USP34Q70CQ2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USP34Q70CQ2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP34Q70CQ2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP34Q70CQ2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP34Q70CQ2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP34Q70CQ2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
USP34Q70CQ2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
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