Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GFI1BQ5VTD9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GFI1BQ5VTD9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GFI1BQ5VTD9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GFI1BQ5VTD9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GFI1BQ5VTD9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GFI1BQ5VTD9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GFI1BQ5VTD9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GFI1BQ5VTD9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GFI1BQ5VTD9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GFI1BQ5VTD9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GFI1BQ5VTD9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GFI1BQ5VTD9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GFI1BQ5VTD9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GFI1BQ5VTD9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GFI1BQ5VTD9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GFI1BQ5VTD9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GFI1BQ5VTD9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GFI1BQ5VTD9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GFI1BQ5VTD9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GFI1BQ5VTD9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GFI1BQ5VTD9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GFI1BQ5VTD9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GFI1BQ5VTD9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GFI1BQ5VTD9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GFI1BQ5VTD9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GFI1BQ5VTD9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GFI1BQ5VTD9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GFI1BQ5VTD9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GFI1BQ5VTD9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GFI1BQ5VTD9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GFI1BQ5VTD9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GFI1BQ5VTD9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GFI1BQ5VTD9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GFI1BQ5VTD9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GFI1BQ5VTD9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GFI1BQ5VTD9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GFI1BQ5VTD9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GFI1BQ5VTD9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GFI1BQ5VTD9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GFI1BQ5VTD9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GFI1BQ5VTD9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GFI1BQ5VTD9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GFI1BQ5VTD9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GFI1BQ5VTD9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GFI1BQ5VTD9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GFI1BQ5VTD9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GFI1BQ5VTD9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GFI1BQ5VTD9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GFI1BQ5VTD9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GFI1BQ5VTD9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GFI1BQ5VTD9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GFI1BQ5VTD9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GFI1BQ5VTD9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GFI1BQ5VTD9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GFI1BQ5VTD9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GFI1BQ5VTD9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GFI1BQ5VTD9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GFI1BQ5VTD9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GFI1BQ5VTD9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GFI1BQ5VTD9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GFI1BQ5VTD9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GFI1BQ5VTD9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GFI1BQ5VTD9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GFI1BQ5VTD9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GFI1BQ5VTD9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GFI1BQ5VTD9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GFI1BQ5VTD9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GFI1BQ5VTD9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GFI1BQ5VTD9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GFI1BQ5VTD9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GFI1BQ5VTD9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GFI1BQ5VTD9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GFI1BQ5VTD9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GFI1BQ5VTD9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GFI1BQ5VTD9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GFI1BQ5VTD9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GFI1BQ5VTD9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GFI1BQ5VTD9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GFI1BQ5VTD9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GFI1BQ5VTD9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GFI1BQ5VTD9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GFI1BQ5VTD9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GFI1BQ5VTD9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GFI1BQ5VTD9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GFI1BQ5VTD9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GFI1BQ5VTD9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GFI1BQ5VTD9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GFI1BQ5VTD9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GFI1BQ5VTD9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GFI1BQ5VTD9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GFI1BQ5VTD9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GFI1BQ5VTD9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GFI1BQ5VTD9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GFI1BQ5VTD9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GFI1BQ5VTD9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
GFI1BQ5VTD9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GFI1BQ5VTD9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GFI1BQ5VTD9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GFI1BQ5VTD9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms