Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GFI1BQ5VTD9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GFI1BQ5VTD9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GFI1BQ5VTD9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GFI1BQ5VTD9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GFI1BQ5VTD9 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GFI1BQ5VTD9 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GFI1BQ5VTD9 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GFI1BQ5VTD9 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GFI1BQ5VTD9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GFI1BQ5VTD9 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GFI1BQ5VTD9 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GFI1BQ5VTD9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GFI1BQ5VTD9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GFI1BQ5VTD9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GFI1BQ5VTD9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GFI1BQ5VTD9 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GFI1BQ5VTD9 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GFI1BQ5VTD9 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GFI1BQ5VTD9 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GFI1BQ5VTD9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GFI1BQ5VTD9 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GFI1BQ5VTD9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GFI1BQ5VTD9 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GFI1BQ5VTD9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GFI1BQ5VTD9 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GFI1BQ5VTD9 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GFI1BQ5VTD9 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GFI1BQ5VTD9 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GFI1BQ5VTD9 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GFI1BQ5VTD9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GFI1BQ5VTD9 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GFI1BQ5VTD9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GFI1BQ5VTD9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GFI1BQ5VTD9 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GFI1BQ5VTD9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GFI1BQ5VTD9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GFI1BQ5VTD9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GFI1BQ5VTD9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GFI1BQ5VTD9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GFI1BQ5VTD9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GFI1BQ5VTD9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GFI1BQ5VTD9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GFI1BQ5VTD9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GFI1BQ5VTD9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GFI1BQ5VTD9 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GFI1BQ5VTD9 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GFI1BQ5VTD9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GFI1BQ5VTD9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GFI1BQ5VTD9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GFI1BQ5VTD9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GFI1BQ5VTD9 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GFI1BQ5VTD9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GFI1BQ5VTD9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GFI1BQ5VTD9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GFI1BQ5VTD9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GFI1BQ5VTD9 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GFI1BQ5VTD9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GFI1BQ5VTD9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GFI1BQ5VTD9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GFI1BQ5VTD9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GFI1BQ5VTD9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GFI1BQ5VTD9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GFI1BQ5VTD9 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GFI1BQ5VTD9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GFI1BQ5VTD9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GFI1BQ5VTD9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GFI1BQ5VTD9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GFI1BQ5VTD9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GFI1BQ5VTD9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GFI1BQ5VTD9 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GFI1BQ5VTD9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GFI1BQ5VTD9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GFI1BQ5VTD9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GFI1BQ5VTD9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GFI1BQ5VTD9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GFI1BQ5VTD9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GFI1BQ5VTD9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GFI1BQ5VTD9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GFI1BQ5VTD9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GFI1BQ5VTD9 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GFI1BQ5VTD9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GFI1BQ5VTD9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GFI1BQ5VTD9 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GFI1BQ5VTD9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GFI1BQ5VTD9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GFI1BQ5VTD9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GFI1BQ5VTD9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GFI1BQ5VTD9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GFI1BQ5VTD9 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GFI1BQ5VTD9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GFI1BQ5VTD9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GFI1BQ5VTD9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GFI1BQ5VTD9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GFI1BQ5VTD9 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GFI1BQ5VTD9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GFI1BQ5VTD9 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GFI1BQ5VTD9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GFI1BQ5VTD9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GFI1BQ5VTD9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms