Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BNIP1Q12981 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BNIP1Q12981 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BNIP1Q12981 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BNIP1Q12981 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BNIP1Q12981 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BNIP1Q12981 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BNIP1Q12981 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BNIP1Q12981 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BNIP1Q12981 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BNIP1Q12981 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BNIP1Q12981 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BNIP1Q12981 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BNIP1Q12981 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BNIP1Q12981 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BNIP1Q12981 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BNIP1Q12981 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BNIP1Q12981 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BNIP1Q12981 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BNIP1Q12981 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BNIP1Q12981 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BNIP1Q12981 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BNIP1Q12981 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BNIP1Q12981 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BNIP1Q12981 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BNIP1Q12981 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BNIP1Q12981 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BNIP1Q12981 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BNIP1Q12981 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BNIP1Q12981 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BNIP1Q12981 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BNIP1Q12981 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BNIP1Q12981 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BNIP1Q12981 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BNIP1Q12981 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BNIP1Q12981 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BNIP1Q12981 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BNIP1Q12981 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BNIP1Q12981 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
BNIP1Q12981 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BNIP1Q12981 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BNIP1Q12981 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BNIP1Q12981 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BNIP1Q12981 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BNIP1Q12981 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BNIP1Q12981 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BNIP1Q12981 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BNIP1Q12981 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BNIP1Q12981 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BNIP1Q12981 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BNIP1Q12981 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BNIP1Q12981 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BNIP1Q12981 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BNIP1Q12981 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BNIP1Q12981 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BNIP1Q12981 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
BNIP1Q12981 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BNIP1Q12981 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BNIP1Q12981 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BNIP1Q12981 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BNIP1Q12981 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BNIP1Q12981 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BNIP1Q12981 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BNIP1Q12981 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BNIP1Q12981 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BNIP1Q12981 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BNIP1Q12981 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BNIP1Q12981 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BNIP1Q12981 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BNIP1Q12981 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BNIP1Q12981 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BNIP1Q12981 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BNIP1Q12981 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BNIP1Q12981 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BNIP1Q12981 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BNIP1Q12981 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BNIP1Q12981 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24■■□□□ 1.43
BNIP1Q12981 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BNIP1Q12981 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BNIP1Q12981 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BNIP1Q12981 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BNIP1Q12981 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BNIP1Q12981 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BNIP1Q12981 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BNIP1Q12981 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BNIP1Q12981 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BNIP1Q12981 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BNIP1Q12981 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BNIP1Q12981 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BNIP1Q12981 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BNIP1Q12981 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BNIP1Q12981 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BNIP1Q12981 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
BNIP1Q12981 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BNIP1Q12981 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BNIP1Q12981 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BNIP1Q12981 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BNIP1Q12981 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BNIP1Q12981 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BNIP1Q12981 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
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