Protein–RNA interactions for Protein: Q12955

ANK3, Ankyrin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANK3Q12955 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANK3Q12955 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANK3Q12955 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANK3Q12955 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANK3Q12955 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANK3Q12955 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANK3Q12955 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANK3Q12955 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANK3Q12955 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANK3Q12955 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANK3Q12955 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANK3Q12955 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANK3Q12955 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANK3Q12955 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANK3Q12955 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANK3Q12955 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANK3Q12955 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ANK3Q12955 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANK3Q12955 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANK3Q12955 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ANK3Q12955 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ANK3Q12955 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ANK3Q12955 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANK3Q12955 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANK3Q12955 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANK3Q12955 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ANK3Q12955 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ANK3Q12955 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ANK3Q12955 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANK3Q12955 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ANK3Q12955 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANK3Q12955 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ANK3Q12955 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANK3Q12955 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANK3Q12955 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANK3Q12955 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANK3Q12955 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANK3Q12955 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANK3Q12955 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ANK3Q12955 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ANK3Q12955 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANK3Q12955 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANK3Q12955 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANK3Q12955 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ANK3Q12955 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANK3Q12955 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANK3Q12955 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANK3Q12955 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANK3Q12955 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ANK3Q12955 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANK3Q12955 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANK3Q12955 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANK3Q12955 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANK3Q12955 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANK3Q12955 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ANK3Q12955 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ANK3Q12955 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANK3Q12955 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANK3Q12955 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ANK3Q12955 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANK3Q12955 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANK3Q12955 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANK3Q12955 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANK3Q12955 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANK3Q12955 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANK3Q12955 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ANK3Q12955 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ANK3Q12955 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANK3Q12955 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANK3Q12955 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANK3Q12955 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANK3Q12955 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANK3Q12955 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANK3Q12955 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ANK3Q12955 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANK3Q12955 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANK3Q12955 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANK3Q12955 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANK3Q12955 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANK3Q12955 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANK3Q12955 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANK3Q12955 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ANK3Q12955 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ANK3Q12955 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANK3Q12955 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANK3Q12955 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ANK3Q12955 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANK3Q12955 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANK3Q12955 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ANK3Q12955 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANK3Q12955 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANK3Q12955 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ANK3Q12955 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
ANK3Q12955 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ANK3Q12955 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ANK3Q12955 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANK3Q12955 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANK3Q12955 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANK3Q12955 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ANK3Q12955 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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