Protein–RNA interactions for Protein: P78413

IRX4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX4P78413 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
IRX4P78413 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRX4P78413 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRX4P78413 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRX4P78413 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRX4P78413 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRX4P78413 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRX4P78413 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRX4P78413 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRX4P78413 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRX4P78413 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRX4P78413 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRX4P78413 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRX4P78413 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRX4P78413 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
IRX4P78413 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRX4P78413 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IRX4P78413 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRX4P78413 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRX4P78413 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRX4P78413 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRX4P78413 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRX4P78413 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRX4P78413 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRX4P78413 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
IRX4P78413 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IRX4P78413 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IRX4P78413 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IRX4P78413 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IRX4P78413 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
IRX4P78413 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IRX4P78413 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IRX4P78413 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IRX4P78413 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IRX4P78413 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IRX4P78413 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRX4P78413 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRX4P78413 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
IRX4P78413 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRX4P78413 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IRX4P78413 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRX4P78413 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
IRX4P78413 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRX4P78413 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRX4P78413 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRX4P78413 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRX4P78413 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRX4P78413 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IRX4P78413 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRX4P78413 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRX4P78413 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRX4P78413 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRX4P78413 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRX4P78413 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
IRX4P78413 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRX4P78413 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRX4P78413 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRX4P78413 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IRX4P78413 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRX4P78413 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
IRX4P78413 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
IRX4P78413 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
IRX4P78413 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IRX4P78413 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRX4P78413 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
IRX4P78413 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRX4P78413 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRX4P78413 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRX4P78413 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IRX4P78413 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRX4P78413 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IRX4P78413 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
IRX4P78413 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRX4P78413 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRX4P78413 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRX4P78413 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRX4P78413 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRX4P78413 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRX4P78413 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRX4P78413 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IRX4P78413 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRX4P78413 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRX4P78413 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRX4P78413 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRX4P78413 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
IRX4P78413 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRX4P78413 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IRX4P78413 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRX4P78413 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRX4P78413 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRX4P78413 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRX4P78413 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRX4P78413 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IRX4P78413 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRX4P78413 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRX4P78413 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRX4P78413 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRX4P78413 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
IRX4P78413 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IRX4P78413 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms