Protein–RNA interactions for Protein: P24347

MMP11, Stromelysin-3, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP11P24347 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP11P24347 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP11P24347 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP11P24347 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP11P24347 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP11P24347 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP11P24347 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP11P24347 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP11P24347 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP11P24347 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP11P24347 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP11P24347 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP11P24347 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP11P24347 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP11P24347 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MMP11P24347 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP11P24347 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP11P24347 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP11P24347 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP11P24347 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MMP11P24347 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP11P24347 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP11P24347 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP11P24347 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MMP11P24347 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP11P24347 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP11P24347 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP11P24347 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP11P24347 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP11P24347 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP11P24347 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP11P24347 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP11P24347 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP11P24347 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MMP11P24347 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP11P24347 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP11P24347 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP11P24347 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP11P24347 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP11P24347 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP11P24347 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MMP11P24347 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP11P24347 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP11P24347 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP11P24347 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP11P24347 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP11P24347 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP11P24347 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP11P24347 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP11P24347 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP11P24347 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MMP11P24347 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP11P24347 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP11P24347 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP11P24347 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP11P24347 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MMP11P24347 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MMP11P24347 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MMP11P24347 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP11P24347 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP11P24347 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP11P24347 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MMP11P24347 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP11P24347 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP11P24347 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP11P24347 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP11P24347 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP11P24347 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP11P24347 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MMP11P24347 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP11P24347 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP11P24347 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP11P24347 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MMP11P24347 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP11P24347 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP11P24347 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP11P24347 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP11P24347 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MMP11P24347 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP11P24347 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP11P24347 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP11P24347 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP11P24347 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP11P24347 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP11P24347 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP11P24347 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MMP11P24347 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMP11P24347 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MMP11P24347 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP11P24347 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MMP11P24347 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP11P24347 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP11P24347 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP11P24347 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP11P24347 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MMP11P24347 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP11P24347 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP11P24347 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP11P24347 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MMP11P24347 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms