Protein–RNA interactions for Protein: P24347

MMP11, Stromelysin-3, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP11P24347 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.76
MMP11P24347 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
MMP11P24347 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
MMP11P24347 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
MMP11P24347 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
MMP11P24347 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
MMP11P24347 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
MMP11P24347 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
MMP11P24347 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
MMP11P24347 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
MMP11P24347 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
MMP11P24347 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
MMP11P24347 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
MMP11P24347 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
MMP11P24347 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
MMP11P24347 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
MMP11P24347 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
MMP11P24347 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
MMP11P24347 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MMP11P24347 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MMP11P24347 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MMP11P24347 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MMP11P24347 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
MMP11P24347 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
MMP11P24347 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
MMP11P24347 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MMP11P24347 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MMP11P24347 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MMP11P24347 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MMP11P24347 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MMP11P24347 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MMP11P24347 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MMP11P24347 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MMP11P24347 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MMP11P24347 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
MMP11P24347 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MMP11P24347 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MMP11P24347 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MMP11P24347 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
MMP11P24347 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MMP11P24347 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MMP11P24347 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MMP11P24347 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MMP11P24347 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MMP11P24347 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MMP11P24347 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
MMP11P24347 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MMP11P24347 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MMP11P24347 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MMP11P24347 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
MMP11P24347 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MMP11P24347 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MMP11P24347 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MMP11P24347 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MMP11P24347 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
MMP11P24347 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MMP11P24347 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MMP11P24347 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MMP11P24347 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MMP11P24347 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MMP11P24347 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MMP11P24347 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MMP11P24347 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MMP11P24347 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MMP11P24347 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MMP11P24347 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MMP11P24347 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MMP11P24347 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MMP11P24347 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MMP11P24347 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MMP11P24347 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MMP11P24347 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MMP11P24347 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MMP11P24347 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MMP11P24347 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MMP11P24347 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MMP11P24347 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MMP11P24347 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MMP11P24347 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MMP11P24347 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
MMP11P24347 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
MMP11P24347 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MMP11P24347 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
MMP11P24347 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MMP11P24347 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MMP11P24347 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MMP11P24347 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MMP11P24347 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MMP11P24347 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MMP11P24347 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MMP11P24347 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MMP11P24347 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MMP11P24347 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
MMP11P24347 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MMP11P24347 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MMP11P24347 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MMP11P24347 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MMP11P24347 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MMP11P24347 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MMP11P24347 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.2 ms