Protein–RNA interactions for Protein: O43639

NCK2, Cytoplasmic protein NCK2, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCK2O43639 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NCK2O43639 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NCK2O43639 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NCK2O43639 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NCK2O43639 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NCK2O43639 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NCK2O43639 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NCK2O43639 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCK2O43639 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCK2O43639 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCK2O43639 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCK2O43639 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCK2O43639 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCK2O43639 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCK2O43639 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCK2O43639 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCK2O43639 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NCK2O43639 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCK2O43639 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCK2O43639 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCK2O43639 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
NCK2O43639 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCK2O43639 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCK2O43639 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCK2O43639 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCK2O43639 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCK2O43639 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCK2O43639 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCK2O43639 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCK2O43639 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCK2O43639 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCK2O43639 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
NCK2O43639 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCK2O43639 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCK2O43639 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NCK2O43639 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NCK2O43639 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NCK2O43639 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NCK2O43639 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NCK2O43639 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCK2O43639 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCK2O43639 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCK2O43639 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NCK2O43639 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCK2O43639 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCK2O43639 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCK2O43639 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCK2O43639 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NCK2O43639 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NCK2O43639 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NCK2O43639 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NCK2O43639 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NCK2O43639 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCK2O43639 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCK2O43639 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCK2O43639 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCK2O43639 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCK2O43639 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NCK2O43639 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NCK2O43639 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NCK2O43639 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NCK2O43639 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NCK2O43639 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NCK2O43639 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NCK2O43639 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NCK2O43639 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NCK2O43639 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NCK2O43639 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCK2O43639 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCK2O43639 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCK2O43639 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCK2O43639 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCK2O43639 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCK2O43639 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCK2O43639 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCK2O43639 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCK2O43639 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCK2O43639 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NCK2O43639 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NCK2O43639 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NCK2O43639 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NCK2O43639 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NCK2O43639 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NCK2O43639 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NCK2O43639 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NCK2O43639 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NCK2O43639 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NCK2O43639 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NCK2O43639 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NCK2O43639 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NCK2O43639 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NCK2O43639 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NCK2O43639 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NCK2O43639 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NCK2O43639 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NCK2O43639 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCK2O43639 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NCK2O43639 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCK2O43639 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCK2O43639 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms