Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
FOXO3O43524 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
FOXO3O43524 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
FOXO3O43524 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
FOXO3O43524 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
FOXO3O43524 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
FOXO3O43524 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
FOXO3O43524 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
FOXO3O43524 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC34.45■■■■□ 3.1
FOXO3O43524 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
FOXO3O43524 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
FOXO3O43524 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
FOXO3O43524 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC34.43■■■■□ 3.1
FOXO3O43524 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
FOXO3O43524 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
FOXO3O43524 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC34.42■■■■□ 3.1
FOXO3O43524 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
FOXO3O43524 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
FOXO3O43524 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
FOXO3O43524 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
FOXO3O43524 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
FOXO3O43524 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
FOXO3O43524 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
FOXO3O43524 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
FOXO3O43524 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
FOXO3O43524 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
FOXO3O43524 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
FOXO3O43524 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
FOXO3O43524 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
FOXO3O43524 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
FOXO3O43524 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
FOXO3O43524 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
FOXO3O43524 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
FOXO3O43524 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
FOXO3O43524 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
FOXO3O43524 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
FOXO3O43524 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
FOXO3O43524 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
FOXO3O43524 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
FOXO3O43524 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
FOXO3O43524 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
FOXO3O43524 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
FOXO3O43524 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
FOXO3O43524 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
FOXO3O43524 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
FOXO3O43524 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
FOXO3O43524 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
FOXO3O43524 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
FOXO3O43524 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
FOXO3O43524 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
FOXO3O43524 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
FOXO3O43524 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
FOXO3O43524 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
FOXO3O43524 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
FOXO3O43524 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
FOXO3O43524 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
FOXO3O43524 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
FOXO3O43524 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
FOXO3O43524 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
FOXO3O43524 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
FOXO3O43524 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
FOXO3O43524 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
FOXO3O43524 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
FOXO3O43524 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
FOXO3O43524 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
FOXO3O43524 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
FOXO3O43524 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
FOXO3O43524 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
FOXO3O43524 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
FOXO3O43524 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
FOXO3O43524 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
FOXO3O43524 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
FOXO3O43524 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
FOXO3O43524 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC34.27■■■■□ 3.08
FOXO3O43524 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
FOXO3O43524 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
FOXO3O43524 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
FOXO3O43524 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
FOXO3O43524 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
FOXO3O43524 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
FOXO3O43524 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
FOXO3O43524 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
FOXO3O43524 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
FOXO3O43524 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
FOXO3O43524 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
FOXO3O43524 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
FOXO3O43524 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
FOXO3O43524 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
FOXO3O43524 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
FOXO3O43524 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
FOXO3O43524 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
FOXO3O43524 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
FOXO3O43524 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
FOXO3O43524 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
FOXO3O43524 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
FOXO3O43524 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
FOXO3O43524 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
FOXO3O43524 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
FOXO3O43524 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
FOXO3O43524 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms