Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
LCHNA4D1U4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LCHNA4D1U4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LCHNA4D1U4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LCHNA4D1U4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LCHNA4D1U4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LCHNA4D1U4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LCHNA4D1U4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LCHNA4D1U4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LCHNA4D1U4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LCHNA4D1U4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LCHNA4D1U4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
LCHNA4D1U4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LCHNA4D1U4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LCHNA4D1U4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LCHNA4D1U4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LCHNA4D1U4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LCHNA4D1U4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
LCHNA4D1U4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
LCHNA4D1U4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LCHNA4D1U4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LCHNA4D1U4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LCHNA4D1U4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
LCHNA4D1U4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LCHNA4D1U4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
LCHNA4D1U4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LCHNA4D1U4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LCHNA4D1U4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LCHNA4D1U4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LCHNA4D1U4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LCHNA4D1U4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LCHNA4D1U4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LCHNA4D1U4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LCHNA4D1U4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LCHNA4D1U4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LCHNA4D1U4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
LCHNA4D1U4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LCHNA4D1U4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
LCHNA4D1U4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
LCHNA4D1U4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LCHNA4D1U4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LCHNA4D1U4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LCHNA4D1U4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LCHNA4D1U4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LCHNA4D1U4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LCHNA4D1U4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LCHNA4D1U4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LCHNA4D1U4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LCHNA4D1U4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LCHNA4D1U4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LCHNA4D1U4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LCHNA4D1U4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LCHNA4D1U4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LCHNA4D1U4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LCHNA4D1U4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LCHNA4D1U4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LCHNA4D1U4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LCHNA4D1U4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LCHNA4D1U4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LCHNA4D1U4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LCHNA4D1U4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LCHNA4D1U4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LCHNA4D1U4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LCHNA4D1U4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LCHNA4D1U4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LCHNA4D1U4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LCHNA4D1U4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LCHNA4D1U4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
LCHNA4D1U4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LCHNA4D1U4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LCHNA4D1U4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LCHNA4D1U4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LCHNA4D1U4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LCHNA4D1U4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LCHNA4D1U4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LCHNA4D1U4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LCHNA4D1U4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LCHNA4D1U4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LCHNA4D1U4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
LCHNA4D1U4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LCHNA4D1U4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LCHNA4D1U4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LCHNA4D1U4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LCHNA4D1U4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
LCHNA4D1U4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LCHNA4D1U4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LCHNA4D1U4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LCHNA4D1U4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LCHNA4D1U4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LCHNA4D1U4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LCHNA4D1U4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LCHNA4D1U4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LCHNA4D1U4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LCHNA4D1U4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LCHNA4D1U4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LCHNA4D1U4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LCHNA4D1U4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
LCHNA4D1U4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
LCHNA4D1U4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LCHNA4D1U4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms