Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 MTHFD2-205ENST00000470592 1396 ntTSL 27.71□□□□□ -1.183e-6■■■■□ 25.8
PCBP2Q15366 MTHFD2-208ENST00000489041 1135 ntTSL 27.48□□□□□ -1.213e-6■■■■□ 25.8
PCBP2Q15366 HOOK3-201ENST00000307602 14398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.082e-6■■■■□ 25.8
PCBP2Q15366 NBEAL2-211ENST00000486870 1076 ntTSL 216.98■□□□□ 0.312e-9■■■■□ 25.8
PCBP2Q15366 NBEAL2-201ENST00000416683 6364 ntTSL 1 (best)16.2■□□□□ 0.182e-9■■■■□ 25.8
PCBP2Q15366 NBEAL2-204ENST00000443829 3508 ntTSL 1 (best)13.49□□□□□ -0.252e-9■■■■□ 25.8
PCBP2Q15366 NBEAL2-203ENST00000441027 636 ntTSL 310.73□□□□□ -0.692e-9■■■■□ 25.8
PCBP2Q15366 ERN1-201ENST00000433197 7876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.824e-8■■■■□ 25.8
PCBP2Q15366 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.366e-7■■■■□ 25.8
PCBP2Q15366 USP6NL-202ENST00000379237 4546 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.756e-7■■■■□ 25.8
PCBP2Q15366 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.341e-8■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.241e-8■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 NPTN-209ENST00000565325 858 ntTSL 213.13□□□□□ -0.311e-8■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.411e-8■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 NPTN-205ENST00000563691 1214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.581e-8■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 ARIH1-207ENST00000565950 559 ntTSL 47.35□□□□□ -1.232e-16■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 ARIH1-203ENST00000561987 403 ntTSL 36.39□□□□□ -1.392e-16■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 ARIH1-202ENST00000561770 478 ntTSL 35.89□□□□□ -1.472e-16■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 SPIRE2-209ENST00000566337 1369 ntTSL 521.3■■□□□ 13e-7■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.943e-7■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.513e-7■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 TRAPPC9-211ENST00000521700 548 ntTSL 316.79■□□□□ 0.284e-7■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 TTC21B-203ENST00000464374 1844 ntTSL 1 (best)6.61□□□□□ -1.352e-12■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.452e-12■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.088e-7■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 GRAMD1A-212ENST00000600231 2534 ntTSL 221.33■■□□□ 18e-7■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.248e-7■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.198e-7■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 RPS6KA3-202ENST00000438357 530 ntTSL 513.7□□□□□ -0.226e-7■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 RPS6KA3-206ENST00000492128 553 ntTSL 49.47□□□□□ -0.896e-7■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 L1CAM-202ENST00000361981 5004 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.471e-8■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.028e-7■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.148e-7■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 SHANK2-209ENST00000445654 522 ntTSL 313.02□□□□□ -0.338e-7■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.793e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 C14orf80-218ENST00000548920 1358 ntTSL 525.07■■□□□ 1.63e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.63e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.533e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.523e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.513e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 KPNA4-202ENST00000469804 790 ntTSL 224.19■■□□□ 1.463e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 MEF2A-209ENST00000558983 847 ntTSL 324.1■■□□□ 1.454e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 MEF2A-210ENST00000559036 685 ntTSL 223.99■■□□□ 1.434e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 MEF2A-208ENST00000558856 574 ntTSL 423.99■■□□□ 1.434e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 HSF1-206ENST00000528988 775 ntTSL 323.9■■□□□ 1.423e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.393e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.273e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.243e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 KCTD15-204ENST00000587658 632 ntTSL 322.63■■□□□ 1.213e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.193e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 HYOU1-202ENST00000526656 862 ntTSL 322.45■■□□□ 1.183e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 C14orf80-215ENST00000463869 849 ntTSL 322.4■■□□□ 1.183e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 LINC00668-208ENST00000583840 586 nt22.27■■□□□ 1.163e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 SLC25A36-206ENST00000502756 796 ntTSL 222.15■■□□□ 1.145e-8■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.133e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 MEF2A-212ENST00000560493 732 ntTSL 422.06■■□□□ 1.124e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.113e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 C14orf80-217ENST00000546536 1089 ntTSL 221.99■■□□□ 1.113e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.033e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.033e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 HYOU1-203ENST00000527038 629 ntTSL 221.49■■□□□ 1.033e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 C14orf80-209ENST00000432805 1144 ntAPPRIS ALT2 TSL 521.45■■□□□ 1.023e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.023e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 C14orf80-219ENST00000551054 1074 ntTSL 1 (best)21.15■□□□□ 0.983e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.974e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.963e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 POGLUT1-203ENST00000460339 589 ntTSL 420.97■□□□□ 0.953e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.93e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.93e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.853e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.843e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.823e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.813e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 DEF8-214ENST00000564379 2354 ntTSL 220.11■□□□□ 0.813e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.83e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.793e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.773e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.773e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 HYOU1-201ENST00000526354 568 ntTSL 219.62■□□□□ 0.733e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 GPAA1-207ENST00000526341 557 ntTSL 519.55■□□□□ 0.723e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 GPAA1-211ENST00000529503 878 ntTSL 519.55■□□□□ 0.723e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.723e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.74e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 PLEKHG5-210ENST00000489097 4968 ntTSL 219.23■□□□□ 0.673e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.673e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 NTHL1-206ENST00000565406 691 ntTSL 219.07■□□□□ 0.643e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 HYOU1-214ENST00000534233 711 ntTSL 219.05■□□□□ 0.643e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 ABCA2-217ENST00000479446 6295 ntTSL 1 (best)18.99■□□□□ 0.633e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.63e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 GPAA1-210ENST00000528073 986 ntTSL 318.77■□□□□ 0.63e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 GPAA1-213ENST00000530258 535 ntTSL 418.75■□□□□ 0.593e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 HYOU1-213ENST00000533381 694 ntTSL 318.69■□□□□ 0.583e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 HYOU1-206ENST00000530467 552 ntTSL 418.68■□□□□ 0.583e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 UBQLN4-203ENST00000472638 654 ntTSL 518.59■□□□□ 0.573e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 HYOU1-211ENST00000532421 582 ntTSL 218.49■□□□□ 0.553e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.533e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.523e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.523e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.523e-6■■■■□ 25.7
PCBP2Q15366 SLC25A36-202ENST00000393015 659 ntTSL 518.21■□□□□ 0.515e-8■■■■□ 25.7
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