RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476279.5

NDUFB2-212, Transcript of NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit B2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NDUFB2, Length 1,666 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFB2-212ENST00000476279 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.4■■■■■ 5.66
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NDUFB2-212ENST00000476279 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.12■■■■■ 4.33
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NDUFB2-212ENST00000476279 NACADO15069 1562 aa41.67■■■■■ 4.26
NDUFB2-212ENST00000476279 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.65■■■■■ 4.26
NDUFB2-212ENST00000476279 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.53■■■■■ 4.24
NDUFB2-212ENST00000476279 SCRIBQ14160 1630 aa40.64■■■■■ 4.1
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NDUFB2-212ENST00000476279 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.26■■■■■ 4.03
NDUFB2-212ENST00000476279 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.2■■■■■ 4.03
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NDUFB2-212ENST00000476279 SMARCA4P51532 1647 aa38.95■■■■□ 3.83
NDUFB2-212ENST00000476279 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.84■■■■□ 3.81
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NDUFB2-212ENST00000476279 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.68■■■■□ 3.78
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NDUFB2-212ENST00000476279 SMARCA2P51531 1590 aa38.56■■■■□ 3.76
NDUFB2-212ENST00000476279 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.56■■■■□ 3.76
NDUFB2-212ENST00000476279 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.55■■■■□ 3.76
NDUFB2-212ENST00000476279 WIZO95785 1651 aa38.48■■■■□ 3.75
NDUFB2-212ENST00000476279 NCAPD3P42695 1498 aa38.43■■■■□ 3.74
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NDUFB2-212ENST00000476279 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.31■■■■□ 3.56
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NDUFB2-212ENST00000476279 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.86■■■■□ 3.49
NDUFB2-212ENST00000476279 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.81■■■■□ 3.48
NDUFB2-212ENST00000476279 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.59■■■■□ 3.45
NDUFB2-212ENST00000476279 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.52■■■■□ 3.44
NDUFB2-212ENST00000476279 ABCC8Q09428 1581 aa36.5■■■■□ 3.43
NDUFB2-212ENST00000476279 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.47■■■■□ 3.43
NDUFB2-212ENST00000476279 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.47■■■■□ 3.43
NDUFB2-212ENST00000476279 WDR62O43379 1518 aa36.43■■■■□ 3.42
NDUFB2-212ENST00000476279 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.43■■■■□ 3.42
NDUFB2-212ENST00000476279 TOPBP1Q92547 1522 aa36.4■■■■□ 3.42
NDUFB2-212ENST00000476279 CUX1P39880 1505 aa36.39■■■■□ 3.42
NDUFB2-212ENST00000476279 SYNJ1O43426 1573 aa36.3■■■■□ 3.4
NDUFB2-212ENST00000476279 TOP2BQ02880 1626 aa36.3■■■■□ 3.4
NDUFB2-212ENST00000476279 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.29■■■■□ 3.4
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NDUFB2-212ENST00000476279 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.17■■■■□ 3.38
NDUFB2-212ENST00000476279 TRIM41Q8WV44 630 aa36.16■■■■□ 3.38
NDUFB2-212ENST00000476279 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.16■■■■□ 3.38
NDUFB2-212ENST00000476279 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.14■■■■□ 3.38
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NDUFB2-212ENST00000476279 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.97■■■■□ 3.35
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NDUFB2-212ENST00000476279 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.86■■■■□ 3.33
NDUFB2-212ENST00000476279 WDR97A6NE52 1622 aa35.82■■■■□ 3.33
NDUFB2-212ENST00000476279 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.74■■■■□ 3.31
NDUFB2-212ENST00000476279 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.72■■■■□ 3.31
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NDUFB2-212ENST00000476279 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.52■■■■□ 3.28
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NDUFB2-212ENST00000476279 PBRM1Q86U86 1689 aa35.51■■■■□ 3.27
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NDUFB2-212ENST00000476279 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.45■■■■□ 3.27
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NDUFB2-212ENST00000476279 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.34■■■■□ 3.25
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NDUFB2-212ENST00000476279 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.17■■■■□ 3.22
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NDUFB2-212ENST00000476279 CHD1O14646 1710 aa35.09■■■■□ 3.21
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NDUFB2-212ENST00000476279 OSCARQ8IYS5 282 aa34.89■■■■□ 3.18
NDUFB2-212ENST00000476279 NUP160Q12769 1436 aa34.86■■■■□ 3.17
NDUFB2-212ENST00000476279 EHMT2Q96KQ7 1210 aa34.83■■■■□ 3.17
NDUFB2-212ENST00000476279 CEP170Q5SW79 1584 aa34.83■■■■□ 3.17
NDUFB2-212ENST00000476279 UBTFP17480 764 aaKnown RBP34.79■■■■□ 3.16
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