RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583840.1

LINC00668-208, long intergenic non-protein coding RNA 668, human

Gene LINC00668, Length 586 nt, Biotype lincRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC00668-208	ENST00000583840	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		59.26	■■■■■ 7.08
LINC00668-208	ENST00000583840	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		53.02	■■■■■ 6.08
LINC00668-208	ENST00000583840	ABCC9	O60706	1549 aa		52.61	■■■■■ 6.01
LINC00668-208	ENST00000583840	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		50.34	■■■■■ 5.65
LINC00668-208	ENST00000583840	NACAD	O15069	1562 aa		50.08	■■■■■ 5.61
LINC00668-208	ENST00000583840	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		49.94	■■■■■ 5.59
LINC00668-208	ENST00000583840	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		49.54	■■■■■ 5.52
LINC00668-208	ENST00000583840	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	49.19	■■■■■ 5.47
LINC00668-208	ENST00000583840	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	49.05	■■■■■ 5.44
LINC00668-208	ENST00000583840	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		49.03	■■■■■ 5.44
LINC00668-208	ENST00000583840	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		49	■■■■■ 5.43
LINC00668-208	ENST00000583840	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		48.92	■■■■■ 5.42
LINC00668-208	ENST00000583840	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		48.71	■■■■■ 5.39
LINC00668-208	ENST00000583840	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		48.3	■■■■■ 5.32
LINC00668-208	ENST00000583840	SCRIB	Q14160	1630 aa		48.29	■■■■■ 5.32
LINC00668-208	ENST00000583840	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	47.56	■■■■■ 5.2
LINC00668-208	ENST00000583840	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		47.54	■■■■■ 5.2
LINC00668-208	ENST00000583840	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		47.4	■■■■■ 5.18
LINC00668-208	ENST00000583840	NCAPD3	P42695	1498 aa		46.21	■■■■■ 4.99
LINC00668-208	ENST00000583840	SMARCA4	P51532	1647 aa		46.13	■■■■■ 4.97
LINC00668-208	ENST00000583840	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		46.09	■■■■■ 4.97
LINC00668-208	ENST00000583840	SMARCA2	P51531	1590 aa		46.06	■■■■■ 4.96
LINC00668-208	ENST00000583840	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	46.03	■■■■■ 4.96
LINC00668-208	ENST00000583840	HMGXB3	Q12766	1538 aa		45.91	■■■■■ 4.94
LINC00668-208	ENST00000583840	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	45.73	■■■■■ 4.91
LINC00668-208	ENST00000583840	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		45.7	■■■■■ 4.91
LINC00668-208	ENST00000583840	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		45.62	■■■■■ 4.89
LINC00668-208	ENST00000583840	ERCC6	Q03468	1493 aa		45.51	■■■■■ 4.88
LINC00668-208	ENST00000583840	CUX2	O14529	1486 aa		45.28	■■■■■ 4.84
LINC00668-208	ENST00000583840	NES	P48681	1621 aa		45.26	■■■■■ 4.84
LINC00668-208	ENST00000583840	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		45.12	■■■■■ 4.81
LINC00668-208	ENST00000583840	WIZ	O95785	1651 aa		45.07	■■■■■ 4.81
LINC00668-208	ENST00000583840	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		44.92	■■■■■ 4.78
LINC00668-208	ENST00000583840	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	44.85	■■■■■ 4.77
LINC00668-208	ENST00000583840	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		44.85	■■■■■ 4.77
LINC00668-208	ENST00000583840	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		44.78	■■■■■ 4.76
LINC00668-208	ENST00000583840	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	44.73	■■■■■ 4.75
LINC00668-208	ENST00000583840	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		44.68	■■■■■ 4.74
LINC00668-208	ENST00000583840	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	44.61	■■■■■ 4.73
LINC00668-208	ENST00000583840	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		44.44	■■■■■ 4.7
LINC00668-208	ENST00000583840	CFTR	P13569	1480 aa		44.4	■■■■■ 4.7
LINC00668-208	ENST00000583840	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		44.36	■■■■■ 4.69
LINC00668-208	ENST00000583840	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		44.32	■■■■■ 4.69
LINC00668-208	ENST00000583840	WDR62	O43379	1518 aa		44.28	■■■■■ 4.68
LINC00668-208	ENST00000583840	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		44.08	■■■■■ 4.65
LINC00668-208	ENST00000583840	PRDM2	Q13029	1718 aa		43.91	■■■■■ 4.62
LINC00668-208	ENST00000583840	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	43.86	■■■■■ 4.61
LINC00668-208	ENST00000583840	ABCC8	Q09428	1581 aa		43.55	■■■■■ 4.56
LINC00668-208	ENST00000583840	TOPBP1	Q92547	1522 aa		43.49	■■■■■ 4.55
LINC00668-208	ENST00000583840	IFT140	Q96RY7	1462 aa		43.47	■■■■■ 4.55
LINC00668-208	ENST00000583840	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		43.39	■■■■■ 4.54
LINC00668-208	ENST00000583840	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		43.32	■■■■■ 4.53
LINC00668-208	ENST00000583840	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	43.24	■■■■■ 4.51
LINC00668-208	ENST00000583840	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	43.22	■■■■■ 4.51
LINC00668-208	ENST00000583840	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	43.07	■■■■■ 4.49
LINC00668-208	ENST00000583840	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	43.06	■■■■■ 4.48
LINC00668-208	ENST00000583840	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	43.04	■■■■■ 4.48
LINC00668-208	ENST00000583840	TRIM41	Q8WV44	630 aa		42.99	■■■■■ 4.47
LINC00668-208	ENST00000583840	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	42.94	■■■■■ 4.47	5e-21	■■■■■ 81.3
LINC00668-208	ENST00000583840	SOGA1	O94964	1423 aa		42.94	■■■■■ 4.46
LINC00668-208	ENST00000583840	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		42.87	■■■■■ 4.45
LINC00668-208	ENST00000583840	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		42.86	■■■■■ 4.45
LINC00668-208	ENST00000583840	CUX1	P39880	1505 aa		42.85	■■■■■ 4.45
LINC00668-208	ENST00000583840	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	42.76	■■■■■ 4.44
LINC00668-208	ENST00000583840	WDR97	A6NE52	1622 aa		42.75	■■■■■ 4.43
LINC00668-208	ENST00000583840	FBLN2	P98095	1184 aa		42.69	■■■■■ 4.42
LINC00668-208	ENST00000583840	CHD1	O14646	1710 aa		42.62	■■■■■ 4.41
LINC00668-208	ENST00000583840	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		42.57	■■■■■ 4.41
LINC00668-208	ENST00000583840	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		42.57	■■■■■ 4.41
LINC00668-208	ENST00000583840	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		42.57	■■■■■ 4.41
LINC00668-208	ENST00000583840	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		42.54	■■■■■ 4.4
LINC00668-208	ENST00000583840	GRIN2B	Q13224	1484 aa		42.53	■■■■■ 4.4
LINC00668-208	ENST00000583840	ARHGEF11	O15085	1522 aa		42.51	■■■■■ 4.4
LINC00668-208	ENST00000583840	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	42.5	■■■■■ 4.39
LINC00668-208	ENST00000583840	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	42.47	■■■■■ 4.39
LINC00668-208	ENST00000583840	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		42.43	■■■■■ 4.38
LINC00668-208	ENST00000583840	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		42.42	■■■■■ 4.38
LINC00668-208	ENST00000583840	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	42.39	■■■■■ 4.38
LINC00668-208	ENST00000583840	SYNJ2	O15056	1496 aa		42.34	■■■■■ 4.37
LINC00668-208	ENST00000583840	TOP2B	Q02880	1626 aa		42.31	■■■■■ 4.36
LINC00668-208	ENST00000583840	PBRM1	Q86U86	1689 aa		42.29	■■■■■ 4.36
LINC00668-208	ENST00000583840	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		42.28	■■■■■ 4.36
LINC00668-208	ENST00000583840	SYNJ1	O43426	1573 aa		42.28	■■■■■ 4.36
LINC00668-208	ENST00000583840	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		42.27	■■■■■ 4.36
LINC00668-208	ENST00000583840	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		42.23	■■■■■ 4.35
LINC00668-208	ENST00000583840	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		42.18	■■■■■ 4.34
LINC00668-208	ENST00000583840	ARAP1	Q96P48	1450 aa		42.1	■■■■■ 4.33
LINC00668-208	ENST00000583840	GRIN2A	Q12879	1464 aa		41.95	■■■■■ 4.31
LINC00668-208	ENST00000583840	ADAMTS12	P58397	1594 aa		41.94	■■■■■ 4.3
LINC00668-208	ENST00000583840	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		41.93	■■■■■ 4.3
LINC00668-208	ENST00000583840	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		41.92	■■■■■ 4.3
LINC00668-208	ENST00000583840	NUP160	Q12769	1436 aa		41.78	■■■■■ 4.28
LINC00668-208	ENST00000583840	CEP170	Q5SW79	1584 aa		41.71	■■■■■ 4.27
LINC00668-208	ENST00000583840	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	41.69	■■■■■ 4.26
LINC00668-208	ENST00000583840	KIF27	Q86VH2	1401 aa		41.59	■■■■■ 4.25
LINC00668-208	ENST00000583840	SHROOM2	Q13796	1616 aa		41.51	■■■■■ 4.24
LINC00668-208	ENST00000583840	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		41.47	■■■■■ 4.23
LINC00668-208	ENST00000583840	IGF1R	P08069	1367 aa		41.45	■■■■■ 4.23
LINC00668-208	ENST00000583840	JPH4	Q96JJ6	628 aa		41.42	■■■■■ 4.22
LINC00668-208	ENST00000583840	CUL7	Q14999	1698 aa		41.39	■■■■■ 4.22

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