Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 RPL8-204ENST00000526668 717 ntTSL 1 (best)15.96■□□□□ 0.153e-25■□□□□ 8.2
PUM1Q14671 SBNO1-203ENST00000602398 4313 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.061e-13■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.411e-13■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.421e-13■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 ZSCAN12-201ENST00000361028 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.174e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 ZSCAN12-202ENST00000396827 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.354e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 LMBR1-214ENST00000461469 560 ntTSL 324.59■■□□□ 1.531e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 LMBR1-209ENST00000434453 2229 ntTSL 523.74■■□□□ 1.391e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 LMBR1-211ENST00000444719 762 ntTSL 323.08■■□□□ 1.291e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 LMBR1-205ENST00000430278 523 ntTSL 422.63■■□□□ 1.211e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 LMBR1-207ENST00000433968 578 ntTSL 422.63■■□□□ 1.211e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 LMBR1-210ENST00000434503 930 ntTSL 522.63■■□□□ 1.211e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 LMBR1-217ENST00000485985 644 ntTSL 222.63■■□□□ 1.211e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 LMBR1-203ENST00000414218 451 ntTSL 521.85■■□□□ 1.091e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 LMBR1-219ENST00000498034 478 ntTSL 321.6■■□□□ 1.051e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 LMBR1-208ENST00000434278 678 ntTSL 521.05■□□□□ 0.961e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 GARS-203ENST00000454308 814 ntTSL 520.27■□□□□ 0.841e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 LMBR1-213ENST00000454132 2922 ntTSL 218.71■□□□□ 0.591e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 PDLIM7-216ENST00000506537 636 ntTSL 218.33■□□□□ 0.521e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 SPAG9-215ENST00000513746 822 ntTSL 518.26■□□□□ 0.511e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.451e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 NCOR2-213ENST00000448614 582 ntTSL 316.23■□□□□ 0.191e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 CENPF-202ENST00000464322 689 ntTSL 216.03■□□□□ 0.162e-12■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.141e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.061e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.071e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.261e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 SNRNP200-204ENST00000480615 1646 ntTSL 513.14□□□□□ -0.311e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 LARS-208ENST00000506436 539 ntTSL 313.03□□□□□ -0.321e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 DDIT3-203ENST00000547526 644 ntTSL 312.58□□□□□ -0.41e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 LARS-213ENST00000511505 1089 ntTSL 512.44□□□□□ -0.421e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 MCM4-205ENST00000518680 862 ntTSL 512.33□□□□□ -0.441e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 MCM4-202ENST00000517709 842 ntTSL 212.28□□□□□ -0.441e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 AC116366.3-201ENST00000638452 7893 ntAPPRIS ALT2 TSL 512.03□□□□□ -0.481e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 DDIT3-201ENST00000346473 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.511e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 RAD50-209ENST00000533482 4373 ntTSL 1 (best)11.73□□□□□ -0.531e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 DDIT3-202ENST00000547303 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.571e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 LARS-206ENST00000505223 582 ntTSL 311.34□□□□□ -0.591e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 RAD50-201ENST00000378823 8306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.651e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 AKAP9-208ENST00000463118 891 ntTSL 310.82□□□□□ -0.681e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 LARS-203ENST00000503654 534 ntTSL 410.33□□□□□ -0.761e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 LARS-216ENST00000618084 720 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.781e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 PHB2-212ENST00000545555 309 ntTSL 59.49□□□□□ -0.891e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 SPAG9-217ENST00000513906 750 ntTSL 59.43□□□□□ -0.91e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 DDIT3-205ENST00000552740 951 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.921e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 AKAP9-211ENST00000487258 3983 ntTSL 29.28□□□□□ -0.921e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 AFDN-219ENST00000509296 686 ntTSL 48.89□□□□□ -0.991e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 DDIT3-204ENST00000551116 1067 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.011e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 MACF1-224ENST00000496804 5065 ntTSL 58.38□□□□□ -1.071e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 NARS-210ENST00000589314 1036 ntTSL 58.25□□□□□ -1.091e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 GFPT1-201ENST00000357308 8703 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.111e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 AC116366.3-203ENST00000639899 8173 ntTSL 57.53□□□□□ -1.21e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 AKAP9-212ENST00000487692 869 ntTSL 27.44□□□□□ -1.221e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 LMBR1-204ENST00000415428 3457 ntTSL 1 (best)7.43□□□□□ -1.221e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 KIF4A-201ENST00000374403 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.231e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 AC116366.3-205ENST00000640655 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.251e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 RAD50-206ENST00000455677 564 ntTSL 57.16□□□□□ -1.261e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 SPAG9-219ENST00000514613 2523 ntTSL 26.7□□□□□ -1.341e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 KARS-211ENST00000569298 589 ntTSL 26.48□□□□□ -1.371e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.391e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 AC116366.3-204ENST00000638504 7262 ntAPPRIS P5 TSL 56.3□□□□□ -1.41e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.41e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 AC116366.3-202ENST00000638568 7956 ntAPPRIS ALT2 TSL 56.25□□□□□ -1.411e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 SPAG9-204ENST00000505173 2369 ntTSL 56.15□□□□□ -1.431e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 DDIT3-206ENST00000623876 1151 nt6.14□□□□□ -1.431e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 GFPT1-203ENST00000493759 524 ntTSL 55.44□□□□□ -1.541e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 RPL30-210ENST00000521534 573 ntTSL 25.33□□□□□ -1.562e-12■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 AKAP9-204ENST00000394534 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)5.02□□□□□ -1.611e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.891e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 RPL17-206ENST00000579495 914 ntTSL 221.18■□□□□ 0.987e-21■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 NOB1-206ENST00000569871 845 ntTSL 516.96■□□□□ 0.314e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 NOB1-205ENST00000564620 812 ntTSL 215.94■□□□□ 0.144e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 NOB1-202ENST00000561677 582 ntTSL 214.25□□□□□ -0.134e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.254e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 HDGFL2-209ENST00000619255 320 ntTSL 320.04■□□□□ 0.83e-11■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TXNRD1-220ENST00000529751 557 ntTSL 418.89■□□□□ 0.613e-11■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 ITGB1-215ENST00000488494 540 ntTSL 418.44■□□□□ 0.543e-11■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 ITGB1-210ENST00000474568 788 ntTSL 516.41■□□□□ 0.223e-11■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TXNRD1-214ENST00000526691 3974 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.433e-11■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TXNRD1-202ENST00000388854 4277 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.493e-11■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TXNRD1-201ENST00000354940 4082 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.553e-11■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 ITGB1-202ENST00000396033 3784 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.583e-11■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TXNRD1-206ENST00000524698 1933 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.673e-11■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TXNRD1-215ENST00000526950 1847 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.83e-11■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TXNRD1-217ENST00000527688 3858 ntTSL 29.78□□□□□ -0.843e-11■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TXNRD1-204ENST00000429002 3855 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.023e-11■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TXNRD1-208ENST00000525566 3836 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.073e-11■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TXNRD1-219ENST00000529546 2018 ntTSL 2 BASIC8.1□□□□□ -1.113e-11■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.223e-11■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 ITGB1-212ENST00000480226 585 ntTSL 46.58□□□□□ -1.363e-11■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.373e-11■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.433e-11■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.433e-11■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 ITGB1-219ENST00000534049 562 ntTSL 45.64□□□□□ -1.513e-11■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.673e-11■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 ITGB1-206ENST00000437302 445 ntTSL 54.16□□□□□ -1.743e-11■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 ITGB1-213ENST00000484088 580 ntTSL 43.12□□□□□ -1.913e-11■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.398e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 EIF4G3-206ENST00000411888 1122 ntTSL 528.83■■■□□ 2.218e-6■□□□□ 8.1
PUM1Q14671 MACROD1-208ENST00000545464 899 ntTSL 327.13■■□□□ 1.938e-6■□□□□ 8.1
Retrieved 100 of 12,080 protein–RNA pairs in 42.6 ms