RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463118.1

AKAP9-208, Transcript of A-kinase anchoring protein 9, humanhuman

TSL 3

Gene AKAP9, Length 891 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP9-208ENST00000463118 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.15■■■□□ 2.26
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AKAP9-208ENST00000463118 NISCHQ9Y2I1 1504 aa24.59■■□□□ 1.53
AKAP9-208ENST00000463118 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
AKAP9-208ENST00000463118 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.15■■□□□ 1.46
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AKAP9-208ENST00000463118 KCNA4P22459 653 aa21.78■■□□□ 1.08
AKAP9-208ENST00000463118 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
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AKAP9-208ENST00000463118 CEP162Q5TB80 1403 aa17.92■□□□□ 0.46
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AKAP9-208ENST00000463118 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa17.91■□□□□ 0.46
AKAP9-208ENST00000463118 CEP164Q9UPV0 1460 aa17.88■□□□□ 0.45
AKAP9-208ENST00000463118 SPDYE4A6NLX3 237 aa17.85■□□□□ 0.45
AKAP9-208ENST00000463118 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
AKAP9-208ENST00000463118 CFTRP13569 1480 aa17.84■□□□□ 0.45
AKAP9-208ENST00000463118 FBLN2P98095 1184 aa17.83■□□□□ 0.44
AKAP9-208ENST00000463118 PRDM2Q13029 1718 aa17.77■□□□□ 0.44
AKAP9-208ENST00000463118 UBTFP17480 764 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
AKAP9-208ENST00000463118 TRHP20396 242 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
AKAP9-208ENST00000463118 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
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