Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
RIPPLY1Q0D2K3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIPPLY1Q0D2K3 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms