Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 C12orf57-202ENST00000537087 662 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.464e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 COASY-206ENST00000587157 551 ntTSL 412.14□□□□□ -0.474e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 CHST11-204ENST00000549016 573 ntTSL 412.12□□□□□ -0.474e-6■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 PTCH1-209ENST00000437951 8049 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.474e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 UBXN8-209ENST00000620074 1058 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.474e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 HDGFL3-204ENST00000563790 934 ntTSL 312.04□□□□□ -0.484e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 FAM32A-202ENST00000585831 896 ntTSL 212.04□□□□□ -0.484e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 TMEM69-201ENST00000372025 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.494e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 APBB2-214ENST00000508593 3592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.494e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 UBXN8-205ENST00000522968 813 ntTSL 311.99□□□□□ -0.494e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 DST-216ENST00000517937 554 ntTSL 411.99□□□□□ -0.494e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 MPP2-220ENST00000622681 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.494e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 APOL4-205ENST00000419360 543 ntTSL 411.98□□□□□ -0.494e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 FADS2-207ENST00000520145 428 ntTSL 311.97□□□□□ -0.494e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 HIF1AN-205ENST00000533589 1042 ntTSL 311.97□□□□□ -0.492e-13■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 ATP11A-214ENST00000493489 583 ntTSL 311.96□□□□□ -0.494e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 FAM85B-201ENST00000519726 792 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.494e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 EHBP1-220ENST00000496857 1262 ntTSL 1 (best)11.95□□□□□ -0.54e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 BORCS8-MEF2B-206ENST00000602689 554 ntTSL 311.95□□□□□ -0.54e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 USP49-204ENST00000423567 752 ntTSL 211.95□□□□□ -0.54e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 IKZF4-201ENST00000262032 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.54e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 MPP2-202ENST00000377184 4206 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.54e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 USP46-204ENST00000503060 2437 ntTSL 511.91□□□□□ -0.54e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 PTCH1-208ENST00000430669 8232 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.514e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 FNBP1-205ENST00000449089 2256 ntTSL 211.88□□□□□ -0.514e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 TDP1-212ENST00000555565 524 ntTSL 511.87□□□□□ -0.514e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 ICK-202ENST00000356971 6227 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.524e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 MRPL11-204ENST00000524576 2209 ntTSL 211.79□□□□□ -0.524e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 RFC2-212ENST00000497430 753 ntTSL 311.74□□□□□ -0.534e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 ZPR1-206ENST00000444935 2497 ntTSL 511.73□□□□□ -0.534e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 KMT2A-201ENST00000389506 13655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.534e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 DHODH-202ENST00000571288 839 ntTSL 511.69□□□□□ -0.544e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 TMEM108-202ENST00000393130 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.553e-6■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 CAMK2G-201ENST00000305762 1820 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.554e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 LMNTD2-205ENST00000492515 608 ntTSL 411.56□□□□□ -0.564e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 HAUS8-203ENST00000593360 3176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.564e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 PTCH1-225ENST00000551845 809 ntTSL 511.51□□□□□ -0.574e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 MGRN1-217ENST00000593224 498 ntTSL 511.5□□□□□ -0.574e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 PTCH1-203ENST00000375274 4720 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.574e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 LIG1-213ENST00000596672 792 ntTSL 311.49□□□□□ -0.574e-6■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 MYO1F-222ENST00000613525 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.584e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 ACTR8-201ENST00000335754 3629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.584e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 TDP1-211ENST00000555178 2200 ntTSL 511.44□□□□□ -0.584e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 PTCH1-205ENST00000418258 7815 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.584e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 ZNF876P-201ENST00000356347 2598 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.584e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 MPP2-218ENST00000536246 4351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.584e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 CAMK2G-202ENST00000322635 3720 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.594e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 L1CAM-201ENST00000361699 3888 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.594e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 RFC2-204ENST00000470266 881 ntTSL 511.36□□□□□ -0.594e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 GPATCH2L-210ENST00000556675 771 ntTSL 311.35□□□□□ -0.594e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 PLAGL2-201ENST00000246229 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.64e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 KCTD13-209ENST00000568995 601 ntTSL 511.3□□□□□ -0.64e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 NEMP1-203ENST00000553654 458 ntTSL 511.29□□□□□ -0.64e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 PTCH1-206ENST00000421141 7659 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.614e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 CSGALNACT1-202ENST00000397998 3962 ntTSL 211.27□□□□□ -0.614e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 CAMK2G-206ENST00000394762 3767 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.614e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 BEST1-201ENST00000378043 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.614e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 CCM2-208ENST00000476594 533 ntTSL 311.21□□□□□ -0.614e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 N6AMT1-202ENST00000351429 4781 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.624e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 MPP2-201ENST00000269095 4414 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.624e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 CAMK2G-207ENST00000423381 3824 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.634e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 ZPR1-201ENST00000227322 6566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.634e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 APOL4-210ENST00000493203 616 ntTSL 411.12□□□□□ -0.634e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 TMEM55B-205ENST00000554028 1118 ntTSL 211.12□□□□□ -0.634e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 THEM4-202ENST00000471464 1832 ntTSL 1 (best)11.11□□□□□ -0.634e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 LDHB-207ENST00000535112 252 ntTSL 511.09□□□□□ -0.634e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 JPX-205ENST00000602546 762 ntTSL 311.07□□□□□ -0.644e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 MYLK-205ENST00000360772 10027 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.644e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 CAMK2G-203ENST00000322680 3818 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.644e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 TNXB-201ENST00000375244 13132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.654e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 MTFR1-201ENST00000262146 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.654e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 AC092953.1-201ENST00000460975 543 ntBASIC10.98□□□□□ -0.654e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 RFC2-211ENST00000494019 730 ntTSL 310.96□□□□□ -0.654e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 MYO1F-201ENST00000338257 4303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.664e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 N6AMT1-201ENST00000303775 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.664e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 NIPA1-206ENST00000560105 375 ntTSL 210.93□□□□□ -0.664e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 CACNB1-211ENST00000582877 599 ntTSL 410.93□□□□□ -0.664e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 CACNB1-204ENST00000492737 588 ntTSL 310.93□□□□□ -0.664e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 APOL4-201ENST00000328429 844 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.664e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 FNBP1-204ENST00000446176 5393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.664e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 TSEN2-209ENST00000473755 3918 ntTSL 210.9□□□□□ -0.664e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 LINC01193-201ENST00000553416 3401 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.674e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 ACTR8-203ENST00000486794 1202 ntTSL 210.88□□□□□ -0.674e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 NIPA1-204ENST00000559448 2799 ntTSL 210.88□□□□□ -0.674e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 FAXC-201ENST00000389677 11508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.674e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 JPX-208ENST00000602895 829 ntTSL 310.85□□□□□ -0.674e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 MTM1-205ENST00000490530 806 ntTSL 310.81□□□□□ -0.684e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 MRPL9-207ENST00000478926 581 ntTSL 310.77□□□□□ -0.694e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 ZNF232-205ENST00000573015 1553 ntTSL 510.76□□□□□ -0.694e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 CCM2-210ENST00000478169 542 ntTSL 410.72□□□□□ -0.694e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 FYN-211ENST00000476769 793 ntTSL 310.71□□□□□ -0.694e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 FAM9B-205ENST00000472522 1533 ntTSL 510.7□□□□□ -0.74e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 JAZF1-204ENST00000430432 571 ntTSL 410.69□□□□□ -0.74e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 JPX-201ENST00000414209 2194 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.74e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 MRPL11-203ENST00000430466 1527 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.74e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 LDLRAD3-206ENST00000534091 568 ntTSL 410.64□□□□□ -0.714e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 PTCH1-204ENST00000375290 10631 ntTSL 210.57□□□□□ -0.724e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 HEPH-208ENST00000471121 802 ntTSL 210.55□□□□□ -0.724e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 APBB2-201ENST00000295974 8972 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.724e-7■■■■■ 133.7
SF3B1O75533 CRTC3-211ENST00000561119 630 ntTSL 510.48□□□□□ -0.734e-7■■■■■ 133.7
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