RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522968.1

UBXN8-205, Transcript of UBX domain protein 8, humanhuman

TSL 3

Gene UBXN8, Length 813 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8-205ENST00000522968 NISCHQ9Y2I1 1504 aa26.07■■□□□ 1.76
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UBXN8-205ENST00000522968 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa21.07■□□□□ 0.96
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UBXN8-205ENST00000522968 SMARCA2P51531 1590 aa19.74■□□□□ 0.75
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UBXN8-205ENST00000522968 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa19.54■□□□□ 0.72
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UBXN8-205ENST00000522968 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP19■□□□□ 0.63
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UBXN8-205ENST00000522968 SYNJ1O43426 1573 aa18.93■□□□□ 0.62
UBXN8-205ENST00000522968 NESP48681 1621 aa18.92■□□□□ 0.62
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UBXN8-205ENST00000522968 FANCD2Q9BXW9 1451 aa18.86■□□□□ 0.61
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UBXN8-205ENST00000522968 PBRM1Q86U86 1689 aa18.24■□□□□ 0.51
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UBXN8-205ENST00000522968 CLIP1P30622 1438 aa18.14■□□□□ 0.49
UBXN8-205ENST00000522968 ADAMTS12P58397 1594 aa18.11■□□□□ 0.49
UBXN8-205ENST00000522968 FHAD1B1AJZ9 1412 aa18.09■□□□□ 0.49
UBXN8-205ENST00000522968 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa18.08■□□□□ 0.48
UBXN8-205ENST00000522968 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa18.05■□□□□ 0.48
UBXN8-205ENST00000522968 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
UBXN8-205ENST00000522968 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
UBXN8-205ENST00000522968 ARAP1Q96P48 1450 aa17.98■□□□□ 0.47
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