RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620074.4

UBXN8-209, Transcript of UBX domain protein 8, humanhuman

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Gene UBXN8, Length 1,058 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8-209ENST00000620074 NISCHQ9Y2I1 1504 aa27.12■■□□□ 1.93
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UBXN8-209ENST00000620074 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa24.23■■□□□ 1.47
UBXN8-209ENST00000620074 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.08■■□□□ 1.45
UBXN8-209ENST00000620074 ABCC9O60706 1549 aa23.73■■□□□ 1.39
UBXN8-209ENST00000620074 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa22.84■■□□□ 1.25
UBXN8-209ENST00000620074 NACADO15069 1562 aa22.78■■□□□ 1.24
UBXN8-209ENST00000620074 MYO15BQ96JP2 1530 aa22.62■■□□□ 1.21
UBXN8-209ENST00000620074 DCAF8L2P0C7V8 631 aa22.6■■□□□ 1.21
UBXN8-209ENST00000620074 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
UBXN8-209ENST00000620074 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa22.47■■□□□ 1.19
UBXN8-209ENST00000620074 UNC13AQ9UPW8 1703 aa22.31■■□□□ 1.16
UBXN8-209ENST00000620074 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
UBXN8-209ENST00000620074 BICRAQ9NZM4 1560 aa22.12■■□□□ 1.13
UBXN8-209ENST00000620074 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
UBXN8-209ENST00000620074 SCRIBQ14160 1630 aa22.03■■□□□ 1.12
UBXN8-209ENST00000620074 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa21.96■■□□□ 1.11
UBXN8-209ENST00000620074 DNAJC5BQ9UF47 199 aa21.83■■□□□ 1.09
UBXN8-209ENST00000620074 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
UBXN8-209ENST00000620074 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
UBXN8-209ENST00000620074 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa21.49■■□□□ 1.03
UBXN8-209ENST00000620074 CECR2Q9BXF3 1484 aa21.36■■□□□ 1.01
UBXN8-209ENST00000620074 SMARCA4P51532 1647 aa21.08■□□□□ 0.97
UBXN8-209ENST00000620074 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
UBXN8-209ENST00000620074 POTEDQ86YR6 584 aa21.04■□□□□ 0.96
UBXN8-209ENST00000620074 NCAPD3P42695 1498 aa21■□□□□ 0.95
UBXN8-209ENST00000620074 SMARCA2P51531 1590 aa20.98■□□□□ 0.95
UBXN8-209ENST00000620074 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa20.98■□□□□ 0.95
UBXN8-209ENST00000620074 HMGXB3Q12766 1538 aa20.92■□□□□ 0.94
UBXN8-209ENST00000620074 PEG3Q9GZU2 1588 aa20.9■□□□□ 0.94
UBXN8-209ENST00000620074 MROH2BQ7Z745 1585 aa20.87■□□□□ 0.93
UBXN8-209ENST00000620074 FOXD1Q16676 465 aa20.83■□□□□ 0.93
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UBXN8-209ENST00000620074 ERCC6Q03468 1493 aa20.5■□□□□ 0.87
UBXN8-209ENST00000620074 NESP48681 1621 aa20.49■□□□□ 0.87
UBXN8-209ENST00000620074 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa20.49■□□□□ 0.87
UBXN8-209ENST00000620074 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
UBXN8-209ENST00000620074 CADPSQ9ULU8 1353 aa20.36■□□□□ 0.85
UBXN8-209ENST00000620074 CUX2O14529 1486 aa20.36■□□□□ 0.85
UBXN8-209ENST00000620074 PDS5BQ9NTI5 1447 aa20.34■□□□□ 0.85
UBXN8-209ENST00000620074 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa20.29■□□□□ 0.84
UBXN8-209ENST00000620074 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
UBXN8-209ENST00000620074 CFTRP13569 1480 aa20.23■□□□□ 0.83
UBXN8-209ENST00000620074 CCDC88BA6NC98 1476 aa20.18■□□□□ 0.82
UBXN8-209ENST00000620074 FANCD2Q9BXW9 1451 aa20.14■□□□□ 0.81
UBXN8-209ENST00000620074 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.14■□□□□ 0.81
UBXN8-209ENST00000620074 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.14■□□□□ 0.81
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UBXN8-209ENST00000620074 WDR62O43379 1518 aa20.09■□□□□ 0.81
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UBXN8-209ENST00000620074 IFT140Q96RY7 1462 aa19.73■□□□□ 0.75
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UBXN8-209ENST00000620074 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
UBXN8-209ENST00000620074 CUX1P39880 1505 aa19.6■□□□□ 0.73
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UBXN8-209ENST00000620074 FGD5Q6ZNL6 1462 aa19.55■□□□□ 0.72
UBXN8-209ENST00000620074 SOGA1O94964 1423 aa19.52■□□□□ 0.72
UBXN8-209ENST00000620074 WDR97A6NE52 1622 aa19.51■□□□□ 0.71
UBXN8-209ENST00000620074 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa19.51■□□□□ 0.71
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UBXN8-209ENST00000620074 TOP2BQ02880 1626 aa19.43■□□□□ 0.7
UBXN8-209ENST00000620074 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP19.42■□□□□ 0.7
UBXN8-209ENST00000620074 OSCARQ8IYS5 282 aa19.42■□□□□ 0.7
UBXN8-209ENST00000620074 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP19.41■□□□□ 0.7
UBXN8-209ENST00000620074 SYNJ1O43426 1573 aa19.39■□□□□ 0.69
UBXN8-209ENST00000620074 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa19.38■□□□□ 0.69
UBXN8-209ENST00000620074 GRIN2BQ13224 1484 aa19.35■□□□□ 0.69
UBXN8-209ENST00000620074 CHD1O14646 1710 aa19.34■□□□□ 0.69
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UBXN8-209ENST00000620074 PBRM1Q86U86 1689 aa19.32■□□□□ 0.68
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UBXN8-209ENST00000620074 FBLN2P98095 1184 aa19.24■□□□□ 0.67
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UBXN8-209ENST00000620074 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP19.19■□□□□ 0.66
UBXN8-209ENST00000620074 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa19.17■□□□□ 0.66
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UBXN8-209ENST00000620074 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa19.17■□□□□ 0.66
UBXN8-209ENST00000620074 ERICH3Q5RHP9 1530 aa19.15■□□□□ 0.66
UBXN8-209ENST00000620074 ADAMTS12P58397 1594 aa19.15■□□□□ 0.66
UBXN8-209ENST00000620074 ARHGEF11O15085 1522 aa19.15■□□□□ 0.66
UBXN8-209ENST00000620074 CLASP1Q7Z460 1538 aa19.14■□□□□ 0.65
UBXN8-209ENST00000620074 FHAD1B1AJZ9 1412 aa19.09■□□□□ 0.65
UBXN8-209ENST00000620074 GRIN2AQ12879 1464 aa19.09■□□□□ 0.65
UBXN8-209ENST00000620074 TRIM41Q8WV44 630 aa19.07■□□□□ 0.64
UBXN8-209ENST00000620074 KIF27Q86VH2 1401 aa19.04■□□□□ 0.64
UBXN8-209ENST00000620074 NUP160Q12769 1436 aa19.01■□□□□ 0.63
UBXN8-209ENST00000620074 CEP170Q5SW79 1584 aa19■□□□□ 0.63
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