Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PACSIN3Q9UKS6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PACSIN3Q9UKS6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PACSIN3Q9UKS6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PACSIN3Q9UKS6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PACSIN3Q9UKS6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PACSIN3Q9UKS6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PACSIN3Q9UKS6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PACSIN3Q9UKS6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PACSIN3Q9UKS6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PACSIN3Q9UKS6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PACSIN3Q9UKS6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PACSIN3Q9UKS6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PACSIN3Q9UKS6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PACSIN3Q9UKS6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PACSIN3Q9UKS6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PACSIN3Q9UKS6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PACSIN3Q9UKS6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PACSIN3Q9UKS6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PACSIN3Q9UKS6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PACSIN3Q9UKS6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PACSIN3Q9UKS6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PACSIN3Q9UKS6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PACSIN3Q9UKS6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PACSIN3Q9UKS6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PACSIN3Q9UKS6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PACSIN3Q9UKS6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PACSIN3Q9UKS6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PACSIN3Q9UKS6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PACSIN3Q9UKS6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PACSIN3Q9UKS6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PACSIN3Q9UKS6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PACSIN3Q9UKS6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PACSIN3Q9UKS6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PACSIN3Q9UKS6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PACSIN3Q9UKS6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PACSIN3Q9UKS6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PACSIN3Q9UKS6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PACSIN3Q9UKS6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PACSIN3Q9UKS6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PACSIN3Q9UKS6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PACSIN3Q9UKS6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PACSIN3Q9UKS6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PACSIN3Q9UKS6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PACSIN3Q9UKS6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PACSIN3Q9UKS6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PACSIN3Q9UKS6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PACSIN3Q9UKS6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PACSIN3Q9UKS6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PACSIN3Q9UKS6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PACSIN3Q9UKS6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PACSIN3Q9UKS6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PACSIN3Q9UKS6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PACSIN3Q9UKS6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PACSIN3Q9UKS6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PACSIN3Q9UKS6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PACSIN3Q9UKS6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PACSIN3Q9UKS6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PACSIN3Q9UKS6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PACSIN3Q9UKS6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PACSIN3Q9UKS6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PACSIN3Q9UKS6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PACSIN3Q9UKS6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PACSIN3Q9UKS6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PACSIN3Q9UKS6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PACSIN3Q9UKS6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PACSIN3Q9UKS6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PACSIN3Q9UKS6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PACSIN3Q9UKS6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PACSIN3Q9UKS6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PACSIN3Q9UKS6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PACSIN3Q9UKS6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PACSIN3Q9UKS6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PACSIN3Q9UKS6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PACSIN3Q9UKS6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PACSIN3Q9UKS6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PACSIN3Q9UKS6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PACSIN3Q9UKS6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PACSIN3Q9UKS6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PACSIN3Q9UKS6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PACSIN3Q9UKS6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PACSIN3Q9UKS6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PACSIN3Q9UKS6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PACSIN3Q9UKS6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PACSIN3Q9UKS6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PACSIN3Q9UKS6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PACSIN3Q9UKS6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PACSIN3Q9UKS6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PACSIN3Q9UKS6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PACSIN3Q9UKS6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PACSIN3Q9UKS6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PACSIN3Q9UKS6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PACSIN3Q9UKS6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PACSIN3Q9UKS6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PACSIN3Q9UKS6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PACSIN3Q9UKS6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PACSIN3Q9UKS6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PACSIN3Q9UKS6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PACSIN3Q9UKS6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PACSIN3Q9UKS6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms