Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNAJC28Q9NX36 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNAJC28Q9NX36 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNAJC28Q9NX36 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNAJC28Q9NX36 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNAJC28Q9NX36 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DNAJC28Q9NX36 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DNAJC28Q9NX36 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DNAJC28Q9NX36 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNAJC28Q9NX36 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNAJC28Q9NX36 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNAJC28Q9NX36 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNAJC28Q9NX36 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNAJC28Q9NX36 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNAJC28Q9NX36 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNAJC28Q9NX36 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNAJC28Q9NX36 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAJC28Q9NX36 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAJC28Q9NX36 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAJC28Q9NX36 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAJC28Q9NX36 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAJC28Q9NX36 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAJC28Q9NX36 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
DNAJC28Q9NX36 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
DNAJC28Q9NX36 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNAJC28Q9NX36 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNAJC28Q9NX36 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
DNAJC28Q9NX36 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNAJC28Q9NX36 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNAJC28Q9NX36 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
DNAJC28Q9NX36 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNAJC28Q9NX36 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNAJC28Q9NX36 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNAJC28Q9NX36 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNAJC28Q9NX36 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DNAJC28Q9NX36 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNAJC28Q9NX36 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNAJC28Q9NX36 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
DNAJC28Q9NX36 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNAJC28Q9NX36 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DNAJC28Q9NX36 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNAJC28Q9NX36 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNAJC28Q9NX36 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNAJC28Q9NX36 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNAJC28Q9NX36 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DNAJC28Q9NX36 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNAJC28Q9NX36 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNAJC28Q9NX36 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNAJC28Q9NX36 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNAJC28Q9NX36 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNAJC28Q9NX36 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNAJC28Q9NX36 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DNAJC28Q9NX36 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNAJC28Q9NX36 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNAJC28Q9NX36 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNAJC28Q9NX36 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DNAJC28Q9NX36 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DNAJC28Q9NX36 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DNAJC28Q9NX36 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
DNAJC28Q9NX36 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DNAJC28Q9NX36 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DNAJC28Q9NX36 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNAJC28Q9NX36 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNAJC28Q9NX36 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNAJC28Q9NX36 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNAJC28Q9NX36 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DNAJC28Q9NX36 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNAJC28Q9NX36 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNAJC28Q9NX36 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNAJC28Q9NX36 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNAJC28Q9NX36 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNAJC28Q9NX36 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DNAJC28Q9NX36 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DNAJC28Q9NX36 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DNAJC28Q9NX36 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DNAJC28Q9NX36 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNAJC28Q9NX36 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNAJC28Q9NX36 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNAJC28Q9NX36 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNAJC28Q9NX36 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DNAJC28Q9NX36 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNAJC28Q9NX36 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNAJC28Q9NX36 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNAJC28Q9NX36 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
DNAJC28Q9NX36 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DNAJC28Q9NX36 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DNAJC28Q9NX36 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DNAJC28Q9NX36 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
DNAJC28Q9NX36 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNAJC28Q9NX36 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNAJC28Q9NX36 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNAJC28Q9NX36 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNAJC28Q9NX36 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNAJC28Q9NX36 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNAJC28Q9NX36 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
DNAJC28Q9NX36 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNAJC28Q9NX36 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNAJC28Q9NX36 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DNAJC28Q9NX36 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DNAJC28Q9NX36 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms