Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 FADS1-214ENST00000540767 742 ntTSL 319.48■□□□□ 0.716e-8■■■■■ 46.7
DROSHAQ9NRR4 KISS1R-202ENST00000592648 507 ntTSL 531.68■■■□□ 2.668e-7■■■■■ 46.6
DROSHAQ9NRR4 GNB2-208ENST00000431068 910 ntTSL 527.62■■■□□ 2.012e-9■■■■■ 46.6
DROSHAQ9NRR4 COA1-204ENST00000415076 1737 ntTSL 313.09□□□□□ -0.315e-10■■■■■ 46.6
DROSHAQ9NRR4 COA1-210ENST00000446330 1520 ntTSL 211.95□□□□□ -0.55e-10■■■■■ 46.6
DROSHAQ9NRR4 COA1-211ENST00000446564 1177 ntTSL 211.64□□□□□ -0.555e-10■■■■■ 46.6
DROSHAQ9NRR4 GATD1-210ENST00000529362 578 ntTSL 336.38■■■■□ 3.415e-8■■■■■ 46.6
DROSHAQ9NRR4 GATD1-209ENST00000528602 569 ntTSL 221.91■■□□□ 1.15e-8■■■■■ 46.6
DROSHAQ9NRR4 MIR193BHG-208ENST00000641175 619 nt25.79■■□□□ 1.721e-7■■■■■ 46.6
DROSHAQ9NRR4 MIR193BHG-201ENST00000570945 3219 ntTSL 323.59■■□□□ 1.372e-7■■■■■ 46.6
DROSHAQ9NRR4 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC16.34■□□□□ 0.212e-7■■■■■ 46.6
DROSHAQ9NRR4 MIR193BHG-204ENST00000634265 892 ntTSL 512.48□□□□□ -0.412e-7■■■■■ 46.6
DROSHAQ9NRR4 ADAM15-211ENST00000461564 2751 ntTSL 220.11■□□□□ 0.813e-7■■■■■ 46.5
DROSHAQ9NRR4 ADAM15-212ENST00000462116 429 ntTSL 519.97■□□□□ 0.793e-7■■■■■ 46.5
DROSHAQ9NRR4 ADAM15-214ENST00000468053 367 ntTSL 514.88□□□□□ -0.033e-7■■■■■ 46.5
DROSHAQ9NRR4 GATD1-213ENST00000532320 1273 ntTSL 1 (best)25.69■■□□□ 1.75e-8■■■■■ 46.5
DROSHAQ9NRR4 GATD1-216ENST00000534603 863 ntTSL 1 (best)25.28■■□□□ 1.645e-8■■■■■ 46.5
DROSHAQ9NRR4 GATD1-214ENST00000532839 559 ntTSL 1 (best)21.79■■□□□ 1.085e-8■■■■■ 46.5
DROSHAQ9NRR4 GATD1-211ENST00000529966 800 ntTSL 1 (best)21.43■■□□□ 1.025e-8■■■■■ 46.5
DROSHAQ9NRR4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.412e-6■■■■■ 46.3
DROSHAQ9NRR4 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.22e-6■■■■■ 46.3
DROSHAQ9NRR4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.566e-15■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.681e-21■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.92■■■■■ 5.745e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 TSPAN4-217ENST00000527644 968 ntTSL 240.41■■■■■ 4.064e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 LNPK-210ENST00000483230 252 ntTSL 539.61■■■■□ 3.935e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.771e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 TSTA3-203ENST00000525274 671 ntTSL 338.38■■■■□ 3.735e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 LNPK-203ENST00000409660 2028 ntTSL 1 (best)37.81■■■■□ 3.645e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 ELL2-207ENST00000515020 340 ntTSL 237.67■■■■□ 3.625e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 LNPK-202ENST00000392540 528 ntTSL 437.27■■■■□ 3.565e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 ACSF2-218ENST00000510410 1745 ntTSL 236.91■■■■□ 3.55e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 OXSR1-202ENST00000426620 1581 ntTSL 1 (best)36.89■■■■□ 3.55e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 RUSC1-215ENST00000492536 1069 ntTSL 336.63■■■■□ 3.455e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 RUSC1-210ENST00000473331 782 ntTSL 236.1■■■■□ 3.375e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.375e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.351e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.341e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 C1QTNF12-205ENST00000486627 639 ntTSL 335■■■■□ 3.195e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.185e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 PFKL-203ENST00000460020 890 ntTSL 534.84■■■■□ 3.175e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 NT5C-202ENST00000577523 776 ntTSL 234.76■■■■□ 3.165e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.065e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.055e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 TMEM56-203ENST00000456991 992 ntTSL 333.98■■■■□ 3.035e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.965e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 ELL2-206ENST00000513343 582 ntTSL 333.34■■■□□ 2.935e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 NT5C-213ENST00000583655 1315 ntTSL 233.14■■■□□ 2.95e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.895e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.865e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.855e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 SRPK2-211ENST00000482862 329 ntTSL 532.88■■■□□ 2.855e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.855e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 ZNF580-206ENST00000592881 1019 ntTSL 332.83■■■□□ 2.853e-8■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 SRPK2-212ENST00000482897 715 ntTSL 532.72■■■□□ 2.835e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 TSPAN4-219ENST00000530404 818 ntTSL 532.71■■■□□ 2.831e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 RUSC1-207ENST00000467820 915 ntTSL 332.69■■■□□ 2.825e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.781e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 OXSR1-206ENST00000492714 471 ntTSL 332.34■■■□□ 2.775e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.765e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.755e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 NFIC-209ENST00000589969 614 ntTSL 332.05■■■□□ 2.725e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 SAP130-205ENST00000450957 559 ntTSL 432.03■■■□□ 2.725e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 WDR18-203ENST00000586317 831 ntTSL 231.98■■■□□ 2.715e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 CORO7-207ENST00000571059 581 ntTSL 331.66■■■□□ 2.665e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 SH3D21-201ENST00000453908 2408 ntAPPRIS P1 TSL 531.65■■■□□ 2.665e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.635e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.623e-8■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.615e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 ELL2-203ENST00000506628 520 ntTSL 531.34■■■□□ 2.615e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 TSTA3-215ENST00000532308 951 ntTSL 531.16■■■□□ 2.585e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.555e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.535e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 PRDM4-205ENST00000550376 2591 ntTSL 1 (best)30.82■■■□□ 2.525e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 AKT1-215ENST00000555926 553 ntTSL 330.36■■■□□ 2.453e-7■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.413e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.385e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 LZTS2-207ENST00000489526 802 ntTSL 229.9■■■□□ 2.385e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.385e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 TSTA3-214ENST00000531473 2220 ntTSL 1 (best)29.71■■■□□ 2.355e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 CORO7-211ENST00000572044 563 ntTSL 429.62■■■□□ 2.335e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 PFKL-206ENST00000467315 1947 ntTSL 229.15■■■□□ 2.264e-7■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 RUSC1-208ENST00000468764 682 ntTSL 329.09■■■□□ 2.255e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.234e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.235e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 NT5C-209ENST00000580758 958 ntTSL 228.89■■■□□ 2.225e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 SERPINH1-213ENST00000532356 998 ntTSL 328.76■■■□□ 2.25e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.195e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 BRF1-214ENST00000549044 521 ntTSL 428.56■■■□□ 2.165e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 FRYL-203ENST00000502520 441 ntTSL 228.51■■■□□ 2.165e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 TSPAN4-215ENST00000525334 860 ntTSL 328.39■■■□□ 2.141e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 TSPAN4-216ENST00000526055 469 ntTSL 228.35■■■□□ 2.134e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 APH1A-201ENST00000236017 663 ntTSL 228.27■■■□□ 2.125e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 NT5C-205ENST00000578407 720 ntTSL 328.21■■■□□ 2.115e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 ECH1-212ENST00000600178 1007 ntTSL 228.11■■■□□ 2.095e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 WDR18-206ENST00000590397 1083 ntTSL 527.72■■■□□ 2.035e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 SERPINH1-210ENST00000528990 587 ntTSL 327.7■■■□□ 2.025e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 LZTS2-204ENST00000429732 701 ntTSL 527.7■■■□□ 2.025e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 TNFAIP2-206ENST00000560428 773 ntTSL 527.7■■■□□ 2.025e-6■■■■■ 46.2
DROSHAQ9NRR4 ZDHHC8-207ENST00000472497 909 ntTSL 227.67■■■□□ 2.025e-6■■■■■ 46.2
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