RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577523.5

NT5C-202, Transcript of 5', 3'-nucleotidase, cytosolic, humanhuman

TSL 2

Gene NT5C, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NT5C-202ENST00000577523 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.07■■■■■ 6.41
NT5C-202ENST00000577523 ABCC9O60706 1549 aa50.03■■■■■ 5.6
NT5C-202ENST00000577523 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.56■■■■■ 5.52
NT5C-202ENST00000577523 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.39■■■■■ 5.18
NT5C-202ENST00000577523 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.38■■■■■ 5.18
NT5C-202ENST00000577523 NACADO15069 1562 aa46.96■■■■■ 5.11
NT5C-202ENST00000577523 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.65■■■■■ 5.06
NT5C-202ENST00000577523 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.54■■■■■ 5.047e-9■■□□□ 13.6
NT5C-202ENST00000577523 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.4■■■■■ 5.02
NT5C-202ENST00000577523 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.17■■■■■ 4.98
NT5C-202ENST00000577523 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.11■■■■■ 4.97
NT5C-202ENST00000577523 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.55■■■■■ 4.88
NT5C-202ENST00000577523 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.43■■■■■ 4.86
NT5C-202ENST00000577523 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.32■■■■■ 4.85
NT5C-202ENST00000577523 SCRIBQ14160 1630 aa45.18■■■■■ 4.82
NT5C-202ENST00000577523 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.17■■■■■ 4.82
NT5C-202ENST00000577523 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.1■■■■■ 4.81
NT5C-202ENST00000577523 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.96■■■■■ 4.79
NT5C-202ENST00000577523 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.74■■■■■ 4.59
NT5C-202ENST00000577523 NCAPD3P42695 1498 aa43.38■■■■■ 4.54
NT5C-202ENST00000577523 CUX2O14529 1486 aa43.24■■■■■ 4.51
NT5C-202ENST00000577523 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.2■■■■■ 4.51
NT5C-202ENST00000577523 ERCC6Q03468 1493 aa43.17■■■■■ 4.5
NT5C-202ENST00000577523 SMARCA4P51532 1647 aa43.06■■■■■ 4.48
NT5C-202ENST00000577523 SMARCA2P51531 1590 aa43.01■■■■■ 4.48
NT5C-202ENST00000577523 HMGXB3Q12766 1538 aa43.01■■■■■ 4.48
NT5C-202ENST00000577523 NESP48681 1621 aa42.89■■■■■ 4.46
NT5C-202ENST00000577523 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.74■■■■■ 4.43
NT5C-202ENST00000577523 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.73■■■■■ 4.43
NT5C-202ENST00000577523 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.63■■■■■ 4.41
NT5C-202ENST00000577523 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.52■■■■■ 4.4
NT5C-202ENST00000577523 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.47■■■■■ 4.39
NT5C-202ENST00000577523 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.44■■■■■ 4.39
NT5C-202ENST00000577523 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.31■■■■■ 4.36
NT5C-202ENST00000577523 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.2■■■■■ 4.35
NT5C-202ENST00000577523 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.04■■■■■ 4.32
NT5C-202ENST00000577523 WIZO95785 1651 aa41.93■■■■■ 4.3
NT5C-202ENST00000577523 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.89■■■■■ 4.3
NT5C-202ENST00000577523 WDR62O43379 1518 aa41.82■■■■■ 4.29
NT5C-202ENST00000577523 TRIM41Q8WV44 630 aa41.64■■■■■ 4.26
NT5C-202ENST00000577523 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.63■■■■■ 4.25
NT5C-202ENST00000577523 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.57■■■■■ 4.25
NT5C-202ENST00000577523 CFTRP13569 1480 aa41.48■■■■■ 4.23
NT5C-202ENST00000577523 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.42■■■■■ 4.22
NT5C-202ENST00000577523 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.33■■■■■ 4.21
NT5C-202ENST00000577523 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.29■■■■■ 4.2
NT5C-202ENST00000577523 OSCARQ8IYS5 282 aa41.2■■■■■ 4.19
NT5C-202ENST00000577523 PRDM2Q13029 1718 aa41.01■■■■■ 4.16
NT5C-202ENST00000577523 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.9■■■■■ 4.14
NT5C-202ENST00000577523 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.86■■■■■ 4.13
NT5C-202ENST00000577523 IFT140Q96RY7 1462 aa40.82■■■■■ 4.12
NT5C-202ENST00000577523 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.76■■■■■ 4.12
NT5C-202ENST00000577523 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.76■■■■■ 4.12
NT5C-202ENST00000577523 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.76■■■■■ 4.12
NT5C-202ENST00000577523 TOPBP1Q92547 1522 aa40.75■■■■■ 4.11
NT5C-202ENST00000577523 ARHGEF11O15085 1522 aa40.58■■■■■ 4.09
NT5C-202ENST00000577523 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.57■■■■■ 4.09
NT5C-202ENST00000577523 ABCC8Q09428 1581 aa40.56■■■■■ 4.08
NT5C-202ENST00000577523 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.54■■■■■ 4.08
NT5C-202ENST00000577523 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.44■■■■■ 4.06
NT5C-202ENST00000577523 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.43■■■■■ 4.062e-7■□□□□ 10.3
NT5C-202ENST00000577523 CHD1O14646 1710 aa40.37■■■■■ 4.05
NT5C-202ENST00000577523 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.31■■■■■ 4.04
NT5C-202ENST00000577523 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.3■■■■■ 4.04
NT5C-202ENST00000577523 FBLN2P98095 1184 aa40.2■■■■■ 4.03
NT5C-202ENST00000577523 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.19■■■■■ 4.03
NT5C-202ENST00000577523 ARAP1Q96P48 1450 aa40.16■■■■■ 4.02
NT5C-202ENST00000577523 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.1■■■■■ 4.01
NT5C-202ENST00000577523 SOGA1O94964 1423 aa40.09■■■■■ 4.01
NT5C-202ENST00000577523 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.99■■■■□ 3.99
NT5C-202ENST00000577523 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.97■■■■□ 3.99
NT5C-202ENST00000577523 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.95■■■■□ 3.99
NT5C-202ENST00000577523 CUX1P39880 1505 aa39.91■■■■□ 3.98
NT5C-202ENST00000577523 WDR97A6NE52 1622 aa39.91■■■■□ 3.98
NT5C-202ENST00000577523 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.9■■■■□ 3.98
NT5C-202ENST00000577523 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.82■■■■□ 3.97
NT5C-202ENST00000577523 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.81■■■■□ 3.96
NT5C-202ENST00000577523 SYNJ1O43426 1573 aa39.78■■■■□ 3.96
NT5C-202ENST00000577523 GRIN2BQ13224 1484 aa39.78■■■■□ 3.96
NT5C-202ENST00000577523 SYNJ2O15056 1496 aa39.7■■■■□ 3.95
NT5C-202ENST00000577523 PBRM1Q86U86 1689 aa39.62■■■■□ 3.93
NT5C-202ENST00000577523 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.6■■■■□ 3.93
NT5C-202ENST00000577523 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.5■■■■□ 3.91
NT5C-202ENST00000577523 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.5■■■■□ 3.91
NT5C-202ENST00000577523 GRIN2AQ12879 1464 aa39.3■■■■□ 3.88
NT5C-202ENST00000577523 ERCC6L2Q5T890 1561 aa39.29■■■■□ 3.88
NT5C-202ENST00000577523 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.25■■■■□ 3.87
NT5C-202ENST00000577523 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.23■■■■□ 3.87
NT5C-202ENST00000577523 ADAMTS12P58397 1594 aa39.22■■■■□ 3.87
NT5C-202ENST00000577523 CEP170Q5SW79 1584 aa39.2■■■■□ 3.87
NT5C-202ENST00000577523 NUP160Q12769 1436 aa39.18■■■■□ 3.86
NT5C-202ENST00000577523 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.14■■■■□ 3.86
NT5C-202ENST00000577523 TOP2BQ02880 1626 aa39.13■■■■□ 3.85
NT5C-202ENST00000577523 SHROOM2Q13796 1616 aa39.07■■■■□ 3.84
NT5C-202ENST00000577523 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.06■■■■□ 3.84
NT5C-202ENST00000577523 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP39.06■■■■□ 3.84
NT5C-202ENST00000577523 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.98■■■■□ 3.83
NT5C-202ENST00000577523 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.84■■■■□ 3.81
NT5C-202ENST00000577523 KIF13AQ9H1H9 1805 aa38.79■■■■□ 3.8
NT5C-202ENST00000577523 JPH4Q96JJ6 628 aa38.76■■■■□ 3.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 427.7 ms