RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460020.5

PFKL-203, Transcript of phosphofructokinase, liver type, humanhuman

TSL 5

Gene PFKL, Length 890 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKL-203ENST00000460020 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.53■■■■■ 6.48
PFKL-203ENST00000460020 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.51■■■■■ 5.52
PFKL-203ENST00000460020 ABCC9O60706 1549 aa48.51■■■■■ 5.36
PFKL-203ENST00000460020 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.62■■■■■ 5.05
PFKL-203ENST00000460020 NACADO15069 1562 aa46.52■■■■■ 5.04
PFKL-203ENST00000460020 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.37■■■■■ 5.01
PFKL-203ENST00000460020 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.25■■■■■ 4.99
PFKL-203ENST00000460020 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.18■■■■■ 4.98
PFKL-203ENST00000460020 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.94■■■■■ 4.95
PFKL-203ENST00000460020 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.68■■■■■ 4.9
PFKL-203ENST00000460020 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.25■■■■■ 4.833e-8■■□□□ 11.4
PFKL-203ENST00000460020 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.24■■■■■ 4.83
PFKL-203ENST00000460020 SCRIBQ14160 1630 aa45.14■■■■■ 4.82
PFKL-203ENST00000460020 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.72■■■■■ 4.75
PFKL-203ENST00000460020 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.6■■■■■ 4.73
PFKL-203ENST00000460020 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.05■■■■■ 4.64
PFKL-203ENST00000460020 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.91■■■■■ 4.62
PFKL-203ENST00000460020 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.59■■■■■ 4.57
PFKL-203ENST00000460020 SMARCA4P51532 1647 aa43.16■■■■■ 4.5
PFKL-203ENST00000460020 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.06■■■■■ 4.48
PFKL-203ENST00000460020 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.91■■■■■ 4.46
PFKL-203ENST00000460020 NCAPD3P42695 1498 aa42.89■■■■■ 4.46
PFKL-203ENST00000460020 SMARCA2P51531 1590 aa42.87■■■■■ 4.45
PFKL-203ENST00000460020 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.8■■■■■ 4.44
PFKL-203ENST00000460020 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.73■■■■■ 4.43
PFKL-203ENST00000460020 HMGXB3Q12766 1538 aa42.71■■■■■ 4.43
PFKL-203ENST00000460020 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.56■■■■■ 4.4
PFKL-203ENST00000460020 WIZO95785 1651 aa42.38■■■■■ 4.37
PFKL-203ENST00000460020 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.22■■■■■ 4.35
PFKL-203ENST00000460020 NESP48681 1621 aa41.95■■■■■ 4.31
PFKL-203ENST00000460020 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.9■■■■■ 4.3
PFKL-203ENST00000460020 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.83■■■■■ 4.29
PFKL-203ENST00000460020 ERCC6Q03468 1493 aa41.81■■■■■ 4.28
PFKL-203ENST00000460020 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.62■■■■■ 4.25
PFKL-203ENST00000460020 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.53■■■■■ 4.24
PFKL-203ENST00000460020 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.5■■■■■ 4.23
PFKL-203ENST00000460020 CUX2O14529 1486 aa41.43■■■■■ 4.22
PFKL-203ENST00000460020 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.4■■■■■ 4.22
PFKL-203ENST00000460020 CFTRP13569 1480 aa41.37■■■■■ 4.21
PFKL-203ENST00000460020 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.36■■■■■ 4.21
PFKL-203ENST00000460020 PRDM2Q13029 1718 aa41.2■■■■■ 4.19
PFKL-203ENST00000460020 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.17■■■■■ 4.18
PFKL-203ENST00000460020 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.15■■■■■ 4.18
PFKL-203ENST00000460020 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.13■■■■■ 4.17
PFKL-203ENST00000460020 WDR62O43379 1518 aa41.02■■■■■ 4.16
PFKL-203ENST00000460020 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41■■■■■ 4.15
PFKL-203ENST00000460020 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.79■■■■■ 4.12
PFKL-203ENST00000460020 TOPBP1Q92547 1522 aa40.52■■■■■ 4.08
PFKL-203ENST00000460020 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.48■■■■■ 4.07
PFKL-203ENST00000460020 ABCC8Q09428 1581 aa40.48■■■■■ 4.07
PFKL-203ENST00000460020 IFT140Q96RY7 1462 aa40.28■■■■■ 4.04
PFKL-203ENST00000460020 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.27■■■■■ 4.04
PFKL-203ENST00000460020 CUX1P39880 1505 aa40.17■■■■■ 4.02
PFKL-203ENST00000460020 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.16■■■■■ 4.02
PFKL-203ENST00000460020 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.12■■■■■ 4.01
PFKL-203ENST00000460020 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.12■■■■■ 4.01
PFKL-203ENST00000460020 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.05■■■■■ 4
PFKL-203ENST00000460020 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.01■■■■■ 4
PFKL-203ENST00000460020 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.98■■■■□ 3.99
PFKL-203ENST00000460020 SOGA1O94964 1423 aa39.95■■■■□ 3.99
PFKL-203ENST00000460020 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.86■■■■□ 3.975e-7■■■■■ 27.6
PFKL-203ENST00000460020 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.83■■■■□ 3.97
PFKL-203ENST00000460020 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.82■■■■□ 3.96
PFKL-203ENST00000460020 WDR97A6NE52 1622 aa39.81■■■■□ 3.96
PFKL-203ENST00000460020 SYNJ1O43426 1573 aa39.8■■■■□ 3.96
PFKL-203ENST00000460020 TOP2BQ02880 1626 aa39.8■■■■□ 3.96
PFKL-203ENST00000460020 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.74■■■■□ 3.95
PFKL-203ENST00000460020 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.64■■■■□ 3.94
PFKL-203ENST00000460020 OSCARQ8IYS5 282 aa39.62■■■■□ 3.93
PFKL-203ENST00000460020 CHD1O14646 1710 aa39.58■■■■□ 3.93
PFKL-203ENST00000460020 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.55■■■■□ 3.92
PFKL-203ENST00000460020 PBRM1Q86U86 1689 aa39.55■■■■□ 3.92
PFKL-203ENST00000460020 GRIN2BQ13224 1484 aa39.53■■■■□ 3.92
PFKL-203ENST00000460020 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.51■■■■□ 3.92
PFKL-203ENST00000460020 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.51■■■■□ 3.92
PFKL-203ENST00000460020 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.45■■■■□ 3.91
PFKL-203ENST00000460020 FBLN2P98095 1184 aa39.37■■■■□ 3.89
PFKL-203ENST00000460020 SYNJ2O15056 1496 aa39.3■■■■□ 3.88
PFKL-203ENST00000460020 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.24■■■■□ 3.87
PFKL-203ENST00000460020 ADAMTS12P58397 1594 aa39.19■■■■□ 3.86
PFKL-203ENST00000460020 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.18■■■■□ 3.86
PFKL-203ENST00000460020 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.12■■■■□ 3.85
PFKL-203ENST00000460020 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.12■■■■□ 3.85
PFKL-203ENST00000460020 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.12■■■■□ 3.85
PFKL-203ENST00000460020 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.09■■■■□ 3.85
PFKL-203ENST00000460020 ARHGEF11O15085 1522 aa39.06■■■■□ 3.84
PFKL-203ENST00000460020 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.04■■■■□ 3.84
PFKL-203ENST00000460020 GRIN2AQ12879 1464 aa39.04■■■■□ 3.84
PFKL-203ENST00000460020 KIF27Q86VH2 1401 aa38.99■■■■□ 3.83
PFKL-203ENST00000460020 TRIM41Q8WV44 630 aa38.91■■■■□ 3.82
PFKL-203ENST00000460020 CEP170Q5SW79 1584 aa38.88■■■■□ 3.81
PFKL-203ENST00000460020 NUP160Q12769 1436 aa38.86■■■■□ 3.81
PFKL-203ENST00000460020 CUL7Q14999 1698 aa38.84■■■■□ 3.81
PFKL-203ENST00000460020 IGF1RP08069 1367 aa38.82■■■■□ 3.81
PFKL-203ENST00000460020 ARAP1Q96P48 1450 aa38.74■■■■□ 3.79
PFKL-203ENST00000460020 SHROOM2Q13796 1616 aa38.64■■■■□ 3.78
PFKL-203ENST00000460020 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.63■■■■□ 3.77
PFKL-203ENST00000460020 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.62■■■■□ 3.77
PFKL-203ENST00000460020 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.6■■■■□ 3.77
PFKL-203ENST00000460020 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.54■■■■□ 3.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms