RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392540.6

LNPK-202, Transcript of lunapark, ER junction formation factor, humanhuman

TSL 4

Gene LNPK, Length 528 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPK-202ENST00000392540 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.81■■■■■ 7.17
LNPK-202ENST00000392540 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.39■■■■■ 6.14
LNPK-202ENST00000392540 ABCC9O60706 1549 aa52.92■■■■■ 6.06
LNPK-202ENST00000392540 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.58■■■■■ 5.69
LNPK-202ENST00000392540 NACADO15069 1562 aa50.38■■■■■ 5.66
LNPK-202ENST00000392540 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.28■■■■■ 5.64
LNPK-202ENST00000392540 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.87■■■■■ 5.57
LNPK-202ENST00000392540 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.66■■■■■ 5.54
LNPK-202ENST00000392540 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.47■■■■■ 5.51
LNPK-202ENST00000392540 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.43■■■■■ 5.5
LNPK-202ENST00000392540 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.4■■■■■ 5.5
LNPK-202ENST00000392540 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.27■■■■■ 5.48
LNPK-202ENST00000392540 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.14■■■■■ 5.46
LNPK-202ENST00000392540 SCRIBQ14160 1630 aa48.69■■■■■ 5.39
LNPK-202ENST00000392540 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.46■■■■■ 5.35
LNPK-202ENST00000392540 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.87■■■■■ 5.25
LNPK-202ENST00000392540 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.84■■■■■ 5.25
LNPK-202ENST00000392540 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.61■■■■■ 5.21
LNPK-202ENST00000392540 NCAPD3P42695 1498 aa46.54■■■■■ 5.04
LNPK-202ENST00000392540 SMARCA4P51532 1647 aa46.53■■■■■ 5.04
LNPK-202ENST00000392540 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.46■■■■■ 5.03
LNPK-202ENST00000392540 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.36■■■■■ 5.01
LNPK-202ENST00000392540 SMARCA2P51531 1590 aa46.32■■■■■ 5.01
LNPK-202ENST00000392540 HMGXB3Q12766 1538 aa46.19■■■■■ 4.99
LNPK-202ENST00000392540 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.1■■■■■ 4.97
LNPK-202ENST00000392540 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.09■■■■■ 4.97
LNPK-202ENST00000392540 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46■■■■■ 4.95
LNPK-202ENST00000392540 NESP48681 1621 aa45.63■■■■■ 4.9
LNPK-202ENST00000392540 ERCC6Q03468 1493 aa45.61■■■■■ 4.89
LNPK-202ENST00000392540 WIZO95785 1651 aa45.57■■■■■ 4.89
LNPK-202ENST00000392540 CUX2O14529 1486 aa45.37■■■■■ 4.85
LNPK-202ENST00000392540 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.37■■■■■ 4.85
LNPK-202ENST00000392540 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.35■■■■■ 4.85
LNPK-202ENST00000392540 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.15■■■■■ 4.82
LNPK-202ENST00000392540 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.09■■■■■ 4.81
LNPK-202ENST00000392540 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.03■■■■■ 4.8
LNPK-202ENST00000392540 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.03■■■■■ 4.8
LNPK-202ENST00000392540 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45■■■■■ 4.79
LNPK-202ENST00000392540 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.82■■■■■ 4.77
LNPK-202ENST00000392540 CFTRP13569 1480 aa44.74■■■■■ 4.75
LNPK-202ENST00000392540 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.66■■■■■ 4.74
LNPK-202ENST00000392540 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.61■■■■■ 4.73
LNPK-202ENST00000392540 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.59■■■■■ 4.73
LNPK-202ENST00000392540 WDR62O43379 1518 aa44.55■■■■■ 4.72
LNPK-202ENST00000392540 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.53■■■■■ 4.72
LNPK-202ENST00000392540 PRDM2Q13029 1718 aa44.27■■■■■ 4.68
LNPK-202ENST00000392540 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.22■■■■■ 4.67
LNPK-202ENST00000392540 TOPBP1Q92547 1522 aa43.83■■■■■ 4.61
LNPK-202ENST00000392540 ABCC8Q09428 1581 aa43.75■■■■■ 4.59
LNPK-202ENST00000392540 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.73■■■■■ 4.59
LNPK-202ENST00000392540 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.69■■■■■ 4.58
LNPK-202ENST00000392540 IFT140Q96RY7 1462 aa43.69■■■■■ 4.58
LNPK-202ENST00000392540 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.6■■■■■ 4.57
LNPK-202ENST00000392540 OSCARQ8IYS5 282 aa43.44■■■■■ 4.54
LNPK-202ENST00000392540 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.42■■■■■ 4.54
LNPK-202ENST00000392540 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.41■■■■■ 4.54
LNPK-202ENST00000392540 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.34■■■■■ 4.53
LNPK-202ENST00000392540 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.28■■■■■ 4.522e-7■■■■■ 31.4
LNPK-202ENST00000392540 CUX1P39880 1505 aa43.27■■■■■ 4.52
LNPK-202ENST00000392540 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.27■■■■■ 4.52
LNPK-202ENST00000392540 SOGA1O94964 1423 aa43.24■■■■■ 4.51
LNPK-202ENST00000392540 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.21■■■■■ 4.51
LNPK-202ENST00000392540 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.1■■■■■ 4.49
LNPK-202ENST00000392540 TRIM41Q8WV44 630 aa43.03■■■■■ 4.48
LNPK-202ENST00000392540 WDR97A6NE52 1622 aa42.96■■■■■ 4.47
LNPK-202ENST00000392540 CHD1O14646 1710 aa42.92■■■■■ 4.46
LNPK-202ENST00000392540 FBLN2P98095 1184 aa42.87■■■■■ 4.45
LNPK-202ENST00000392540 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.81■■■■■ 4.44
LNPK-202ENST00000392540 GRIN2BQ13224 1484 aa42.78■■■■■ 4.44
LNPK-202ENST00000392540 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.78■■■■■ 4.44
LNPK-202ENST00000392540 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.78■■■■■ 4.44
LNPK-202ENST00000392540 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.78■■■■■ 4.44
LNPK-202ENST00000392540 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.76■■■■■ 4.44
LNPK-202ENST00000392540 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.74■■■■■ 4.43
LNPK-202ENST00000392540 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.72■■■■■ 4.43
LNPK-202ENST00000392540 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.72■■■■■ 4.43
LNPK-202ENST00000392540 TOP2BQ02880 1626 aa42.71■■■■■ 4.43
LNPK-202ENST00000392540 ARHGEF11O15085 1522 aa42.71■■■■■ 4.43
LNPK-202ENST00000392540 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.7■■■■■ 4.43
LNPK-202ENST00000392540 SYNJ1O43426 1573 aa42.69■■■■■ 4.42
LNPK-202ENST00000392540 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.65■■■■■ 4.42
LNPK-202ENST00000392540 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.64■■■■■ 4.42
LNPK-202ENST00000392540 PBRM1Q86U86 1689 aa42.63■■■■■ 4.41
LNPK-202ENST00000392540 SYNJ2O15056 1496 aa42.58■■■■■ 4.41
LNPK-202ENST00000392540 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.46■■■■■ 4.39
LNPK-202ENST00000392540 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.4■■■■■ 4.38
LNPK-202ENST00000392540 ARAP1Q96P48 1450 aa42.32■■■■■ 4.37
LNPK-202ENST00000392540 ADAMTS12P58397 1594 aa42.26■■■■■ 4.36
LNPK-202ENST00000392540 GRIN2AQ12879 1464 aa42.23■■■■■ 4.35
LNPK-202ENST00000392540 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.22■■■■■ 4.35
LNPK-202ENST00000392540 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.19■■■■■ 4.34
LNPK-202ENST00000392540 NUP160Q12769 1436 aa42.09■■■■■ 4.33
LNPK-202ENST00000392540 CEP170Q5SW79 1584 aa42.07■■■■■ 4.33
LNPK-202ENST00000392540 KIF27Q86VH2 1401 aa41.89■■■■■ 4.3
LNPK-202ENST00000392540 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.87■■■■■ 4.29
LNPK-202ENST00000392540 IGF1RP08069 1367 aa41.87■■■■■ 4.29
LNPK-202ENST00000392540 SHROOM2Q13796 1616 aa41.84■■■■■ 4.29
LNPK-202ENST00000392540 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.73■■■■■ 4.27
LNPK-202ENST00000392540 JPH4Q96JJ6 628 aa41.7■■■■■ 4.27
LNPK-202ENST00000392540 CUL7Q14999 1698 aa41.68■■■■■ 4.26
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