RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373891.2

CHPF-202, Transcript of chondroitin polymerizing factor, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CHPF, Length 1,079 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF-202ENST00000373891 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.08■■■■■ 5.77
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CHPF-202ENST00000373891 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.86■■■■■ 4.61
CHPF-202ENST00000373891 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.6■■■■■ 4.57
CHPF-202ENST00000373891 NACADO15069 1562 aa43.46■■■■■ 4.55
CHPF-202ENST00000373891 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.36■■■■■ 4.53
CHPF-202ENST00000373891 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.06■■■■■ 4.48
CHPF-202ENST00000373891 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.05■■■■■ 4.48
CHPF-202ENST00000373891 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.67■■■■■ 4.42
CHPF-202ENST00000373891 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.64■■■■■ 4.42
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CHPF-202ENST00000373891 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.08■■■■■ 4.33
CHPF-202ENST00000373891 SCRIBQ14160 1630 aa41.99■■■■■ 4.31
CHPF-202ENST00000373891 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.85■■■■■ 4.29
CHPF-202ENST00000373891 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.79■■■■■ 4.28
CHPF-202ENST00000373891 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.66■■■■■ 4.26
CHPF-202ENST00000373891 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.6■■■■■ 4.25
CHPF-202ENST00000373891 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.12■■■■■ 4.01
CHPF-202ENST00000373891 NCAPD3P42695 1498 aa40.09■■■■■ 4.01
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CHPF-202ENST00000373891 ERCC6Q03468 1493 aa39.95■■■■□ 3.99
CHPF-202ENST00000373891 SMARCA2P51531 1590 aa39.86■■■■□ 3.97
CHPF-202ENST00000373891 CUX2O14529 1486 aa39.86■■■■□ 3.97
CHPF-202ENST00000373891 HMGXB3Q12766 1538 aa39.81■■■■□ 3.96
CHPF-202ENST00000373891 NESP48681 1621 aa39.71■■■■□ 3.95
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CHPF-202ENST00000373891 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.42■■■■□ 3.9
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CHPF-202ENST00000373891 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.29■■■■□ 3.88
CHPF-202ENST00000373891 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.24■■■■□ 3.87
CHPF-202ENST00000373891 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.03■■■■□ 3.84
CHPF-202ENST00000373891 WIZO95785 1651 aa39.01■■■■□ 3.84
CHPF-202ENST00000373891 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.89■■■■□ 3.82
CHPF-202ENST00000373891 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.76■■■■□ 3.8
CHPF-202ENST00000373891 WDR62O43379 1518 aa38.67■■■■□ 3.78
CHPF-202ENST00000373891 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.58■■■■□ 3.77
CHPF-202ENST00000373891 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.51■■■■□ 3.76
CHPF-202ENST00000373891 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.46■■■■□ 3.75
CHPF-202ENST00000373891 TRIM41Q8WV44 630 aa38.42■■■■□ 3.74
CHPF-202ENST00000373891 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.4■■■■□ 3.74
CHPF-202ENST00000373891 CFTRP13569 1480 aa38.4■■■■□ 3.74
CHPF-202ENST00000373891 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.23■■■■□ 3.71
CHPF-202ENST00000373891 PRDM2Q13029 1718 aa38.15■■■■□ 3.7
CHPF-202ENST00000373891 OSCARQ8IYS5 282 aa38.01■■■■□ 3.68
CHPF-202ENST00000373891 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.97■■■■□ 3.67
CHPF-202ENST00000373891 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.82■■■■□ 3.65
CHPF-202ENST00000373891 IFT140Q96RY7 1462 aa37.77■■■■□ 3.64
CHPF-202ENST00000373891 TOPBP1Q92547 1522 aa37.77■■■■□ 3.64
CHPF-202ENST00000373891 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.67■■■■□ 3.62
CHPF-202ENST00000373891 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.67■■■■□ 3.62
CHPF-202ENST00000373891 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.67■■■■□ 3.62
CHPF-202ENST00000373891 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.62■■■■□ 3.61
CHPF-202ENST00000373891 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.6■■■■□ 3.61
CHPF-202ENST00000373891 ABCC8Q09428 1581 aa37.56■■■■□ 3.6
CHPF-202ENST00000373891 ARHGEF11O15085 1522 aa37.47■■■■□ 3.59
CHPF-202ENST00000373891 CHD1O14646 1710 aa37.46■■■■□ 3.59
CHPF-202ENST00000373891 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.46■■■■□ 3.59
CHPF-202ENST00000373891 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.44■■■■□ 3.58
CHPF-202ENST00000373891 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.36■■■■□ 3.57
CHPF-202ENST00000373891 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.28■■■■□ 3.56
CHPF-202ENST00000373891 FBLN2P98095 1184 aa37.28■■■■□ 3.56
CHPF-202ENST00000373891 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.23■■■■□ 3.55
CHPF-202ENST00000373891 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.17■■■■□ 3.54
CHPF-202ENST00000373891 SOGA1O94964 1423 aa37.17■■■■□ 3.54
CHPF-202ENST00000373891 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.12■■■■□ 3.53
CHPF-202ENST00000373891 ARAP1Q96P48 1450 aa37.1■■■■□ 3.53
CHPF-202ENST00000373891 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.06■■■■□ 3.52
CHPF-202ENST00000373891 CUX1P39880 1505 aa37.05■■■■□ 3.52
CHPF-202ENST00000373891 WDR97A6NE52 1622 aa36.96■■■■□ 3.51
CHPF-202ENST00000373891 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.93■■■■□ 3.5
CHPF-202ENST00000373891 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.89■■■■□ 3.5
CHPF-202ENST00000373891 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.89■■■■□ 3.5
CHPF-202ENST00000373891 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.87■■■■□ 3.49
CHPF-202ENST00000373891 GRIN2BQ13224 1484 aa36.86■■■■□ 3.49
CHPF-202ENST00000373891 SYNJ1O43426 1573 aa36.86■■■■□ 3.49
CHPF-202ENST00000373891 PBRM1Q86U86 1689 aa36.84■■■■□ 3.49
CHPF-202ENST00000373891 SYNJ2O15056 1496 aa36.76■■■■□ 3.48
CHPF-202ENST00000373891 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.72■■■■□ 3.47
CHPF-202ENST00000373891 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.71■■■■□ 3.47
CHPF-202ENST00000373891 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.65■■■■□ 3.46
CHPF-202ENST00000373891 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.62■■■■□ 3.45
CHPF-202ENST00000373891 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.42■■■■□ 3.42
CHPF-202ENST00000373891 GRIN2AQ12879 1464 aa36.41■■■■□ 3.42
CHPF-202ENST00000373891 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.4■■■■□ 3.42
CHPF-202ENST00000373891 ADAMTS12P58397 1594 aa36.4■■■■□ 3.42
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CHPF-202ENST00000373891 TOP2BQ02880 1626 aa36.37■■■■□ 3.41
CHPF-202ENST00000373891 CEP170Q5SW79 1584 aa36.35■■■■□ 3.41
CHPF-202ENST00000373891 NUP160Q12769 1436 aa36.25■■■■□ 3.39
CHPF-202ENST00000373891 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.21■■■■□ 3.39
CHPF-202ENST00000373891 SHROOM2Q13796 1616 aa36.17■■■■□ 3.38
CHPF-202ENST00000373891 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.15■■■■□ 3.38
CHPF-202ENST00000373891 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP36■■■■□ 3.35
CHPF-202ENST00000373891 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.98■■■■□ 3.35
CHPF-202ENST00000373891 KIF13AQ9H1H9 1805 aa35.92■■■■□ 3.34
CHPF-202ENST00000373891 JPH4Q96JJ6 628 aa35.9■■■■□ 3.34
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