RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532308.5

TSTA3-215, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 5

Gene TSTA3, Length 951 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-215ENST00000532308 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.03■■■■■ 5.28
TSTA3-215ENST00000532308 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.38■■■■■ 4.38
TSTA3-215ENST00000532308 ABCC9O60706 1549 aa40.67■■■■■ 4.1
TSTA3-215ENST00000532308 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.16■■■■■ 4.02
TSTA3-215ENST00000532308 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.86■■■■□ 3.97
TSTA3-215ENST00000532308 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.79■■■■□ 3.96
TSTA3-215ENST00000532308 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.65■■■■□ 3.94
TSTA3-215ENST00000532308 NACADO15069 1562 aa39.65■■■■□ 3.94
TSTA3-215ENST00000532308 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.51■■■■□ 3.92
TSTA3-215ENST00000532308 SCRIBQ14160 1630 aa38.71■■■■□ 3.79
TSTA3-215ENST00000532308 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.63■■■■□ 3.78
TSTA3-215ENST00000532308 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.43■■■■□ 3.74
TSTA3-215ENST00000532308 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.23■■■■□ 3.71
TSTA3-215ENST00000532308 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.14■■■■□ 3.76e-9■□□□□ 10.6
TSTA3-215ENST00000532308 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.3■■■■□ 3.56
TSTA3-215ENST00000532308 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.19■■■■□ 3.54
TSTA3-215ENST00000532308 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.17■■■■□ 3.54
TSTA3-215ENST00000532308 SMARCA4P51532 1647 aa37.1■■■■□ 3.53
TSTA3-215ENST00000532308 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.02■■■■□ 3.52
TSTA3-215ENST00000532308 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.88■■■■□ 3.49
TSTA3-215ENST00000532308 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.84■■■■□ 3.49
TSTA3-215ENST00000532308 SMARCA2P51531 1590 aa36.72■■■■□ 3.47
TSTA3-215ENST00000532308 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.72■■■■□ 3.47
TSTA3-215ENST00000532308 WIZO95785 1651 aa36.69■■■■□ 3.46
TSTA3-215ENST00000532308 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.69■■■■□ 3.46
TSTA3-215ENST00000532308 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.61■■■■□ 3.45
TSTA3-215ENST00000532308 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.55■■■■□ 3.44
TSTA3-215ENST00000532308 NCAPD3P42695 1498 aa36.55■■■■□ 3.44
TSTA3-215ENST00000532308 HMGXB3Q12766 1538 aa36.45■■■■□ 3.43
TSTA3-215ENST00000532308 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.45■■■■□ 3.43
TSTA3-215ENST00000532308 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.34■■■■□ 3.41
TSTA3-215ENST00000532308 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.91■■■■□ 3.34
TSTA3-215ENST00000532308 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.54■■■■□ 3.28
TSTA3-215ENST00000532308 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.49■■■■□ 3.27
TSTA3-215ENST00000532308 CFTRP13569 1480 aa35.48■■■■□ 3.27
TSTA3-215ENST00000532308 NESP48681 1621 aa35.41■■■■□ 3.26
TSTA3-215ENST00000532308 PRDM2Q13029 1718 aa35.36■■■■□ 3.25
TSTA3-215ENST00000532308 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.23■■■■□ 3.23
TSTA3-215ENST00000532308 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.13■■■■□ 3.21
TSTA3-215ENST00000532308 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.06■■■■□ 3.2
TSTA3-215ENST00000532308 ERCC6Q03468 1493 aa35.02■■■■□ 3.2
TSTA3-215ENST00000532308 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.02■■■■□ 3.2
TSTA3-215ENST00000532308 ABCC8Q09428 1581 aa34.83■■■■□ 3.17
TSTA3-215ENST00000532308 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.79■■■■□ 3.16
TSTA3-215ENST00000532308 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.78■■■■□ 3.16
TSTA3-215ENST00000532308 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.71■■■■□ 3.15
TSTA3-215ENST00000532308 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.71■■■■□ 3.15
TSTA3-215ENST00000532308 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.7■■■■□ 3.14
TSTA3-215ENST00000532308 CUX1P39880 1505 aa34.68■■■■□ 3.14
TSTA3-215ENST00000532308 TOPBP1Q92547 1522 aa34.65■■■■□ 3.14
TSTA3-215ENST00000532308 WDR62O43379 1518 aa34.64■■■■□ 3.14
TSTA3-215ENST00000532308 TOP2BQ02880 1626 aa34.63■■■■□ 3.13
TSTA3-215ENST00000532308 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.63■■■■□ 3.13
TSTA3-215ENST00000532308 SYNJ1O43426 1573 aa34.62■■■■□ 3.13
TSTA3-215ENST00000532308 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.62■■■■□ 3.13
TSTA3-215ENST00000532308 TRIM41Q8WV44 630 aa34.55■■■■□ 3.12
TSTA3-215ENST00000532308 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.45■■■■□ 3.1
TSTA3-215ENST00000532308 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.4■■■■□ 3.1
TSTA3-215ENST00000532308 CUX2O14529 1486 aa34.35■■■■□ 3.09
TSTA3-215ENST00000532308 SOGA1O94964 1423 aa34.31■■■■□ 3.08
TSTA3-215ENST00000532308 IFT140Q96RY7 1462 aa34.26■■■■□ 3.07
TSTA3-215ENST00000532308 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.25■■■■□ 3.07
TSTA3-215ENST00000532308 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.22■■■■□ 3.07
TSTA3-215ENST00000532308 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.16■■■■□ 3.06
TSTA3-215ENST00000532308 WDR97A6NE52 1622 aa34.14■■■■□ 3.06
TSTA3-215ENST00000532308 KIF27Q86VH2 1401 aa34.01■■■■□ 3.03
TSTA3-215ENST00000532308 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.99■■■■□ 3.03
TSTA3-215ENST00000532308 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.99■■■■□ 3.03
TSTA3-215ENST00000532308 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.94■■■■□ 3.02
TSTA3-215ENST00000532308 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.93■■■■□ 3.02
TSTA3-215ENST00000532308 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.92■■■■□ 3.024e-8■■■■■ 34.1
TSTA3-215ENST00000532308 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.92■■■■□ 3.02
TSTA3-215ENST00000532308 EEA1Q15075 1411 aa33.91■■■■□ 3.02
TSTA3-215ENST00000532308 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.9■■■■□ 3.02
TSTA3-215ENST00000532308 PBRM1Q86U86 1689 aa33.83■■■■□ 3.01
TSTA3-215ENST00000532308 GRIN2BQ13224 1484 aa33.81■■■■□ 3
TSTA3-215ENST00000532308 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP33.8■■■■□ 3
TSTA3-215ENST00000532308 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.79■■■■□ 3
TSTA3-215ENST00000532308 IGF1RP08069 1367 aa33.74■■■□□ 2.99
TSTA3-215ENST00000532308 CSRNP3Q8WYN3 585 aa33.74■■■□□ 2.99
TSTA3-215ENST00000532308 CUL7Q14999 1698 aa33.65■■■□□ 2.98
TSTA3-215ENST00000532308 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.63■■■□□ 2.97
TSTA3-215ENST00000532308 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.63■■■□□ 2.97
TSTA3-215ENST00000532308 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.59■■■□□ 2.97
TSTA3-215ENST00000532308 ADAMTS12P58397 1594 aa33.56■■■□□ 2.96
TSTA3-215ENST00000532308 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.56■■■□□ 2.96
TSTA3-215ENST00000532308 PRXQ9BXM0 1461 aa33.52■■■□□ 2.96
TSTA3-215ENST00000532308 SYNJ2O15056 1496 aa33.49■■■□□ 2.95
TSTA3-215ENST00000532308 KIF21BO75037 1637 aa33.48■■■□□ 2.95
TSTA3-215ENST00000532308 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa33.48■■■□□ 2.95
TSTA3-215ENST00000532308 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.45■■■□□ 2.95
TSTA3-215ENST00000532308 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.45■■■□□ 2.95
TSTA3-215ENST00000532308 FBLN2P98095 1184 aa33.41■■■□□ 2.94
TSTA3-215ENST00000532308 CHD1O14646 1710 aa33.38■■■□□ 2.93
TSTA3-215ENST00000532308 GRIN2AQ12879 1464 aa33.36■■■□□ 2.93
TSTA3-215ENST00000532308 GOLGA3Q08378 1498 aa33.35■■■□□ 2.93
TSTA3-215ENST00000532308 EHMT2Q96KQ7 1210 aa33.29■■■□□ 2.92
TSTA3-215ENST00000532308 UBTFP17480 764 aaKnown RBP33.22■■■□□ 2.91
TSTA3-215ENST00000532308 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa33.2■■■□□ 2.91
TSTA3-215ENST00000532308 NUP160Q12769 1436 aa33.17■■■□□ 2.9
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