Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C8orf4Q9NR00 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C8orf4Q9NR00 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C8orf4Q9NR00 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C8orf4Q9NR00 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C8orf4Q9NR00 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C8orf4Q9NR00 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C8orf4Q9NR00 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C8orf4Q9NR00 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C8orf4Q9NR00 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C8orf4Q9NR00 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C8orf4Q9NR00 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
C8orf4Q9NR00 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C8orf4Q9NR00 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C8orf4Q9NR00 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C8orf4Q9NR00 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C8orf4Q9NR00 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C8orf4Q9NR00 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C8orf4Q9NR00 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
C8orf4Q9NR00 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C8orf4Q9NR00 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C8orf4Q9NR00 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C8orf4Q9NR00 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C8orf4Q9NR00 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C8orf4Q9NR00 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C8orf4Q9NR00 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C8orf4Q9NR00 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C8orf4Q9NR00 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C8orf4Q9NR00 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C8orf4Q9NR00 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C8orf4Q9NR00 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C8orf4Q9NR00 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C8orf4Q9NR00 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C8orf4Q9NR00 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C8orf4Q9NR00 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C8orf4Q9NR00 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C8orf4Q9NR00 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C8orf4Q9NR00 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C8orf4Q9NR00 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C8orf4Q9NR00 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C8orf4Q9NR00 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
C8orf4Q9NR00 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C8orf4Q9NR00 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C8orf4Q9NR00 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C8orf4Q9NR00 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C8orf4Q9NR00 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C8orf4Q9NR00 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C8orf4Q9NR00 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C8orf4Q9NR00 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C8orf4Q9NR00 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C8orf4Q9NR00 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C8orf4Q9NR00 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C8orf4Q9NR00 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C8orf4Q9NR00 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C8orf4Q9NR00 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C8orf4Q9NR00 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
C8orf4Q9NR00 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C8orf4Q9NR00 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C8orf4Q9NR00 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C8orf4Q9NR00 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C8orf4Q9NR00 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C8orf4Q9NR00 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C8orf4Q9NR00 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
C8orf4Q9NR00 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C8orf4Q9NR00 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C8orf4Q9NR00 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C8orf4Q9NR00 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C8orf4Q9NR00 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C8orf4Q9NR00 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C8orf4Q9NR00 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C8orf4Q9NR00 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C8orf4Q9NR00 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C8orf4Q9NR00 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C8orf4Q9NR00 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C8orf4Q9NR00 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C8orf4Q9NR00 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C8orf4Q9NR00 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C8orf4Q9NR00 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C8orf4Q9NR00 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C8orf4Q9NR00 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C8orf4Q9NR00 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C8orf4Q9NR00 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C8orf4Q9NR00 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C8orf4Q9NR00 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C8orf4Q9NR00 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C8orf4Q9NR00 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C8orf4Q9NR00 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
C8orf4Q9NR00 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C8orf4Q9NR00 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C8orf4Q9NR00 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C8orf4Q9NR00 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C8orf4Q9NR00 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C8orf4Q9NR00 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C8orf4Q9NR00 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C8orf4Q9NR00 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C8orf4Q9NR00 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C8orf4Q9NR00 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C8orf4Q9NR00 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C8orf4Q9NR00 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C8orf4Q9NR00 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms