Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0R8

GABARAPL1, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL1Q9H0R8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABARAPL1Q9H0R8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABARAPL1Q9H0R8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABARAPL1Q9H0R8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABARAPL1Q9H0R8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABARAPL1Q9H0R8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABARAPL1Q9H0R8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GABARAPL1Q9H0R8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GABARAPL1Q9H0R8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GABARAPL1Q9H0R8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GABARAPL1Q9H0R8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABARAPL1Q9H0R8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABARAPL1Q9H0R8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABARAPL1Q9H0R8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABARAPL1Q9H0R8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABARAPL1Q9H0R8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABARAPL1Q9H0R8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABARAPL1Q9H0R8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABARAPL1Q9H0R8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABARAPL1Q9H0R8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABARAPL1Q9H0R8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABARAPL1Q9H0R8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABARAPL1Q9H0R8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABARAPL1Q9H0R8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABARAPL1Q9H0R8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABARAPL1Q9H0R8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABARAPL1Q9H0R8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABARAPL1Q9H0R8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABARAPL1Q9H0R8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABARAPL1Q9H0R8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABARAPL1Q9H0R8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABARAPL1Q9H0R8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABARAPL1Q9H0R8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABARAPL1Q9H0R8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABARAPL1Q9H0R8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GABARAPL1Q9H0R8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GABARAPL1Q9H0R8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABARAPL1Q9H0R8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABARAPL1Q9H0R8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABARAPL1Q9H0R8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABARAPL1Q9H0R8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABARAPL1Q9H0R8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABARAPL1Q9H0R8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABARAPL1Q9H0R8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GABARAPL1Q9H0R8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABARAPL1Q9H0R8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABARAPL1Q9H0R8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABARAPL1Q9H0R8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABARAPL1Q9H0R8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABARAPL1Q9H0R8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABARAPL1Q9H0R8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABARAPL1Q9H0R8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABARAPL1Q9H0R8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABARAPL1Q9H0R8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABARAPL1Q9H0R8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GABARAPL1Q9H0R8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABARAPL1Q9H0R8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABARAPL1Q9H0R8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABARAPL1Q9H0R8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABARAPL1Q9H0R8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABARAPL1Q9H0R8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GABARAPL1Q9H0R8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABARAPL1Q9H0R8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABARAPL1Q9H0R8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABARAPL1Q9H0R8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABARAPL1Q9H0R8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABARAPL1Q9H0R8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABARAPL1Q9H0R8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABARAPL1Q9H0R8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABARAPL1Q9H0R8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABARAPL1Q9H0R8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABARAPL1Q9H0R8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABARAPL1Q9H0R8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABARAPL1Q9H0R8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABARAPL1Q9H0R8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABARAPL1Q9H0R8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABARAPL1Q9H0R8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GABARAPL1Q9H0R8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABARAPL1Q9H0R8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABARAPL1Q9H0R8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABARAPL1Q9H0R8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABARAPL1Q9H0R8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABARAPL1Q9H0R8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABARAPL1Q9H0R8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABARAPL1Q9H0R8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABARAPL1Q9H0R8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABARAPL1Q9H0R8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABARAPL1Q9H0R8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABARAPL1Q9H0R8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABARAPL1Q9H0R8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABARAPL1Q9H0R8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABARAPL1Q9H0R8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABARAPL1Q9H0R8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABARAPL1Q9H0R8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABARAPL1Q9H0R8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABARAPL1Q9H0R8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABARAPL1Q9H0R8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GABARAPL1Q9H0R8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABARAPL1Q9H0R8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABARAPL1Q9H0R8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms