Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWS0

PHF6, PHD finger protein 6, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF6Q8IWS0 TTC3-207ENST00000418766 3771 ntTSL 515.53■□□□□ 0.083e-6■■■■■ 28.8
PHF6Q8IWS0 TTC3-219ENST00000485402 3626 ntTSL 514.03□□□□□ -0.163e-6■■■■■ 28.8
PHF6Q8IWS0 TTC3-202ENST00000355666 7712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.893e-6■■■■■ 28.8
PHF6Q8IWS0 CBFA2T3-211ENST00000570046 284 ntTSL 311.14□□□□□ -0.639e-7■■■■■ 28.7
PHF6Q8IWS0 UNKL-214ENST00000515195 481 ntTSL 418.11■□□□□ 0.491e-6■■■■■ 28.7
PHF6Q8IWS0 UNKL-213ENST00000513783 582 ntTSL 415.64■□□□□ 0.091e-6■■■■■ 28.7
PHF6Q8IWS0 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.341e-6■■■■■ 28.7
PHF6Q8IWS0 TCF3-202ENST00000344749 4289 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.411e-6■■■■■ 28.7
PHF6Q8IWS0 SEC14L1-204ENST00000436233 5295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.542e-11■■■■■ 28.6
PHF6Q8IWS0 SEC14L1-202ENST00000430767 5283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.572e-11■■■■■ 28.6
PHF6Q8IWS0 SEC14L1-205ENST00000443798 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.682e-11■■■■■ 28.6
PHF6Q8IWS0 SEC14L1-201ENST00000392476 2957 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.792e-11■■■■■ 28.6
PHF6Q8IWS0 RNA5SP389-201ENST00000362610 115 ntBASIC8.15□□□□□ -1.13e-25■■■■■ 28.6
PHF6Q8IWS0 EIF4A1-208ENST00000578476 573 ntTSL 217.51■□□□□ 0.392e-6■■■■■ 28.5
PHF6Q8IWS0 EIF4A1-214ENST00000580461 909 ntTSL 215.22■□□□□ 0.032e-6■■■■■ 28.5
PHF6Q8IWS0 EIF4A1-226ENST00000582848 591 ntTSL 314.21□□□□□ -0.132e-6■■■■■ 28.5
PHF6Q8IWS0 EIF4A1-213ENST00000579139 568 ntTSL 413.18□□□□□ -0.32e-6■■■■■ 28.5
PHF6Q8IWS0 EIF4A1-223ENST00000582169 552 ntTSL 411.36□□□□□ -0.592e-6■■■■■ 28.5
PHF6Q8IWS0 EIF4A1-212ENST00000579085 569 ntTSL 410.84□□□□□ -0.672e-6■■■■■ 28.5
PHF6Q8IWS0 EIF4A1-231ENST00000584054 716 ntTSL 210.29□□□□□ -0.762e-6■■■■■ 28.5
PHF6Q8IWS0 EIF4A1-215ENST00000580886 562 ntTSL 210.29□□□□□ -0.762e-6■■■■■ 28.5
PHF6Q8IWS0 EIF4A1-232ENST00000584712 782 ntTSL 29.47□□□□□ -0.892e-6■■■■■ 28.5
PHF6Q8IWS0 EIF4A1-230ENST00000583899 665 ntTSL 37□□□□□ -1.292e-6■■■■■ 28.5
PHF6Q8IWS0 EIF4A1-224ENST00000582213 560 ntTSL 44.97□□□□□ -1.612e-6■■■■■ 28.5
PHF6Q8IWS0 GSE1-204ENST00000411612 872 ntTSL 524.41■■□□□ 1.52e-6■■■■■ 28.4
PHF6Q8IWS0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.081e-6■■■■■ 28.3
PHF6Q8IWS0 SUN1-222ENST00000457861 2975 ntTSL 215.26■□□□□ 0.031e-6■■■■■ 28.3
PHF6Q8IWS0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.692e-6■■■■■ 28.3
PHF6Q8IWS0 PFKL-210ENST00000496824 1063 ntTSL 523.41■■□□□ 1.343e-8■■■■■ 28.3
PHF6Q8IWS0 RBM38-201ENST00000342690 852 ntTSL 323.33■■□□□ 1.332e-6■■■■■ 28.3
PHF6Q8IWS0 VARS-224ENST00000479051 612 ntTSL 322.22■■□□□ 1.151e-8■■■■■ 28.3
PHF6Q8IWS0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.892e-6■■■■■ 28.3
PHF6Q8IWS0 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.624e-6■■■■■ 28.3
PHF6Q8IWS0 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.544e-6■■■■■ 28.3
PHF6Q8IWS0 RBM38-202ENST00000344785 2193 ntTSL 517.69■□□□□ 0.422e-6■■■■■ 28.3
PHF6Q8IWS0 MTA1-208ENST00000438610 2144 ntTSL 1 (best)17.68■□□□□ 0.424e-6■■■■■ 28.3
PHF6Q8IWS0 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.394e-6■■■■■ 28.3
PHF6Q8IWS0 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.251e-8■■■■■ 28.3
PHF6Q8IWS0 BCL2L11-210ENST00000432179 572 ntTSL 415.72■□□□□ 0.111e-8■■■■■ 28.3
PHF6Q8IWS0 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.14e-6■■■■■ 28.3
PHF6Q8IWS0 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.092e-6■■■■■ 28.3
PHF6Q8IWS0 VARS-225ENST00000482996 728 ntTSL 315.59■□□□□ 0.091e-8■■■■■ 28.3
PHF6Q8IWS0 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.074e-6■■■■■ 28.3
PHF6Q8IWS0 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.031e-8■■■■■ 28.3
PHF6Q8IWS0 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.051e-8■■■■■ 28.3
PHF6Q8IWS0 BCL2L11-203ENST00000357757 947 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.121e-8■■■■■ 28.3
PHF6Q8IWS0 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.131e-8■■■■■ 28.3
PHF6Q8IWS0 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.131e-8■■■■■ 28.3
PHF6Q8IWS0 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.281e-8■■■■■ 28.3
PHF6Q8IWS0 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.361e-8■■■■■ 28.3
PHF6Q8IWS0 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.361e-8■■■■■ 28.3
PHF6Q8IWS0 SATB2-207ENST00000463386 372 ntTSL 412.67□□□□□ -0.381e-8■■■■■ 28.3
PHF6Q8IWS0 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.391e-8■■■■■ 28.3
PHF6Q8IWS0 BCL2L11-217ENST00000610735 5120 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.431e-8■■■■■ 28.3
PHF6Q8IWS0 BCL2L11-206ENST00000393256 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.541e-8■■■■■ 28.3
PHF6Q8IWS0 BCL2L11-223ENST00000622612 4995 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.571e-8■■■■■ 28.3
PHF6Q8IWS0 BCL2L11-220ENST00000620862 5044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.631e-8■■■■■ 28.3
PHF6Q8IWS0 BCL2L11-218ENST00000615946 5026 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.631e-8■■■■■ 28.3
PHF6Q8IWS0 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.461e-7■■■■■ 28.1
PHF6Q8IWS0 LINC00963-210ENST00000608272 612 ntTSL 516.29■□□□□ 0.21e-7■■■■■ 28.1
PHF6Q8IWS0 CMIP-203ENST00000539778 3937 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.441e-7■■■■■ 28.1
PHF6Q8IWS0 LINC00963-206ENST00000453213 469 ntTSL 311.1□□□□□ -0.631e-7■■■■■ 28.1
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PHF6Q8IWS0 LINC00894-205ENST00000449111 3414 ntTSL 59.08□□□□□ -0.961e-7■■■■■ 28.1
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PHF6Q8IWS0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.662e-6■■■■■ 28
PHF6Q8IWS0 EEF1D-217ENST00000526786 1246 ntTSL 225.4■■□□□ 1.662e-6■■■■■ 28
PHF6Q8IWS0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.252e-6■■■■■ 28
PHF6Q8IWS0 EEF1D-235ENST00000530848 688 ntTSL 322.02■■□□□ 1.122e-6■■■■■ 28
PHF6Q8IWS0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.092e-6■■■■■ 28
PHF6Q8IWS0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.052e-6■■■■■ 28
PHF6Q8IWS0 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.022e-6■■■■■ 28
PHF6Q8IWS0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.792e-6■■■■■ 28
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PHF6Q8IWS0 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.72e-6■■■■■ 28
PHF6Q8IWS0 EEF1D-206ENST00000524397 957 ntTSL 319.4■□□□□ 0.72e-6■■■■■ 28
PHF6Q8IWS0 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.72e-6■■■■■ 28
PHF6Q8IWS0 EEF1D-224ENST00000529007 861 ntTSL 219.4■□□□□ 0.72e-6■■■■■ 28
PHF6Q8IWS0 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.582e-6■■■■■ 28
PHF6Q8IWS0 EEF1D-250ENST00000533833 831 ntTSL 518.62■□□□□ 0.572e-6■■■■■ 28
PHF6Q8IWS0 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.412e-6■■■■■ 28
PHF6Q8IWS0 EEF1D-230ENST00000530191 853 ntTSL 317.18■□□□□ 0.342e-6■■■■■ 28
PHF6Q8IWS0 EEF1D-252ENST00000534377 617 ntTSL 216.85■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 28
PHF6Q8IWS0 EEF1D-251ENST00000534232 817 ntTSL 516.41■□□□□ 0.222e-6■■■■■ 28
PHF6Q8IWS0 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.22e-6■■■■■ 28
PHF6Q8IWS0 EEF1D-247ENST00000533204 842 ntTSL 215.56■□□□□ 0.082e-6■■■■■ 28
PHF6Q8IWS0 EEF1D-236ENST00000531218 787 ntTSL 315.45■□□□□ 0.062e-6■■■■■ 28
PHF6Q8IWS0 EEF1D-253ENST00000534380 1001 ntTSL 515.26■□□□□ 0.032e-6■■■■■ 28
PHF6Q8IWS0 EEF1D-248ENST00000533494 758 ntTSL 515.03■□□□□ -02e-6■■■■■ 28
PHF6Q8IWS0 EEF1D-226ENST00000529516 473 ntTSL 311.52□□□□□ -0.572e-6■■■■■ 28
PHF6Q8IWS0 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.312e-6■■■■■ 27.7
PHF6Q8IWS0 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.362e-6■■■■■ 27.6
PHF6Q8IWS0 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.422e-6■■■■■ 27.6
PHF6Q8IWS0 CHD8-206ENST00000553870 679 ntTSL 510.11□□□□□ -0.792e-10■■■■■ 27.5
PHF6Q8IWS0 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.93□□□□□ -1.782e-10■■■■■ 27.5
PHF6Q8IWS0 SNHG16-208ENST00000591956 556 ntTSL 212.67□□□□□ -0.389e-20■■■■■ 27.5
PHF6Q8IWS0 SNHG16-204ENST00000586942 568 ntTSL 4 BASIC10.29□□□□□ -0.769e-20■■■■■ 27.5
PHF6Q8IWS0 SNHG16-201ENST00000448136 3607 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.819e-20■■■■■ 27.5
PHF6Q8IWS0 SNHG16-207ENST00000590435 1947 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.869e-20■■■■■ 27.5
PHF6Q8IWS0 SNHG16-206ENST00000587838 884 ntTSL 38.52□□□□□ -1.059e-20■■■■■ 27.5
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