Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
XIRP1Q702N8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
XIRP1Q702N8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
XIRP1Q702N8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
XIRP1Q702N8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
XIRP1Q702N8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
XIRP1Q702N8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
XIRP1Q702N8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
XIRP1Q702N8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
XIRP1Q702N8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
XIRP1Q702N8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
XIRP1Q702N8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
XIRP1Q702N8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
XIRP1Q702N8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
XIRP1Q702N8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
XIRP1Q702N8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
XIRP1Q702N8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
XIRP1Q702N8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
XIRP1Q702N8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
XIRP1Q702N8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
XIRP1Q702N8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
XIRP1Q702N8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
XIRP1Q702N8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
XIRP1Q702N8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
XIRP1Q702N8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
XIRP1Q702N8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
XIRP1Q702N8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
XIRP1Q702N8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
XIRP1Q702N8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
XIRP1Q702N8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
XIRP1Q702N8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
XIRP1Q702N8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
XIRP1Q702N8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
XIRP1Q702N8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
XIRP1Q702N8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
XIRP1Q702N8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
XIRP1Q702N8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.52■■■■□ 3.28
XIRP1Q702N8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
XIRP1Q702N8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
XIRP1Q702N8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
XIRP1Q702N8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
XIRP1Q702N8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
XIRP1Q702N8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC35.5■■■■□ 3.27
XIRP1Q702N8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
XIRP1Q702N8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
XIRP1Q702N8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
XIRP1Q702N8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
XIRP1Q702N8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
XIRP1Q702N8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
XIRP1Q702N8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
XIRP1Q702N8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
XIRP1Q702N8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
XIRP1Q702N8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
XIRP1Q702N8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
XIRP1Q702N8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
XIRP1Q702N8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
XIRP1Q702N8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
XIRP1Q702N8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
XIRP1Q702N8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
XIRP1Q702N8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
XIRP1Q702N8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
XIRP1Q702N8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
XIRP1Q702N8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
XIRP1Q702N8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
XIRP1Q702N8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
XIRP1Q702N8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
XIRP1Q702N8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
XIRP1Q702N8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
XIRP1Q702N8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
XIRP1Q702N8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC35.41■■■■□ 3.26
XIRP1Q702N8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
XIRP1Q702N8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
XIRP1Q702N8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
XIRP1Q702N8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
XIRP1Q702N8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
XIRP1Q702N8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
XIRP1Q702N8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
XIRP1Q702N8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
XIRP1Q702N8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
XIRP1Q702N8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
XIRP1Q702N8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
XIRP1Q702N8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
XIRP1Q702N8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
XIRP1Q702N8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC35.37■■■■□ 3.25
XIRP1Q702N8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
XIRP1Q702N8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
XIRP1Q702N8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC35.36■■■■□ 3.25
XIRP1Q702N8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
XIRP1Q702N8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
XIRP1Q702N8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
XIRP1Q702N8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
XIRP1Q702N8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
XIRP1Q702N8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
XIRP1Q702N8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
XIRP1Q702N8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
XIRP1Q702N8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
XIRP1Q702N8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
XIRP1Q702N8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
XIRP1Q702N8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
XIRP1Q702N8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms