Protein–RNA interactions for Protein: Q16629

SRSF7, Serine/arginine-rich splicing factor 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF7Q16629 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.657e-7■■■■□ 22.6
SRSF7Q16629 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.667e-7■■■■□ 22.6
SRSF7Q16629 KCTD2-209ENST00000584767 815 ntTSL 1 (best)9.98□□□□□ -0.812e-17■■■■□ 22.6
SRSF7Q16629 KCTD2-205ENST00000579242 524 ntTSL 49.88□□□□□ -0.832e-17■■■■□ 22.6
SRSF7Q16629 KCTD2-207ENST00000582840 565 ntTSL 47.96□□□□□ -1.142e-17■■■■□ 22.6
SRSF7Q16629 KCTD2-208ENST00000584570 666 ntTSL 37.13□□□□□ -1.272e-17■■■■□ 22.6
SRSF7Q16629 KCTD2-206ENST00000581589 993 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.422e-17■■■■□ 22.6
SRSF7Q16629 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.73e-6■■■■□ 22.5
SRSF7Q16629 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.163e-6■■■■□ 22.5
SRSF7Q16629 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.13e-6■■■■□ 22.5
SRSF7Q16629 NPEPL1-207ENST00000529976 4684 ntTSL 1 (best)13.53□□□□□ -0.243e-6■■■■□ 22.5
SRSF7Q16629 NPEPL1-206ENST00000527587 4633 ntTSL 512.92□□□□□ -0.343e-6■■■■□ 22.5
SRSF7Q16629 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.563e-6■■■■□ 22.5
SRSF7Q16629 KPNB1-202ENST00000535458 3163 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.28e-13■■■■□ 22.5
SRSF7Q16629 KPNB1-211ENST00000582097 2347 ntTSL 27.09□□□□□ -1.288e-13■■■■□ 22.5
SRSF7Q16629 KPNB1-210ENST00000580573 556 ntTSL 36.72□□□□□ -1.338e-13■■■■□ 22.5
SRSF7Q16629 KPNB1-203ENST00000540627 2989 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.418e-13■■■■□ 22.5
SRSF7Q16629 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.022e-7■■■■□ 22.5
SRSF7Q16629 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.342e-7■■■■□ 22.5
SRSF7Q16629 FARP1-201ENST00000319562 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.792e-7■■■■□ 22.5
SRSF7Q16629 RERE-218ENST00000514428 273 ntTSL 33.09□□□□□ -1.917e-9■■■■□ 22.5
SRSF7Q16629 DSCR4-201ENST00000328264 1098 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.966e-7■■■■□ 22.5
SRSF7Q16629 DSCR4-202ENST00000398948 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.336e-7■■■■□ 22.5
SRSF7Q16629 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.263e-6■■■■□ 22.4
SRSF7Q16629 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.373e-6■■■■□ 22.4
SRSF7Q16629 TMCO3-205ENST00000465556 314 ntTSL 39.41□□□□□ -0.93e-6■■■■□ 22.4
SRSF7Q16629 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.697e-7■■■■□ 22.3
SRSF7Q16629 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.127e-7■■■■□ 22.3
SRSF7Q16629 ZFP91-CNTF-202ENST00000422974 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 59.65□□□□□ -0.877e-7■■■■□ 22.3
SRSF7Q16629 RNASET2-212ENST00000510083 2280 ntTSL 213.39□□□□□ -0.277e-7■■■■□ 22.3
SRSF7Q16629 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.542e-6■■■■□ 22.3
SRSF7Q16629 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.547e-7■■■■□ 22.3
SRSF7Q16629 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.547e-7■■■■□ 22.3
SRSF7Q16629 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.557e-7■■■■□ 22.3
SRSF7Q16629 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.622e-6■■■■□ 22.3
SRSF7Q16629 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.667e-7■■■■□ 22.3
SRSF7Q16629 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.667e-7■■■■□ 22.3
SRSF7Q16629 SLC7A1-201ENST00000380752 7347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.87e-7■■■■□ 22.3
SRSF7Q16629 BCAT1-201ENST00000261192 9674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.927e-7■■■■□ 22.3
SRSF7Q16629 RNF43-203ENST00000577716 4367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.957e-7■■■■□ 22.3
SRSF7Q16629 RNF43-207ENST00000583753 3560 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.017e-7■■■■□ 22.3
SRSF7Q16629 RNASET2-205ENST00000467705 524 ntTSL 58.46□□□□□ -1.067e-7■■■■□ 22.3
SRSF7Q16629 BCAT1-202ENST00000342945 4319 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.337e-7■■■■□ 22.3
SRSF7Q16629 AC015802.4-201ENST00000589963 578 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.347e-7■■■■□ 22.3
SRSF7Q16629 BCAT1-206ENST00000539780 1360 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.357e-7■■■■□ 22.3
SRSF7Q16629 TGFBR3-210ENST00000533089 6455 ntTSL 1 (best)5.9□□□□□ -1.472e-6■■■■□ 22.3
SRSF7Q16629 TGFBR3-202ENST00000370399 4550 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.472e-6■■■■□ 22.3
SRSF7Q16629 TGFBR3-209ENST00000532540 3913 ntTSL 1 (best)5.63□□□□□ -1.512e-6■■■■□ 22.3
SRSF7Q16629 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.512e-6■■■■□ 22.3
SRSF7Q16629 BCAT1-203ENST00000355164 521 ntTSL 25.18□□□□□ -1.587e-7■■■■□ 22.3
SRSF7Q16629 BCAT1-209ENST00000546285 549 ntTSL 43.67□□□□□ -1.827e-7■■■■□ 22.3
SRSF7Q16629 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.471e-6■■■■□ 22.3
SRSF7Q16629 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.51e-6■■■■□ 22.3
SRSF7Q16629 CELF1-204ENST00000395290 7666 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.851e-6■■■■□ 22.3
SRSF7Q16629 CELF1-203ENST00000361904 1580 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.061e-6■■■■□ 22.3
SRSF7Q16629 CELF1-205ENST00000395292 2191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.181e-6■■■■□ 22.3
SRSF7Q16629 CELF1-215ENST00000532048 3044 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.251e-6■■■■□ 22.3
SRSF7Q16629 CELF1-202ENST00000358597 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.291e-6■■■■□ 22.3
SRSF7Q16629 CELF1-207ENST00000524648 393 ntTSL 26.77□□□□□ -1.331e-6■■■■□ 22.3
SRSF7Q16629 CELF1-220ENST00000539455 800 ntTSL 54.4□□□□□ -1.711e-6■■■■□ 22.3
SRSF7Q16629 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.258e-7■■■■□ 22.2
SRSF7Q16629 RXRA-203ENST00000484822 5215 ntTSL 212.39□□□□□ -0.438e-7■■■■□ 22.2
SRSF7Q16629 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC11.94□□□□□ -0.55e-36■■■■□ 22.2
SRSF7Q16629 ACSM3-203ENST00000501740 839 ntTSL 510.84□□□□□ -0.673e-8■■■■□ 22.1
SRSF7Q16629 ACSM3-213ENST00000568235 558 ntTSL 49.37□□□□□ -0.913e-8■■■■□ 22.1
SRSF7Q16629 ACSM3-205ENST00000561584 561 ntTSL 49.06□□□□□ -0.963e-8■■■■□ 22.1
SRSF7Q16629 ANKRD11-204ENST00000378332 1982 ntTSL 217.81■□□□□ 0.445e-7■■■■□ 22
SRSF7Q16629 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.385e-7■■■■□ 22
SRSF7Q16629 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.615e-7■■■■□ 22
SRSF7Q16629 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.615e-7■■■■□ 22
SRSF7Q16629 DYRK1A-207ENST00000462274 1189 ntTSL 1 (best)19.63■□□□□ 0.734e-8■■■■□ 22
SRSF7Q16629 PDXK-206ENST00000398085 796 ntTSL 316.83■□□□□ 0.281e-6■■■■□ 22
SRSF7Q16629 DYRK1A-209ENST00000608928 483 ntTSL 516.61■□□□□ 0.254e-8■■■■□ 22
SRSF7Q16629 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.561e-6■■■■□ 22
SRSF7Q16629 PDXK-201ENST00000291565 7366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.811e-6■■■■□ 22
SRSF7Q16629 RERE-213ENST00000480342 2710 ntTSL 28.35□□□□□ -1.076e-7■■■■□ 22
SRSF7Q16629 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.388e-10■■■■□ 21.9
SRSF7Q16629 CPSF6-201ENST00000266679 2229 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.658e-10■■■■□ 21.9
SRSF7Q16629 CPSF6-202ENST00000435070 6616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.428e-10■■■■□ 21.9
SRSF7Q16629 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.058e-10■■■■□ 21.9
SRSF7Q16629 ZMYND8-202ENST00000311275 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.974e-6■■■■□ 21.8
SRSF7Q16629 ZMYND8-217ENST00000536340 5273 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.034e-6■■■■□ 21.8
SRSF7Q16629 ZMYND8-205ENST00000360911 4991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.034e-6■■■■□ 21.8
SRSF7Q16629 ZMYND8-220ENST00000617418 3411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.074e-6■■■■□ 21.8
SRSF7Q16629 ZMYND8-214ENST00000467200 3634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)8.08□□□□□ -1.124e-6■■■■□ 21.8
SRSF7Q16629 ZMYND8-204ENST00000355972 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.134e-6■■■■□ 21.8
SRSF7Q16629 ZMYND8-213ENST00000461685 3567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.24e-6■■■■□ 21.8
SRSF7Q16629 ZMYND8-212ENST00000458360 3729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.224e-6■■■■□ 21.8
SRSF7Q16629 ZMYND8-218ENST00000540497 3405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.234e-6■■■■□ 21.8
SRSF7Q16629 ZMYND8-219ENST00000611941 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.244e-6■■■■□ 21.8
SRSF7Q16629 ZMYND8-203ENST00000352431 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.254e-6■■■■□ 21.8
SRSF7Q16629 ZMYND8-207ENST00000396281 5511 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.274e-6■■■■□ 21.8
SRSF7Q16629 ZMYND8-201ENST00000262975 4139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.294e-6■■■■□ 21.8
SRSF7Q16629 AKR1C1-202ENST00000380872 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.331e-6■■■■□ 21.8
SRSF7Q16629 ZMYND8-206ENST00000372023 5144 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.344e-6■■■■□ 21.8
SRSF7Q16629 ZMYND8-221ENST00000619049 4027 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.354e-6■■■■□ 21.8
SRSF7Q16629 ZMYND8-216ENST00000471951 4053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.374e-6■■■■□ 21.8
SRSF7Q16629 ZMYND8-211ENST00000446994 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.414e-6■■■■□ 21.8
SRSF7Q16629 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.631e-6■■■■□ 21.8
SRSF7Q16629 RBMX-204ENST00000464781 1852 ntTSL 211.93□□□□□ -0.51e-6■■■■□ 21.8
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