Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZFHX3Q15911 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZFHX3Q15911 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZFHX3Q15911 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZFHX3Q15911 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZFHX3Q15911 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZFHX3Q15911 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZFHX3Q15911 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ZFHX3Q15911 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZFHX3Q15911 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZFHX3Q15911 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZFHX3Q15911 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZFHX3Q15911 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ZFHX3Q15911 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZFHX3Q15911 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZFHX3Q15911 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ZFHX3Q15911 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ZFHX3Q15911 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZFHX3Q15911 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZFHX3Q15911 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ZFHX3Q15911 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZFHX3Q15911 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZFHX3Q15911 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZFHX3Q15911 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZFHX3Q15911 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZFHX3Q15911 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZFHX3Q15911 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZFHX3Q15911 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ZFHX3Q15911 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZFHX3Q15911 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZFHX3Q15911 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ZFHX3Q15911 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZFHX3Q15911 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZFHX3Q15911 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ZFHX3Q15911 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZFHX3Q15911 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZFHX3Q15911 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZFHX3Q15911 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZFHX3Q15911 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZFHX3Q15911 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZFHX3Q15911 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZFHX3Q15911 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZFHX3Q15911 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZFHX3Q15911 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZFHX3Q15911 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZFHX3Q15911 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZFHX3Q15911 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ZFHX3Q15911 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ZFHX3Q15911 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZFHX3Q15911 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZFHX3Q15911 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZFHX3Q15911 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZFHX3Q15911 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZFHX3Q15911 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZFHX3Q15911 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZFHX3Q15911 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZFHX3Q15911 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ZFHX3Q15911 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ZFHX3Q15911 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZFHX3Q15911 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZFHX3Q15911 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ZFHX3Q15911 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZFHX3Q15911 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZFHX3Q15911 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZFHX3Q15911 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZFHX3Q15911 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZFHX3Q15911 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZFHX3Q15911 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZFHX3Q15911 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZFHX3Q15911 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZFHX3Q15911 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZFHX3Q15911 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZFHX3Q15911 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZFHX3Q15911 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ZFHX3Q15911 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZFHX3Q15911 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
ZFHX3Q15911 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZFHX3Q15911 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZFHX3Q15911 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ZFHX3Q15911 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ZFHX3Q15911 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZFHX3Q15911 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZFHX3Q15911 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZFHX3Q15911 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZFHX3Q15911 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ZFHX3Q15911 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZFHX3Q15911 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZFHX3Q15911 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ZFHX3Q15911 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZFHX3Q15911 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZFHX3Q15911 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ZFHX3Q15911 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZFHX3Q15911 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZFHX3Q15911 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZFHX3Q15911 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZFHX3Q15911 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZFHX3Q15911 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZFHX3Q15911 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ZFHX3Q15911 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZFHX3Q15911 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms