Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
BECN1Q14457 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
BECN1Q14457 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
BECN1Q14457 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
BECN1Q14457 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
BECN1Q14457 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
BECN1Q14457 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
BECN1Q14457 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
BECN1Q14457 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
BECN1Q14457 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
BECN1Q14457 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
BECN1Q14457 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
BECN1Q14457 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
BECN1Q14457 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
BECN1Q14457 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
BECN1Q14457 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
BECN1Q14457 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
BECN1Q14457 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
BECN1Q14457 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
BECN1Q14457 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
BECN1Q14457 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
BECN1Q14457 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
BECN1Q14457 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
BECN1Q14457 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
BECN1Q14457 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
BECN1Q14457 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
BECN1Q14457 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
BECN1Q14457 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
BECN1Q14457 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
BECN1Q14457 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
BECN1Q14457 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
BECN1Q14457 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
BECN1Q14457 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
BECN1Q14457 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
BECN1Q14457 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
BECN1Q14457 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
BECN1Q14457 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
BECN1Q14457 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
BECN1Q14457 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
BECN1Q14457 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
BECN1Q14457 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
BECN1Q14457 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
BECN1Q14457 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
BECN1Q14457 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
BECN1Q14457 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
BECN1Q14457 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
BECN1Q14457 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
BECN1Q14457 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
BECN1Q14457 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
BECN1Q14457 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
BECN1Q14457 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
BECN1Q14457 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
BECN1Q14457 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
BECN1Q14457 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
BECN1Q14457 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
BECN1Q14457 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
BECN1Q14457 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
BECN1Q14457 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
BECN1Q14457 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
BECN1Q14457 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
BECN1Q14457 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
BECN1Q14457 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BECN1Q14457 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BECN1Q14457 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
BECN1Q14457 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
BECN1Q14457 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
BECN1Q14457 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
BECN1Q14457 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BECN1Q14457 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BECN1Q14457 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BECN1Q14457 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
BECN1Q14457 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
BECN1Q14457 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
BECN1Q14457 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
BECN1Q14457 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
BECN1Q14457 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
BECN1Q14457 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
BECN1Q14457 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
BECN1Q14457 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
BECN1Q14457 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
BECN1Q14457 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
BECN1Q14457 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
BECN1Q14457 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
BECN1Q14457 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
BECN1Q14457 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
BECN1Q14457 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
BECN1Q14457 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
BECN1Q14457 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
BECN1Q14457 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
BECN1Q14457 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
BECN1Q14457 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
BECN1Q14457 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
BECN1Q14457 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
BECN1Q14457 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
BECN1Q14457 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
BECN1Q14457 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
BECN1Q14457 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
BECN1Q14457 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BECN1Q14457 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BECN1Q14457 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
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